More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2266 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_0911  putative penicillin-binding protein 1A  92.19 
 
 
819 aa  1580    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.477143  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3662  1A family penicillin-binding protein  58.74 
 
 
833 aa  951    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0960  1A family penicillin-binding protein  68.82 
 
 
817 aa  1157    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0340726 
 
 
-
 
NC_004310  BR0916  penicillin-binding protein 1A, putative  92.31 
 
 
819 aa  1583    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1171  penicillin-binding protein  47.99 
 
 
840 aa  723    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0742026  normal  0.682279 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1395  penicillin-binding protein, 1A family  65.81 
 
 
809 aa  1133    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47778  normal  0.639288 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0727  penicillin-binding protein, 1A family  56.62 
 
 
804 aa  954    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2266  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 
819 aa  1684    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6049  penicillin-binding protein, 1A family  57.32 
 
 
805 aa  941    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1716  penicillin-binding protein 1A  56.85 
 
 
831 aa  974    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0706575  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1797  penicillin-binding protein 1a  65.94 
 
 
818 aa  1127    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2978  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a)  45.91 
 
 
849 aa  694    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0803  penicillin-binding protein, 1A  62.26 
 
 
823 aa  1064    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2147  penicillin-binding protein 1A  52.97 
 
 
831 aa  844    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.173589  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1304  penicillin-binding protein, 1A family  66.34 
 
 
819 aa  1136    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0651627 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5843  1A family penicillin-binding protein  58.36 
 
 
808 aa  948    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.36925  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3276  1A family penicillin-binding protein  53.74 
 
 
908 aa  840    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.658356  normal  0.980736 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1816  1A family penicillin-binding protein  45.01 
 
 
845 aa  679    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0319957 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3007  penicillin-binding protein 1A  58.68 
 
 
830 aa  969    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.160235 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2534  penicillin-binding protein 1A  47.07 
 
 
854 aa  718    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.175244 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1857  1A family penicillin-binding protein  46.75 
 
 
849 aa  700    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.874221 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3949  penicillin-binding protein, 1A family  59.19 
 
 
805 aa  948    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.665129 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2852  penicillin-binding protein 1A  58.31 
 
 
830 aa  974    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456684  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3955  penicillin-binding protein, 1A family  58.74 
 
 
805 aa  951    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.755336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4201  putative membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  57.38 
 
 
835 aa  979    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603081  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2444  penicillin-binding protein 1A  59.46 
 
 
830 aa  991    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257563  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1624  1A family penicillin-binding protein  45.79 
 
 
849 aa  694    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521017  normal  0.641281 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1824  penicillin-binding protein 1A  57.01 
 
 
843 aa  972    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0792156  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0867  penicillin-binding protein 1A  44.35 
 
 
835 aa  685    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.371617  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3846  1A family penicillin-binding protein  45.23 
 
 
824 aa  641    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1708  1A family penicillin-binding protein  67.72 
 
 
818 aa  1137    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4359  1A family penicillin-binding protein  59.42 
 
 
810 aa  939    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2574  1A family penicillin-binding protein  47.51 
 
 
791 aa  667    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.95541 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4669  1A family penicillin-binding protein  59.3 
 
 
804 aa  994    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1298  1A family penicillin-binding protein  52.6 
 
 
833 aa  812    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.144183  normal  0.788784 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0934  1A family penicillin-binding protein  55.65 
 
 
803 aa  939    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.305447  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2730  penicillin-binding protein, 1A family  58.24 
 
 
832 aa  971    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3176  glycosyl transferase family protein  42.59 
 
 
838 aa  621  1e-176  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.632903 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2316  peptidoglycan glycosyltransferase  43.42 
 
 
844 aa  611  1e-173  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.067837  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2085  penicillin-binding protein, 1A family  42.24 
 
 
904 aa  576  1.0000000000000001e-163  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.535891  normal  0.507146 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2321  1A family penicillin-binding protein  41.12 
 
 
862 aa  562  1e-158  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.10527  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  40.62 
 
 
795 aa  553  1e-156  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2326  1A family penicillin-binding protein  40.05 
 
 
807 aa  551  1e-155  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.774073  unclonable  0.0000291309 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  39.54 
 
 
797 aa  541  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  40.8 
 
 
773 aa  533  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  40.57 
 
 
841 aa  524  1e-147  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  39.92 
 
 
818 aa  525  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2630  penicillin-binding protein, 1A family  38.57 
 
 
807 aa  520  1e-146  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3215  penicillin-binding protein, 1A family  38.71 
 
 
778 aa  521  1e-146  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  37.41 
 
 
802 aa  519  1e-146  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3133  1A family penicillin-binding protein  39.24 
 
 
796 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  39.14 
 
 
827 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  37.22 
 
 
804 aa  515  1e-144  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2534  1A family penicillin-binding protein  37.27 
 
 
804 aa  513  1e-144  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.401637  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  38.64 
 
 
777 aa  511  1e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  38.29 
 
 
829 aa  510  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1687  1A family penicillin-binding protein  37.06 
 
 
875 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.983861  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  39.32 
 
 
794 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3124  penicillin-binding protein 1A  36.95 
 
 
807 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0246  penicillin-binding protein 1A  36.41 
 
 
814 aa  504  1e-141  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  38.15 
 
 
818 aa  503  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  39.19 
 
 
779 aa  505  1e-141  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  38.31 
 
 
791 aa  500  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  39.68 
 
 
793 aa  497  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  38.04 
 
 
797 aa  496  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0780  penicillin-binding protein 1A  38.6 
 
 
804 aa  498  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0671  1A family penicillin-binding protein  38.32 
 
 
805 aa  496  1e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.152404 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  36.49 
 
 
803 aa  498  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  37.87 
 
 
830 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  36.84 
 
 
817 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5084  penicillin-binding protein, 1A family  36.74 
 
 
817 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.846696  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  37.48 
 
 
800 aa  491  1e-137  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4957  1A family penicillin-binding protein  36.74 
 
 
817 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1139  penicillin-binding protein, 1A family  38.63 
 
 
774 aa  487  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0388878  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  39.53 
 
 
797 aa  488  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0354  putative penicillin-binding 1 (peptoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  39.56 
 
 
799 aa  488  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3603  penicillin-binding protein, 1A family  39.32 
 
 
799 aa  486  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00689676  hitchhiker  0.000000108854 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  39.18 
 
 
792 aa  488  1e-136  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.2 
 
 
817 aa  487  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5582  1A family penicillin-binding protein  37.89 
 
 
824 aa  489  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0381  1A family penicillin-binding protein  36.95 
 
 
817 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0404  penicillin-binding protein 1A  36.97 
 
 
815 aa  484  1e-135  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0818527  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0024  penicillin-binding protein, 1A family  38.62 
 
 
802 aa  484  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  37.48 
 
 
766 aa  482  1e-135  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0023  1A family penicillin-binding protein  36.89 
 
 
799 aa  480  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432475  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0402  peptidoglycan glycosyltransferase  36.15 
 
 
814 aa  480  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.527889  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2091  penicillin-binding protein 1A  36.59 
 
 
793 aa  482  1e-134  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0825  1A family penicillin-binding protein  35.34 
 
 
846 aa  482  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397118  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3254  penicillin-binding protein, 1A family  37.29 
 
 
777 aa  481  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0272171  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2907  penicillin-binding protein, 1A family  37.17 
 
 
777 aa  480  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0114663 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4121  1A family penicillin-binding protein  35.29 
 
 
814 aa  479  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.739203  hitchhiker  0.00000203551 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0118  multimodular transpeptidase-transglycosylase PBP 1A  36.47 
 
 
793 aa  480  1e-134  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2976  penicillin-binding 1 transmembrane protein  37.41 
 
 
801 aa  478  1e-133  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.893289  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5133  penicillin-binding protein  35.97 
 
 
814 aa  478  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0554788  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0366  1A family penicillin-binding protein  38.45 
 
 
797 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.941804  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0387  1A family penicillin-binding protein  38.45 
 
 
797 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495893  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2752  1A family penicillin-binding protein  38.91 
 
 
797 aa  473  1e-132  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  35.08 
 
 
794 aa  473  1e-132  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0290  1A family penicillin-binding protein  38.1 
 
 
797 aa  473  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308967  normal  0.891054 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  36.36 
 
 
796 aa  473  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>