More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0803 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4359  1A family penicillin-binding protein  54.34 
 
 
810 aa  868    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6049  penicillin-binding protein, 1A family  54.04 
 
 
805 aa  889    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1171  penicillin-binding protein  45.39 
 
 
840 aa  662    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0742026  normal  0.682279 
 
 
-
 
NC_004310  BR0916  penicillin-binding protein 1A, putative  62.21 
 
 
819 aa  1059    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1816  1A family penicillin-binding protein  44.21 
 
 
845 aa  674    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0319957 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1797  penicillin-binding protein 1a  59.25 
 
 
818 aa  986    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0727  penicillin-binding protein, 1A family  55.03 
 
 
804 aa  921    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0960  1A family penicillin-binding protein  61.77 
 
 
817 aa  1002    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0340726 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4201  putative membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  53.34 
 
 
835 aa  887    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603081  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4669  1A family penicillin-binding protein  54.19 
 
 
804 aa  918    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1716  penicillin-binding protein 1A  53.7 
 
 
831 aa  890    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0706575  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2574  1A family penicillin-binding protein  45.69 
 
 
791 aa  648    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.95541 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0911  putative penicillin-binding protein 1A  62.21 
 
 
819 aa  1056    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.477143  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2730  penicillin-binding protein, 1A family  54.99 
 
 
832 aa  881    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2978  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a)  45.89 
 
 
849 aa  658    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0803  penicillin-binding protein, 1A  100 
 
 
823 aa  1703    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2147  penicillin-binding protein 1A  53.12 
 
 
831 aa  824    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.173589  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3276  1A family penicillin-binding protein  51.33 
 
 
908 aa  779    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.658356  normal  0.980736 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1304  penicillin-binding protein, 1A family  59.15 
 
 
819 aa  991    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0651627 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3007  penicillin-binding protein 1A  55.6 
 
 
830 aa  886    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.160235 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2534  penicillin-binding protein 1A  45.35 
 
 
854 aa  700    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.175244 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1395  penicillin-binding protein, 1A family  60.02 
 
 
809 aa  996    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47778  normal  0.639288 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2852  penicillin-binding protein 1A  54.78 
 
 
830 aa  884    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456684  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0934  1A family penicillin-binding protein  55.46 
 
 
803 aa  923    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.305447  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2444  penicillin-binding protein 1A  56.45 
 
 
830 aa  902    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257563  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1824  penicillin-binding protein 1A  54.68 
 
 
843 aa  896    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0792156  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1857  1A family penicillin-binding protein  46.02 
 
 
849 aa  671    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.874221 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0867  penicillin-binding protein 1A  45.09 
 
 
835 aa  650    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.371617  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2266  1A family penicillin-binding protein  62.26 
 
 
819 aa  1064    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1708  1A family penicillin-binding protein  59.59 
 
 
818 aa  997    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1624  1A family penicillin-binding protein  45.89 
 
 
849 aa  657    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521017  normal  0.641281 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5843  1A family penicillin-binding protein  55.22 
 
 
808 aa  889    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.36925  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3955  penicillin-binding protein, 1A family  54.94 
 
 
805 aa  883    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.755336 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3662  1A family penicillin-binding protein  54.94 
 
 
833 aa  884    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1298  1A family penicillin-binding protein  51.47 
 
 
833 aa  771    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.144183  normal  0.788784 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3949  penicillin-binding protein, 1A family  55.36 
 
 
805 aa  880    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.665129 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3846  1A family penicillin-binding protein  44.01 
 
 
824 aa  608  1e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2316  peptidoglycan glycosyltransferase  40.69 
 
 
844 aa  573  1.0000000000000001e-162  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.067837  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3176  glycosyl transferase family protein  42.03 
 
 
838 aa  575  1.0000000000000001e-162  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.632903 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2321  1A family penicillin-binding protein  40.51 
 
 
862 aa  564  1.0000000000000001e-159  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.10527  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2085  penicillin-binding protein, 1A family  41.05 
 
 
904 aa  548  1e-154  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.535891  normal  0.507146 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1687  1A family penicillin-binding protein  40.42 
 
 
875 aa  543  1e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.983861  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  40.96 
 
 
797 aa  534  1e-150  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  39.22 
 
 
841 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3133  1A family penicillin-binding protein  38.92 
 
 
796 aa  510  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  38.81 
 
 
773 aa  510  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  38.85 
 
 
818 aa  512  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2326  1A family penicillin-binding protein  37.81 
 
 
807 aa  503  1e-141  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.774073  unclonable  0.0000291309 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  38.12 
 
 
818 aa  500  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  38.91 
 
 
793 aa  501  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  37.07 
 
 
829 aa  500  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  37.89 
 
 
827 aa  502  1e-140  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  38.42 
 
 
795 aa  499  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  39.86 
 
 
830 aa  498  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2534  1A family penicillin-binding protein  37.5 
 
 
804 aa  490  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.401637  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  36.53 
 
 
800 aa  492  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  36.89 
 
 
803 aa  488  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  37.08 
 
 
777 aa  483  1e-135  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  37.81 
 
 
791 aa  481  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0780  penicillin-binding protein 1A  38.04 
 
 
804 aa  479  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0246  penicillin-binding protein 1A  35.89 
 
 
814 aa  476  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  35.45 
 
 
802 aa  477  1e-133  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2630  penicillin-binding protein, 1A family  36.57 
 
 
807 aa  474  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  37.48 
 
 
804 aa  475  1e-132  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  34.95 
 
 
817 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3215  penicillin-binding protein, 1A family  37.6 
 
 
778 aa  474  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0354  putative penicillin-binding 1 (peptoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  37.29 
 
 
799 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1936  penicillin-binding protein, 1A family  37.08 
 
 
790 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0825  1A family penicillin-binding protein  36.5 
 
 
846 aa  467  9.999999999999999e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397118  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0381  1A family penicillin-binding protein  34.78 
 
 
817 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.31 
 
 
817 aa  468  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  36.08 
 
 
796 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0404  penicillin-binding protein 1A  35.64 
 
 
815 aa  469  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0818527  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3603  penicillin-binding protein, 1A family  37.04 
 
 
799 aa  469  9.999999999999999e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00689676  hitchhiker  0.000000108854 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0671  1A family penicillin-binding protein  36.54 
 
 
805 aa  467  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.152404 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5084  penicillin-binding protein, 1A family  34.3 
 
 
817 aa  465  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.846696  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5133  penicillin-binding protein  35.19 
 
 
814 aa  463  1e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0554788  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  34.98 
 
 
794 aa  463  1e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  37.96 
 
 
792 aa  462  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  38.83 
 
 
766 aa  462  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4957  1A family penicillin-binding protein  34.3 
 
 
817 aa  465  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0387  1A family penicillin-binding protein  37.34 
 
 
797 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495893  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2976  penicillin-binding 1 transmembrane protein  37.75 
 
 
801 aa  462  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.893289  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  35.83 
 
 
794 aa  462  9.999999999999999e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0402  peptidoglycan glycosyltransferase  34.44 
 
 
814 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.527889  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0024  penicillin-binding protein, 1A family  39.39 
 
 
802 aa  460  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0315  1A family penicillin-binding protein  37.07 
 
 
795 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.640379 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0366  1A family penicillin-binding protein  37.07 
 
 
797 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.941804  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2907  penicillin-binding protein, 1A family  37.58 
 
 
777 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0114663 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2720  penicillin-binding protein 1A  37.7 
 
 
797 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3254  penicillin-binding protein, 1A family  37.58 
 
 
777 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0272171  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0290  1A family penicillin-binding protein  37.38 
 
 
797 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308967  normal  0.891054 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0306  1A family penicillin-binding protein  37.33 
 
 
797 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3486  penicillin-binding protein 1A  36.54 
 
 
796 aa  456  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4271  peptidoglycan glycosyltransferase  33.69 
 
 
843 aa  456  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  37.53 
 
 
791 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2253  1A family penicillin-binding protein  37.21 
 
 
803 aa  455  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.816825  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3114  peptidoglycan glycosyltransferase  38.03 
 
 
793 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.183749 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0157  penicillin-binding protein, 1A family protein  34.2 
 
 
851 aa  455  1.0000000000000001e-126  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  36.56 
 
 
797 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>