More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1708 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009505  BOV_0911  putative penicillin-binding protein 1A  67.72 
 
 		 819 aa  1147    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.477143  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3846  1A family penicillin-binding protein  46.21 
 
 		 824 aa  655    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1624  1A family penicillin-binding protein  48.7 
 
 		 849 aa  715    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521017  normal  0.641281 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3276  1A family penicillin-binding protein  53.12 
 
 		 908 aa  815    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.658356  normal  0.980736 
 
 
-
 
NC_004310  BR0916  penicillin-binding protein 1A, putative  67.6 
 
 		 819 aa  1144    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2574  1A family penicillin-binding protein  44.76 
 
 		 791 aa  639    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.95541 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1395  penicillin-binding protein, 1A family  64.57 
 
 		 809 aa  1092    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47778  normal  0.639288 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3955  penicillin-binding protein, 1A family  58.19 
 
 		 805 aa  930    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.755336 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1797  penicillin-binding protein 1a  63.61 
 
 		 818 aa  1072    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1716  penicillin-binding protein 1A  54.99 
 
 		 831 aa  939    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0706575  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2266  1A family penicillin-binding protein  67.72 
 
 		 819 aa  1152    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2978  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a)  48.57 
 
 		 849 aa  714    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0803  penicillin-binding protein, 1A  59.59 
 
 		 823 aa  1006    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1171  penicillin-binding protein  46.5 
 
 		 840 aa  744    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0742026  normal  0.682279 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2147  penicillin-binding protein 1A  53.55 
 
 		 831 aa  843    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.173589  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0934  1A family penicillin-binding protein  56.36 
 
 		 803 aa  941    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.305447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2730  penicillin-binding protein, 1A family  56.34 
 
 		 832 aa  934    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4201  putative membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  55.64 
 
 		 835 aa  948    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603081  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3007  penicillin-binding protein 1A  57.9 
 
 		 830 aa  922    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.160235 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2534  penicillin-binding protein 1A  46.72 
 
 		 854 aa  726    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.175244 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1857  1A family penicillin-binding protein  49.94 
 
 		 849 aa  730    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.874221 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2852  penicillin-binding protein 1A  55.77 
 
 		 830 aa  930    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3662  1A family penicillin-binding protein  58.19 
 
 		 833 aa  930    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2444  penicillin-binding protein 1A  56.71 
 
 		 830 aa  942    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0960  1A family penicillin-binding protein  66.3 
 
 		 817 aa  1100    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0340726 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1824  penicillin-binding protein 1A  55.72 
 
 		 843 aa  941    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0792156  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1816  1A family penicillin-binding protein  46.05 
 
 		 845 aa  729    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0319957 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0867  penicillin-binding protein 1A  46.28 
 
 		 835 aa  714    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.371617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1708  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 		 818 aa  1672    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4669  1A family penicillin-binding protein  58.22 
 
 		 804 aa  980    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4359  1A family penicillin-binding protein  58.82 
 
 		 810 aa  919    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1298  1A family penicillin-binding protein  51.47 
 
 		 833 aa  781    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.144183  normal  0.788784 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3949  penicillin-binding protein, 1A family  59.01 
 
 		 805 aa  929    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.665129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0727  penicillin-binding protein, 1A family  56.71 
 
 		 804 aa  953    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6049  penicillin-binding protein, 1A family  57.68 
 
 		 805 aa  935    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1304  penicillin-binding protein, 1A family  64.51 
 
 		 819 aa  1097    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0651627 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5843  1A family penicillin-binding protein  58.01 
 
 		 808 aa  932    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.36925  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3176  glycosyl transferase family protein  43.43 
 
 		 838 aa  618  1e-175  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.632903 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2316  peptidoglycan glycosyltransferase  42.62 
 
 		 844 aa  605  1.0000000000000001e-171  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.067837  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2085  penicillin-binding protein, 1A family  42.33 
 
 		 904 aa  564  1.0000000000000001e-159  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.535891  normal  0.507146 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2321  1A family penicillin-binding protein  40.2 
 
 		 862 aa  556  1e-157  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.10527  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  39.04 
 
 		 802 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1687  1A family penicillin-binding protein  39.73 
 
 		 875 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.983861  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  39.92 
 
 		 797 aa  537  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2326  1A family penicillin-binding protein  38.92 
 
 		 807 aa  532  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.774073  unclonable  0.0000291309 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  39.95 
 
 		 795 aa  526  1e-148  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  39.67 
 
 		 773 aa  521  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3215  penicillin-binding protein, 1A family  38.63 
 
 		 778 aa  520  1e-146  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  38.77 
 
 		 829 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2630  penicillin-binding protein, 1A family  38.52 
 
 		 807 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  38.52 
 
 		 818 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0671  1A family penicillin-binding protein  41.31 
 
 		 805 aa  517  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.152404 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  39.28 
 
 		 827 aa  513  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  39.18 
 
 		 793 aa  503  1e-141  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  38.34 
 
 		 777 aa  504  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  41.1 
 
 		 792 aa  504  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2534  1A family penicillin-binding protein  37.85 
 
 		 804 aa  503  1e-141  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.401637  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  38.28 
 
 		 803 aa  503  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3133  1A family penicillin-binding protein  38.24 
 
 		 796 aa  500  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  38.89 
 
 		 830 aa  501  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0780  penicillin-binding protein 1A  39.74 
 
 		 804 aa  501  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  36.99 
 
 		 804 aa  496  1e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  38.97 
 
 		 800 aa  499  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  38.85 
 
 		 766 aa  493  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0825  1A family penicillin-binding protein  38.05 
 
 		 846 aa  490  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397118  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  39.14 
 
 		 779 aa  489  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  38.16 
 
 		 841 aa  491  1e-137  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  39.27 
 
 		 794 aa  490  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3114  peptidoglycan glycosyltransferase  41.18 
 
 		 793 aa  488  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.183749 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2976  penicillin-binding 1 transmembrane protein  38.1 
 
 		 801 aa  486  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.893289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  40.7 
 
 		 791 aa  486  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3124  penicillin-binding protein 1A  37.15 
 
 		 807 aa  486  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  38.54 
 
 		 797 aa  488  1e-136  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45310  Penicillin binding protein 1A  37.19 
 
 		 819 aa  487  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  39.69 
 
 		 797 aa  488  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2907  penicillin-binding protein, 1A family  38.64 
 
 		 777 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0114663 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1139  penicillin-binding protein, 1A family  40.37 
 
 		 774 aa  484  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0388878  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3254  penicillin-binding protein, 1A family  38.64 
 
 		 777 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0272171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.99 
 
 		 817 aa  483  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0387  1A family penicillin-binding protein  38.85 
 
 		 797 aa  483  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495893  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  36.87 
 
 		 817 aa  485  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3603  penicillin-binding protein, 1A family  39.73 
 
 		 799 aa  485  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00689676  hitchhiker  0.000000108854 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5084  penicillin-binding protein, 1A family  36.47 
 
 		 817 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.846696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0366  1A family penicillin-binding protein  38.71 
 
 		 797 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.941804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0404  penicillin-binding protein 1A  37.16 
 
 		 815 aa  482  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0818527  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  38.36 
 
 		 796 aa  479  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0354  putative penicillin-binding 1 (peptoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  39.06 
 
 		 799 aa  482  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4957  1A family penicillin-binding protein  36.47 
 
 		 817 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2720  penicillin-binding protein 1A  39.4 
 
 		 797 aa  481  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  36.85 
 
 		 818 aa  481  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0381  1A family penicillin-binding protein  36.8 
 
 		 817 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0402  peptidoglycan glycosyltransferase  36.08 
 
 		 814 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.527889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0246  penicillin-binding protein 1A  35.21 
 
 		 814 aa  478  1e-133  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  37.48 
 
 		 791 aa  479  1e-133  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5582  1A family penicillin-binding protein  38.17 
 
 		 824 aa  479  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0306  1A family penicillin-binding protein  38.68 
 
 		 797 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5133  penicillin-binding protein  36.32 
 
 		 814 aa  475  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0554788  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0088  penicillin-binding protein, 1A family  38.6 
 
 		 778 aa  473  1e-132  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0128257 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0290  1A family penicillin-binding protein  39.13 
 
 		 797 aa  474  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308967  normal  0.891054 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0024  penicillin-binding protein, 1A family  40.57 
 
 		 802 aa  475  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>