More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2316 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2316  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 844 aa  1721    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.067837  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3846  1A family penicillin-binding protein  56.15 
 
 		 824 aa  926    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3176  glycosyl transferase family protein  58.1 
 
 		 838 aa  983    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.632903 
 
 
-
 
NC_004310  BR0916  penicillin-binding protein 1A, putative  43.47 
 
 		 819 aa  622  1e-177  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0911  putative penicillin-binding protein 1A  43.23 
 
 		 819 aa  621  1e-176  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.477143  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2266  1A family penicillin-binding protein  43.42 
 
 		 819 aa  616  1e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4669  1A family penicillin-binding protein  43.72 
 
 		 804 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5843  1A family penicillin-binding protein  43.02 
 
 		 808 aa  605  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.36925  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1708  1A family penicillin-binding protein  42.62 
 
 		 818 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6049  penicillin-binding protein, 1A family  42.82 
 
 		 805 aa  600  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1716  penicillin-binding protein 1A  41.25 
 
 		 831 aa  590  1e-167  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0706575  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4359  1A family penicillin-binding protein  43.39 
 
 		 810 aa  588  1e-166  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1824  penicillin-binding protein 1A  41.95 
 
 		 843 aa  585  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0792156  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1304  penicillin-binding protein, 1A family  42.23 
 
 		 819 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0651627 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0960  1A family penicillin-binding protein  42.63 
 
 		 817 aa  584  1.0000000000000001e-165  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0340726 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1797  penicillin-binding protein 1a  42.58 
 
 		 818 aa  582  1e-164  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2147  penicillin-binding protein 1A  42.56 
 
 		 831 aa  580  1e-164  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.173589  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1395  penicillin-binding protein, 1A family  41.85 
 
 		 809 aa  582  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47778  normal  0.639288 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2444  penicillin-binding protein 1A  41.69 
 
 		 830 aa  582  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0727  penicillin-binding protein, 1A family  41.74 
 
 		 804 aa  581  1e-164  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0934  1A family penicillin-binding protein  42.11 
 
 		 803 aa  578  1.0000000000000001e-163  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.305447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0803  penicillin-binding protein, 1A  40.69 
 
 		 823 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3949  penicillin-binding protein, 1A family  42.63 
 
 		 805 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.665129 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1298  1A family penicillin-binding protein  41.38 
 
 		 833 aa  578  1.0000000000000001e-163  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.144183  normal  0.788784 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3955  penicillin-binding protein, 1A family  42.2 
 
 		 805 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.755336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4201  putative membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  41.1 
 
 		 835 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603081  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3662  1A family penicillin-binding protein  42.2 
 
 		 833 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3007  penicillin-binding protein 1A  42.16 
 
 		 830 aa  568  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.160235 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2730  penicillin-binding protein, 1A family  41.44 
 
 		 832 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2852  penicillin-binding protein 1A  41.19 
 
 		 830 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3276  1A family penicillin-binding protein  40.84 
 
 		 908 aa  541  9.999999999999999e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.658356  normal  0.980736 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1171  penicillin-binding protein  41.1 
 
 		 840 aa  525  1e-147  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0742026  normal  0.682279 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2574  1A family penicillin-binding protein  41.03 
 
 		 791 aa  523  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.95541 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1816  1A family penicillin-binding protein  40.13 
 
 		 845 aa  520  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0319957 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0867  penicillin-binding protein 1A  40.13 
 
 		 835 aa  514  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.371617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2534  penicillin-binding protein 1A  38.84 
 
 		 854 aa  506  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.175244 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1857  1A family penicillin-binding protein  39.24 
 
 		 849 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.874221 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1624  1A family penicillin-binding protein  39.37 
 
 		 849 aa  503  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521017  normal  0.641281 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2978  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a)  39.37 
 
 		 849 aa  502  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1687  1A family penicillin-binding protein  35.47 
 
 		 875 aa  434  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.983861  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2321  1A family penicillin-binding protein  35.98 
 
 		 862 aa  412  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.10527  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2085  penicillin-binding protein, 1A family  35.88 
 
 		 904 aa  397  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.535891  normal  0.507146 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  33.72 
 
 		 804 aa  393  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2326  1A family penicillin-binding protein  33.84 
 
 		 807 aa  393  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.774073  unclonable  0.0000291309 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  34.86 
 
 		 795 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  35.6 
 
 		 797 aa  390  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  34.39 
 
 		 802 aa  391  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3215  penicillin-binding protein, 1A family  35.31 
 
 		 778 aa  387  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  34.16 
 
 		 827 aa  383  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  34.44 
 
 		 829 aa  382  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0274  penicillin-binding protein, 1A family  33.16 
 
 		 790 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.565405  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3124  penicillin-binding protein 1A  34.2 
 
 		 807 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  33.42 
 
 		 800 aa  380  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  33.99 
 
 		 777 aa  377  1e-103  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  33.37 
 
 		 818 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0290  1A family penicillin-binding protein  34.31 
 
 		 797 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308967  normal  0.891054 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  33.38 
 
 		 803 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3133  1A family penicillin-binding protein  34.01 
 
 		 796 aa  371  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  33.97 
 
 		 773 aa  372  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0366  1A family penicillin-binding protein  34.46 
 
 		 797 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.941804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2720  penicillin-binding protein 1A  34.46 
 
 		 797 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2253  1A family penicillin-binding protein  34.92 
 
 		 803 aa  372  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.816825  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0387  1A family penicillin-binding protein  34.46 
 
 		 797 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495893  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0246  penicillin-binding protein 1A  32.5 
 
 		 814 aa  368  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3486  penicillin-binding protein 1A  34.53 
 
 		 796 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.92 
 
 		 817 aa  368  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2630  penicillin-binding protein, 1A family  32.59 
 
 		 807 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  32.93 
 
 		 797 aa  369  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0780  penicillin-binding protein 1A  33.74 
 
 		 804 aa  368  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0315  1A family penicillin-binding protein  34.34 
 
 		 795 aa  369  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.640379 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0306  1A family penicillin-binding protein  34.2 
 
 		 797 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6131  penicillin-binding protein 1A  34.23 
 
 		 839 aa  365  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353845  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1948  1A family penicillin-binding protein  34.23 
 
 		 839 aa  365  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135129  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1972  1A family penicillin-binding protein  34.23 
 
 		 839 aa  365  3e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125323  normal  0.0456782 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  33.38 
 
 		 792 aa  364  3e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5259  penicillin-binding protein 1A  33.96 
 
 		 838 aa  363  6e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000072806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  35.24 
 
 		 791 aa  363  7.0000000000000005e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  33.29 
 
 		 797 aa  363  9e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  34.43 
 
 		 793 aa  363  1e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  33.25 
 
 		 841 aa  362  1e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1935  1A family penicillin-binding protein  33.77 
 
 		 839 aa  363  1e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000247834  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  33.29 
 
 		 766 aa  363  1e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1862  1A family penicillin-binding protein  33.77 
 
 		 839 aa  362  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.000000145704  hitchhiker  0.0000925337 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  34.6 
 
 		 818 aa  361  3e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0354  putative penicillin-binding 1 (peptoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  33.51 
 
 		 799 aa  360  9e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1918  penicillin-binding protein, 1A family  32.8 
 
 		 812 aa  359  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.176585  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  31.7 
 
 		 830 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3603  penicillin-binding protein, 1A family  34.17 
 
 		 799 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00689676  hitchhiker  0.000000108854 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  31.44 
 
 		 823 aa  358  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  31.44 
 
 		 823 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  33.24 
 
 		 796 aa  357  5e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4121  1A family penicillin-binding protein  30.94 
 
 		 814 aa  356  1e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.739203  hitchhiker  0.00000203551 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0381  1A family penicillin-binding protein  31.57 
 
 		 817 aa  356  1e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0671  1A family penicillin-binding protein  32.8 
 
 		 805 aa  355  1e-96  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.152404 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1321  1A family penicillin-binding protein  32.9 
 
 		 837 aa  356  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000393559 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  30.84 
 
 		 794 aa  355  2e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  32.88 
 
 		 791 aa  355  2e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  30.84 
 
 		 794 aa  354  4e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2692  penicillin-binding protein  30.96 
 
 		 846 aa  354  4e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000762848  hitchhiker  0.0050562 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0092  1A family penicillin-binding protein  33.06 
 
 		 778 aa  353  5e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000436892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>