More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3215 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2326  1A family penicillin-binding protein  54.02 
 
 		 807 aa  849    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.774073  unclonable  0.0000291309 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  62.62 
 
 		 802 aa  960    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3124  penicillin-binding protein 1A  54.17 
 
 		 807 aa  844    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1918  penicillin-binding protein, 1A family  48.25 
 
 		 812 aa  704    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.176585  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2630  penicillin-binding protein, 1A family  55.57 
 
 		 807 aa  875    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3215  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 		 778 aa  1577    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2534  1A family penicillin-binding protein  43.7 
 
 		 804 aa  625  1e-177  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.401637  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  44.36 
 
 		 818 aa  610  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  45.29 
 
 		 795 aa  604  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3133  1A family penicillin-binding protein  43.46 
 
 		 796 aa  597  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  43.21 
 
 		 797 aa  595  1e-168  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  42.96 
 
 		 841 aa  588  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2321  1A family penicillin-binding protein  43.86 
 
 		 862 aa  590  1e-167  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.10527  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  41.5 
 
 		 827 aa  587  1e-166  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  44.33 
 
 		 773 aa  587  1e-166  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  43.11 
 
 		 818 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  40.98 
 
 		 829 aa  580  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0727  penicillin-binding protein, 1A family  41.49 
 
 		 804 aa  569  1e-161  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1716  penicillin-binding protein 1A  41.27 
 
 		 831 aa  568  1e-160  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0706575  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4669  1A family penicillin-binding protein  40.33 
 
 		 804 aa  562  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1824  penicillin-binding protein 1A  40.57 
 
 		 843 aa  559  1e-158  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0792156  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2147  penicillin-binding protein 1A  40.89 
 
 		 831 aa  550  1e-155  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.173589  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4201  putative membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  40.58 
 
 		 835 aa  551  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603081  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0060  1A family penicillin-binding protein  41.18 
 
 		 852 aa  548  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.133649 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3276  1A family penicillin-binding protein  40.95 
 
 		 908 aa  546  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.658356  normal  0.980736 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2444  penicillin-binding protein 1A  40.26 
 
 		 830 aa  543  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2266  1A family penicillin-binding protein  38.71 
 
 		 819 aa  539  9.999999999999999e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0916  penicillin-binding protein 1A, putative  38.73 
 
 		 819 aa  538  1e-151  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0911  putative penicillin-binding protein 1A  38.61 
 
 		 819 aa  538  1e-151  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.477143  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2852  penicillin-binding protein 1A  40.57 
 
 		 830 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1708  1A family penicillin-binding protein  38.43 
 
 		 818 aa  538  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1395  penicillin-binding protein, 1A family  37.69 
 
 		 809 aa  534  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47778  normal  0.639288 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0062  penicillin-binding protein, 1A family  40.49 
 
 		 852 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0246  penicillin-binding protein 1A  39.7 
 
 		 814 aa  535  1e-150  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0057  penicillin-binding protein 1A  40.75 
 
 		 852 aa  532  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1304  penicillin-binding protein, 1A family  38.1 
 
 		 819 aa  532  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0651627 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2730  penicillin-binding protein, 1A family  40.64 
 
 		 832 aa  535  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0934  1A family penicillin-binding protein  39.34 
 
 		 803 aa  532  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.305447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3007  penicillin-binding protein 1A  40.87 
 
 		 830 aa  532  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.160235 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0074  penicillin-binding protein, 1A family  40.75 
 
 		 852 aa  531  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3405  1A family penicillin-binding protein  40.59 
 
 		 857 aa  519  1e-146  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0379347  normal  0.659287 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4359  1A family penicillin-binding protein  38.24 
 
 		 810 aa  515  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1298  1A family penicillin-binding protein  38.94 
 
 		 833 aa  513  1e-144  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.144183  normal  0.788784 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0960  1A family penicillin-binding protein  39.63 
 
 		 817 aa  512  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0340726 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0402  peptidoglycan glycosyltransferase  38.34 
 
 		 814 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.527889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2574  1A family penicillin-binding protein  40.36 
 
 		 791 aa  508  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.95541 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1797  penicillin-binding protein 1a  37.09 
 
 		 818 aa  506  9.999999999999999e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5843  1A family penicillin-binding protein  38.77 
 
 		 808 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.36925  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3949  penicillin-binding protein, 1A family  38.18 
 
 		 805 aa  502  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.665129 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  39.67 
 
 		 804 aa  504  1e-141  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  39.84 
 
 		 777 aa  503  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6049  penicillin-binding protein, 1A family  37.94 
 
 		 805 aa  502  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  38.77 
 
 		 823 aa  501  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5133  penicillin-binding protein  38.1 
 
 		 814 aa  501  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0554788  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0825  1A family penicillin-binding protein  37.5 
 
 		 846 aa  501  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397118  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  41.32 
 
 		 800 aa  500  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  38.89 
 
 		 823 aa  501  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  38.6 
 
 		 830 aa  498  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  39.1 
 
 		 803 aa  497  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.49 
 
 		 817 aa  496  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3955  penicillin-binding protein, 1A family  37.44 
 
 		 805 aa  498  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.755336 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  39.19 
 
 		 791 aa  497  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0381  1A family penicillin-binding protein  38.37 
 
 		 817 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3662  1A family penicillin-binding protein  37.44 
 
 		 833 aa  499  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5084  penicillin-binding protein, 1A family  38.58 
 
 		 817 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.846696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  39.83 
 
 		 793 aa  494  9.999999999999999e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  38.46 
 
 		 817 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0404  penicillin-binding protein 1A  37.96 
 
 		 815 aa  492  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0818527  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4957  1A family penicillin-binding protein  38.58 
 
 		 817 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2091  penicillin-binding protein 1A  38.92 
 
 		 793 aa  491  1e-137  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0803  penicillin-binding protein, 1A  37.6 
 
 		 823 aa  491  1e-137  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0118  multimodular transpeptidase-transglycosylase PBP 1A  38.42 
 
 		 793 aa  488  1e-136  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45310  Penicillin binding protein 1A  37.67 
 
 		 819 aa  484  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4121  1A family penicillin-binding protein  36.82 
 
 		 814 aa  484  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.739203  hitchhiker  0.00000203551 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3486  penicillin-binding protein 1A  38.11 
 
 		 796 aa  480  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3394  penicillin-binding protein, 1A family  39.39 
 
 		 808 aa  481  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.145767  normal  0.859795 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4435  penicillin-binding protein, 1A family  39.09 
 
 		 838 aa  478  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2907  penicillin-binding protein, 1A family  38.22 
 
 		 777 aa  477  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0114663 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0290  1A family penicillin-binding protein  38.57 
 
 		 797 aa  477  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308967  normal  0.891054 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3603  penicillin-binding protein, 1A family  38.98 
 
 		 799 aa  477  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00689676  hitchhiker  0.000000108854 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0354  putative penicillin-binding 1 (peptoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  38.4 
 
 		 799 aa  478  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0366  1A family penicillin-binding protein  38.57 
 
 		 797 aa  478  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.941804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0387  1A family penicillin-binding protein  38.43 
 
 		 797 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495893  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3254  penicillin-binding protein, 1A family  38.22 
 
 		 777 aa  477  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0272171  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  36.33 
 
 		 794 aa  474  1e-132  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0209  penicillin-binding protein 1A  37.82 
 
 		 771 aa  474  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  38.72 
 
 		 791 aa  475  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0315  1A family penicillin-binding protein  38.29 
 
 		 795 aa  472  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.640379 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0780  penicillin-binding protein 1A  38.04 
 
 		 804 aa  473  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  38.42 
 
 		 792 aa  475  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2720  penicillin-binding protein 1A  38.29 
 
 		 797 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  40.06 
 
 		 794 aa  473  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  38.62 
 
 		 796 aa  473  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  36.33 
 
 		 794 aa  472  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3763  1A family penicillin-binding protein  38.78 
 
 		 797 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.763292  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3241  penicillin-binding protein, 1A family  38.81 
 
 		 807 aa  469  1.0000000000000001e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  39.92 
 
 		 779 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1171  penicillin-binding protein  37.67 
 
 		 840 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0742026  normal  0.682279 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0306  1A family penicillin-binding protein  38.29 
 
 		 797 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3734  1A family penicillin-binding protein  38.64 
 
 		 797 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>