More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4435 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4435  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 		 838 aa  1682    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  38.35 
 
 		 818 aa  514  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2534  1A family penicillin-binding protein  39.83 
 
 		 804 aa  496  1e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.401637  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3133  1A family penicillin-binding protein  39.41 
 
 		 796 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2630  penicillin-binding protein, 1A family  38.73 
 
 		 807 aa  489  1e-137  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2326  1A family penicillin-binding protein  39.21 
 
 		 807 aa  487  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.774073  unclonable  0.0000291309 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  38.87 
 
 		 797 aa  488  1e-136  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  38.12 
 
 		 841 aa  489  1e-136  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  38.72 
 
 		 818 aa  488  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  38.69 
 
 		 773 aa  483  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  37.55 
 
 		 827 aa  486  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  37.47 
 
 		 829 aa  484  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3124  penicillin-binding protein 1A  39.61 
 
 		 807 aa  482  1e-134  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  39.04 
 
 		 802 aa  482  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  37.07 
 
 		 795 aa  474  1e-132  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3405  1A family penicillin-binding protein  37.86 
 
 		 857 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0379347  normal  0.659287 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3215  penicillin-binding protein, 1A family  39.09 
 
 		 778 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0911  putative penicillin-binding protein 1A  37.18 
 
 		 819 aa  450  1e-125  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.477143  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  37.1 
 
 		 793 aa  451  1e-125  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4201  putative membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  35.3 
 
 		 835 aa  450  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603081  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2266  1A family penicillin-binding protein  37.19 
 
 		 819 aa  452  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2321  1A family penicillin-binding protein  37.12 
 
 		 862 aa  451  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.10527  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_004310  BR0916  penicillin-binding protein 1A, putative  36.93 
 
 		 819 aa  447  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2147  penicillin-binding protein 1A  37.97 
 
 		 831 aa  444  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.173589  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1716  penicillin-binding protein 1A  34.99 
 
 		 831 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0706575  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0057  penicillin-binding protein 1A  37.77 
 
 		 852 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0074  penicillin-binding protein, 1A family  37.96 
 
 		 852 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0060  1A family penicillin-binding protein  36.12 
 
 		 852 aa  439  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.133649 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0062  penicillin-binding protein, 1A family  37.77 
 
 		 852 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  36.18 
 
 		 830 aa  433  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  35.04 
 
 		 777 aa  434  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3007  penicillin-binding protein 1A  35.65 
 
 		 830 aa  433  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.160235 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0960  1A family penicillin-binding protein  36.35 
 
 		 817 aa  435  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0340726 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2444  penicillin-binding protein 1A  35.62 
 
 		 830 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1824  penicillin-binding protein 1A  35.33 
 
 		 843 aa  434  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0792156  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1708  1A family penicillin-binding protein  35.87 
 
 		 818 aa  433  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2978  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a)  37.21 
 
 		 849 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0727  penicillin-binding protein, 1A family  35.82 
 
 		 804 aa  430  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2730  penicillin-binding protein, 1A family  35.52 
 
 		 832 aa  432  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1624  1A family penicillin-binding protein  37.08 
 
 		 849 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521017  normal  0.641281 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1395  penicillin-binding protein, 1A family  35.83 
 
 		 809 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47778  normal  0.639288 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1298  1A family penicillin-binding protein  35.56 
 
 		 833 aa  427  1e-118  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.144183  normal  0.788784 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1304  penicillin-binding protein, 1A family  36.4 
 
 		 819 aa  424  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0651627 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2852  penicillin-binding protein 1A  34.31 
 
 		 830 aa  425  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  36.92 
 
 		 796 aa  421  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0934  1A family penicillin-binding protein  35.07 
 
 		 803 aa  420  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.305447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1797  penicillin-binding protein 1a  35.56 
 
 		 818 aa  422  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1857  1A family penicillin-binding protein  36.74 
 
 		 849 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.874221 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4669  1A family penicillin-binding protein  35.92 
 
 		 804 aa  421  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  37.45 
 
 		 766 aa  417  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  34.62 
 
 		 794 aa  417  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  34.49 
 
 		 794 aa  418  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  37.47 
 
 		 791 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1171  penicillin-binding protein  36.39 
 
 		 840 aa  417  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0742026  normal  0.682279 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  36.94 
 
 		 792 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  35.11 
 
 		 803 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2574  1A family penicillin-binding protein  36.78 
 
 		 791 aa  417  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.95541 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.2 
 
 		 817 aa  414  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1918  penicillin-binding protein, 1A family  34.75 
 
 		 812 aa  415  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.176585  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0246  penicillin-binding protein 1A  34.79 
 
 		 814 aa  416  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  34.54 
 
 		 804 aa  415  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4359  1A family penicillin-binding protein  36 
 
 		 810 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0088  penicillin-binding protein, 1A family  36.02 
 
 		 778 aa  410  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0128257 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  36.36 
 
 		 779 aa  410  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2253  1A family penicillin-binding protein  36.91 
 
 		 803 aa  410  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.816825  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  36.23 
 
 		 794 aa  409  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0867  penicillin-binding protein 1A  35.76 
 
 		 835 aa  409  1e-113  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.371617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6131  penicillin-binding protein 1A  35.78 
 
 		 839 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353845  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1972  1A family penicillin-binding protein  35.78 
 
 		 839 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125323  normal  0.0456782 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1948  1A family penicillin-binding protein  35.78 
 
 		 839 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135129  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3276  1A family penicillin-binding protein  34.8 
 
 		 908 aa  409  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.658356  normal  0.980736 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0671  1A family penicillin-binding protein  35.49 
 
 		 805 aa  408  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.152404 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1862  1A family penicillin-binding protein  35.69 
 
 		 839 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.000000145704  hitchhiker  0.0000925337 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0092  1A family penicillin-binding protein  36.5 
 
 		 778 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000436892  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2534  penicillin-binding protein 1A  36.41 
 
 		 854 aa  408  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.175244 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0780  penicillin-binding protein 1A  36.06 
 
 		 804 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4121  1A family penicillin-binding protein  34.13 
 
 		 814 aa  409  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.739203  hitchhiker  0.00000203551 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2296  penicillin-binding protein, 1A family  35.71 
 
 		 833 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  35.82 
 
 		 800 aa  407  1.0000000000000001e-112  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3201  1A family penicillin-binding protein  35.92 
 
 		 797 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  33.9 
 
 		 817 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5133  penicillin-binding protein  32.96 
 
 		 814 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0554788  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2752  1A family penicillin-binding protein  35.92 
 
 		 797 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0402  peptidoglycan glycosyltransferase  33.5 
 
 		 814 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.527889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3763  1A family penicillin-binding protein  35.92 
 
 		 797 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.763292  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3734  1A family penicillin-binding protein  35.92 
 
 		 797 aa  405  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0404  penicillin-binding protein 1A  34.8 
 
 		 815 aa  404  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0818527  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3486  penicillin-binding protein 1A  35.9 
 
 		 796 aa  405  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3603  penicillin-binding protein, 1A family  35.9 
 
 		 799 aa  405  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00689676  hitchhiker  0.000000108854 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0354  putative penicillin-binding 1 (peptoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  35.78 
 
 		 799 aa  405  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1961  putative penicillin-binding (peptidoglycan synthetase) transmembrane protein, mrcA  35.39 
 
 		 836 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.935067  normal  0.0226413 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1935  1A family penicillin-binding protein  35.78 
 
 		 839 aa  405  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000247834  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3705  1A family penicillin-binding protein  35.92 
 
 		 797 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0366  1A family penicillin-binding protein  36.04 
 
 		 797 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.941804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1268  1A family penicillin-binding protein  36.19 
 
 		 786 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00608444  normal  0.905221 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5582  1A family penicillin-binding protein  34.93 
 
 		 824 aa  399  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3029  1A family penicillin-binding protein  35.51 
 
 		 797 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1752  1A family penicillin-binding protein  36.14 
 
 		 770 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3949  penicillin-binding protein, 1A family  34.54 
 
 		 805 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.665129 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0387  1A family penicillin-binding protein  35.72 
 
 		 797 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>