More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3846 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0916  penicillin-binding protein 1A, putative  46.41 
 
 		 819 aa  652    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3846  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 		 824 aa  1681    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2316  peptidoglycan glycosyltransferase  56.15 
 
 		 844 aa  927    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.067837  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3176  glycosyl transferase family protein  58.38 
 
 		 838 aa  944    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.632903 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5843  1A family penicillin-binding protein  45.13 
 
 		 808 aa  638    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.36925  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2266  1A family penicillin-binding protein  45.23 
 
 		 819 aa  640    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1708  1A family penicillin-binding protein  46.21 
 
 		 818 aa  647    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0911  putative penicillin-binding protein 1A  46.54 
 
 		 819 aa  655    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.477143  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6049  penicillin-binding protein, 1A family  44.22 
 
 		 805 aa  633  1e-180  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0934  1A family penicillin-binding protein  44.43 
 
 		 803 aa  634  1e-180  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.305447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0727  penicillin-binding protein, 1A family  44.02 
 
 		 804 aa  626  1e-178  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1824  penicillin-binding protein 1A  43.21 
 
 		 843 aa  624  1e-177  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0792156  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4669  1A family penicillin-binding protein  44.47 
 
 		 804 aa  625  1e-177  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3949  penicillin-binding protein, 1A family  44.22 
 
 		 805 aa  621  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.665129 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4359  1A family penicillin-binding protein  44.61 
 
 		 810 aa  616  1e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2444  penicillin-binding protein 1A  44.29 
 
 		 830 aa  616  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1716  penicillin-binding protein 1A  42.45 
 
 		 831 aa  608  1e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0706575  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3662  1A family penicillin-binding protein  43.69 
 
 		 833 aa  610  1e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0803  penicillin-binding protein, 1A  44.01 
 
 		 823 aa  609  1e-173  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3955  penicillin-binding protein, 1A family  43.69 
 
 		 805 aa  610  1e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.755336 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2147  penicillin-binding protein 1A  44.39 
 
 		 831 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.173589  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3007  penicillin-binding protein 1A  44.93 
 
 		 830 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.160235 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1304  penicillin-binding protein, 1A family  43.5 
 
 		 819 aa  602  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0651627 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2852  penicillin-binding protein 1A  43.46 
 
 		 830 aa  600  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2730  penicillin-binding protein, 1A family  44.67 
 
 		 832 aa  602  1e-170  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1395  penicillin-binding protein, 1A family  43.42 
 
 		 809 aa  602  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47778  normal  0.639288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4201  putative membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  43.41 
 
 		 835 aa  593  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603081  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1797  penicillin-binding protein 1a  43.25 
 
 		 818 aa  593  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0960  1A family penicillin-binding protein  43.92 
 
 		 817 aa  593  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0340726 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1298  1A family penicillin-binding protein  41.75 
 
 		 833 aa  587  1e-166  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.144183  normal  0.788784 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1816  1A family penicillin-binding protein  41.7 
 
 		 845 aa  557  1e-157  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0319957 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1857  1A family penicillin-binding protein  43.06 
 
 		 849 aa  554  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.874221 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3276  1A family penicillin-binding protein  41.92 
 
 		 908 aa  553  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.658356  normal  0.980736 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1171  penicillin-binding protein  43.39 
 
 		 840 aa  546  1e-154  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0742026  normal  0.682279 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1624  1A family penicillin-binding protein  42.31 
 
 		 849 aa  543  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521017  normal  0.641281 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2978  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a)  42.44 
 
 		 849 aa  542  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0867  penicillin-binding protein 1A  41.25 
 
 		 835 aa  540  9.999999999999999e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.371617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2534  penicillin-binding protein 1A  41.08 
 
 		 854 aa  536  1e-151  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.175244 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2574  1A family penicillin-binding protein  40.68 
 
 		 791 aa  515  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.95541 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  36.8 
 
 		 802 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  37.11 
 
 		 795 aa  437  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2321  1A family penicillin-binding protein  36.45 
 
 		 862 aa  433  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.10527  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1687  1A family penicillin-binding protein  35.23 
 
 		 875 aa  436  1e-120  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.983861  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  36.72 
 
 		 800 aa  426  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3215  penicillin-binding protein, 1A family  37.3 
 
 		 778 aa  427  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  35.61 
 
 		 830 aa  419  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2326  1A family penicillin-binding protein  35.46 
 
 		 807 aa  414  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.774073  unclonable  0.0000291309 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0246  penicillin-binding protein 1A  32.99 
 
 		 814 aa  409  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  34.69 
 
 		 777 aa  410  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  33.92 
 
 		 803 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  34.91 
 
 		 797 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  36.51 
 
 		 791 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2091  penicillin-binding protein 1A  33.85 
 
 		 793 aa  404  1e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  35.19 
 
 		 829 aa  406  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2085  penicillin-binding protein, 1A family  36.28 
 
 		 904 aa  404  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.535891  normal  0.507146 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0274  penicillin-binding protein, 1A family  35.57 
 
 		 790 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.565405  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3124  penicillin-binding protein 1A  34.64 
 
 		 807 aa  403  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  34.72 
 
 		 818 aa  404  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  32.77 
 
 		 823 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  35.26 
 
 		 827 aa  406  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0118  multimodular transpeptidase-transglycosylase PBP 1A  33.72 
 
 		 793 aa  401  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0402  peptidoglycan glycosyltransferase  32.61 
 
 		 814 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.527889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0381  1A family penicillin-binding protein  32.86 
 
 		 817 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2253  1A family penicillin-binding protein  35.81 
 
 		 803 aa  399  9.999999999999999e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.816825  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  34.58 
 
 		 804 aa  401  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  32.69 
 
 		 823 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  32.63 
 
 		 794 aa  397  1e-109  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0404  penicillin-binding protein 1A  32.97 
 
 		 815 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0818527  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  32.5 
 
 		 817 aa  398  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3133  1A family penicillin-binding protein  35.85 
 
 		 796 aa  395  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5084  penicillin-binding protein, 1A family  32.74 
 
 		 817 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.846696  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  32.77 
 
 		 794 aa  396  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  34.59 
 
 		 766 aa  395  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  36.28 
 
 		 793 aa  394  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3486  penicillin-binding protein 1A  35.64 
 
 		 796 aa  395  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4957  1A family penicillin-binding protein  32.74 
 
 		 817 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45310  Penicillin binding protein 1A  33.17 
 
 		 819 aa  393  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1936  penicillin-binding protein, 1A family  35.36 
 
 		 790 aa  395  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.08 
 
 		 817 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0306  1A family penicillin-binding protein  35.92 
 
 		 797 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0387  1A family penicillin-binding protein  35.64 
 
 		 797 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495893  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2630  penicillin-binding protein, 1A family  34.33 
 
 		 807 aa  392  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5133  penicillin-binding protein  33 
 
 		 814 aa  391  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0554788  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3603  penicillin-binding protein, 1A family  34.95 
 
 		 799 aa  392  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00689676  hitchhiker  0.000000108854 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1861  peptidoglycan glycosyltransferase  35.16 
 
 		 854 aa  392  1e-107  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.894237  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0315  1A family penicillin-binding protein  35.29 
 
 		 795 aa  392  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.640379 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0366  1A family penicillin-binding protein  35.64 
 
 		 797 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.941804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2692  penicillin-binding protein  31.26 
 
 		 846 aa  390  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000762848  hitchhiker  0.0050562 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0354  putative penicillin-binding 1 (peptoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  35.09 
 
 		 799 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0607  penicillin-binding protein 1A  32.62 
 
 		 839 aa  392  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0360567  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2720  penicillin-binding protein 1A  35.64 
 
 		 797 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1790  1A family penicillin-binding protein  35.12 
 
 		 809 aa  392  1e-107  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0290  1A family penicillin-binding protein  35.47 
 
 		 797 aa  390  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308967  normal  0.891054 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  34.82 
 
 		 773 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0780  penicillin-binding protein 1A  36.5 
 
 		 804 aa  388  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5582  1A family penicillin-binding protein  35.13 
 
 		 824 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  35.03 
 
 		 818 aa  385  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0671  1A family penicillin-binding protein  34.78 
 
 		 805 aa  385  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.152404 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  34 
 
 		 797 aa  384  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3241  penicillin-binding protein, 1A family  33.59 
 
 		 807 aa  383  1e-105  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>