More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0088 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1972  1A family penicillin-binding protein  55.65 
 
 		 839 aa  838    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125323  normal  0.0456782 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0088  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 		 778 aa  1597    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0128257 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  58.87 
 
 		 797 aa  865    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2976  penicillin-binding 1 transmembrane protein  62.64 
 
 		 801 aa  963    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.893289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  58.25 
 
 		 796 aa  900    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0290  1A family penicillin-binding protein  58.02 
 
 		 797 aa  892    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308967  normal  0.891054 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1321  1A family penicillin-binding protein  55.1 
 
 		 837 aa  835    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000393559 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3603  penicillin-binding protein, 1A family  57.72 
 
 		 799 aa  898    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00689676  hitchhiker  0.000000108854 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1497  1A family penicillin-binding protein  54.55 
 
 		 846 aa  840    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178558  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2752  1A family penicillin-binding protein  57.4 
 
 		 797 aa  865    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3114  peptidoglycan glycosyltransferase  55.54 
 
 		 793 aa  843    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.183749 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0024  penicillin-binding protein, 1A family  54.15 
 
 		 802 aa  806    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0209  penicillin-binding protein 1A  55.88 
 
 		 771 aa  830    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1016  penicillin-binding protein 1A  54.16 
 
 		 778 aa  791    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0671  1A family penicillin-binding protein  54.44 
 
 		 805 aa  865    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.152404 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  62.86 
 
 		 791 aa  974    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1268  1A family penicillin-binding protein  54.55 
 
 		 840 aa  841    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  56.24 
 
 		 793 aa  792    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2518  1A family penicillin-binding protein  54.68 
 
 		 840 aa  836    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.316382  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3734  1A family penicillin-binding protein  57.26 
 
 		 797 aa  862    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  55.68 
 
 		 779 aa  849    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2296  penicillin-binding protein, 1A family  55.05 
 
 		 833 aa  845    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3486  penicillin-binding protein 1A  58.52 
 
 		 796 aa  894    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5259  penicillin-binding protein 1A  55.85 
 
 		 838 aa  837    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000072806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1752  1A family penicillin-binding protein  57.54 
 
 		 770 aa  863    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2369  1A family penicillin-binding protein  54.68 
 
 		 852 aa  842    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2802  1A family penicillin-binding protein  57.26 
 
 		 797 aa  864    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.437708  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5582  1A family penicillin-binding protein  54.26 
 
 		 824 aa  835    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2411  1A family penicillin-binding protein  54.68 
 
 		 840 aa  836    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  54.72 
 
 		 777 aa  813    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2082  1A family penicillin-binding protein  55.51 
 
 		 840 aa  842    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3029  1A family penicillin-binding protein  57.73 
 
 		 797 aa  862    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3705  1A family penicillin-binding protein  57.4 
 
 		 797 aa  865    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  55.6 
 
 		 766 aa  838    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0917  penicillin-binding protein 1A  54.44 
 
 		 752 aa  817    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  56.77 
 
 		 797 aa  859    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  54.03 
 
 		 791 aa  796    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0780  penicillin-binding protein 1A  55.45 
 
 		 804 aa  843    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0354  putative penicillin-binding 1 (peptoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  58.24 
 
 		 799 aa  900    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1961  putative penicillin-binding (peptidoglycan synthetase) transmembrane protein, mrcA  55.78 
 
 		 836 aa  848    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.935067  normal  0.0226413 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3254  penicillin-binding protein, 1A family  64.12 
 
 		 777 aa  975    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0272171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0833  penicillin-binding protein, 1A family  51.24 
 
 		 807 aa  723    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0366  1A family penicillin-binding protein  58.65 
 
 		 797 aa  894    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.941804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  63.4 
 
 		 792 aa  983    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3763  1A family penicillin-binding protein  57.26 
 
 		 797 aa  862    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.763292  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0092  1A family penicillin-binding protein  91.26 
 
 		 778 aa  1467    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000436892  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2720  penicillin-binding protein 1A  59.05 
 
 		 797 aa  893    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3314  1A family penicillin-binding protein  54.55 
 
 		 840 aa  841    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.019725  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6131  penicillin-binding protein 1A  55.65 
 
 		 839 aa  837    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353845  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0176  1A family penicillin-binding protein  47.96 
 
 		 776 aa  660    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0315  1A family penicillin-binding protein  57.88 
 
 		 795 aa  891    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.640379 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0023  1A family penicillin-binding protein  55.66 
 
 		 799 aa  843    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1862  1A family penicillin-binding protein  54.83 
 
 		 839 aa  827    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.000000145704  hitchhiker  0.0000925337 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1996  1A family penicillin-binding protein  54.55 
 
 		 840 aa  841    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.704723  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  55.54 
 
 		 794 aa  848    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1139  penicillin-binding protein, 1A family  53.88 
 
 		 774 aa  801    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0388878  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2907  penicillin-binding protein, 1A family  64.12 
 
 		 777 aa  976    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0114663 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1268  1A family penicillin-binding protein  55.92 
 
 		 786 aa  835    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00608444  normal  0.905221 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0306  1A family penicillin-binding protein  58.02 
 
 		 797 aa  890    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1935  1A family penicillin-binding protein  54.83 
 
 		 839 aa  829    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000247834  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3201  1A family penicillin-binding protein  57.4 
 
 		 797 aa  865    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0387  1A family penicillin-binding protein  58.65 
 
 		 797 aa  894    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495893  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1948  1A family penicillin-binding protein  55.65 
 
 		 839 aa  837    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135129  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0246  penicillin-binding protein 1A  43.61 
 
 		 814 aa  624  1e-177  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  43.36 
 
 		 830 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2152  penicillin-binding protein 1A  42.5 
 
 		 773 aa  599  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.431826  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  41.5 
 
 		 794 aa  592  1e-168  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  41.5 
 
 		 794 aa  590  1e-167  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.48 
 
 		 817 aa  586  1e-166  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4121  1A family penicillin-binding protein  41.69 
 
 		 814 aa  586  1e-166  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.739203  hitchhiker  0.00000203551 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  40.85 
 
 		 823 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5084  penicillin-binding protein, 1A family  41.11 
 
 		 817 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.846696  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45310  Penicillin binding protein 1A  40.84 
 
 		 819 aa  574  1.0000000000000001e-162  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0404  penicillin-binding protein 1A  41.12 
 
 		 815 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0818527  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  41.71 
 
 		 804 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  41.67 
 
 		 803 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  40.59 
 
 		 823 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4957  1A family penicillin-binding protein  41.11 
 
 		 817 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0402  peptidoglycan glycosyltransferase  41.95 
 
 		 814 aa  570  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.527889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0381  1A family penicillin-binding protein  41.11 
 
 		 817 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  41.45 
 
 		 817 aa  572  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5133  penicillin-binding protein  41.29 
 
 		 814 aa  568  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0554788  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2692  penicillin-binding protein  39.97 
 
 		 846 aa  565  1.0000000000000001e-159  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000762848  hitchhiker  0.0050562 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0317  penicillin-binding protein, 1A family  39.73 
 
 		 850 aa  559  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0274  penicillin-binding protein, 1A family  40.46 
 
 		 790 aa  560  1e-158  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.565405  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3591  peptidoglycan synthetase  39.98 
 
 		 850 aa  561  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.322941  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1936  penicillin-binding protein, 1A family  42.02 
 
 		 790 aa  561  1e-158  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0317  peptidoglycan synthetase  39.98 
 
 		 850 aa  561  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.47804  normal  0.149248 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4701  peptidoglycan synthetase  39.85 
 
 		 850 aa  559  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  42.9 
 
 		 800 aa  561  1e-158  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03248  fused penicillin-binding protein 1a: murein transglycosylase/murein transpeptidase  39.73 
 
 		 850 aa  558  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.952695  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3773  peptidoglycan synthetase  39.73 
 
 		 850 aa  556  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3867  peptidoglycan synthetase  39.73 
 
 		 850 aa  558  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.505357  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2212  penicillin-binding protein 1A  40.91 
 
 		 835 aa  558  1e-157  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3673  peptidoglycan synthetase  39.73 
 
 		 858 aa  558  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0454505  normal  0.370172 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3809  peptidoglycan synthetase  40 
 
 		 850 aa  556  1e-157  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0118  multimodular transpeptidase-transglycosylase PBP 1A  40.35 
 
 		 793 aa  552  1e-156  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00034  penicillin-binding protein 1A  40.17 
 
 		 855 aa  553  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2091  penicillin-binding protein 1A  40.49 
 
 		 793 aa  554  1e-156  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3900  1A family penicillin-binding protein  40.28 
 
 		 839 aa  549  1e-155  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247667  normal  0.227457 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>