More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1687 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1687  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 		 875 aa  1779    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.983861  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2085  penicillin-binding protein, 1A family  44.38 
 
 		 904 aa  625  1e-177  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.535891  normal  0.507146 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2147  penicillin-binding protein 1A  40.81 
 
 		 831 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.173589  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1824  penicillin-binding protein 1A  41.71 
 
 		 843 aa  578  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0792156  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4669  1A family penicillin-binding protein  40.56 
 
 		 804 aa  570  1e-161  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4201  putative membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  40.95 
 
 		 835 aa  568  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603081  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1716  penicillin-binding protein 1A  40.18 
 
 		 831 aa  568  1e-160  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0706575  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3276  1A family penicillin-binding protein  41.5 
 
 		 908 aa  558  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.658356  normal  0.980736 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2730  penicillin-binding protein, 1A family  41.56 
 
 		 832 aa  554  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0803  penicillin-binding protein, 1A  40.15 
 
 		 823 aa  553  1e-156  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2444  penicillin-binding protein 1A  39.95 
 
 		 830 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0934  1A family penicillin-binding protein  40.51 
 
 		 803 aa  548  1e-154  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.305447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1395  penicillin-binding protein, 1A family  40.21 
 
 		 809 aa  542  1e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47778  normal  0.639288 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0727  penicillin-binding protein, 1A family  41.33 
 
 		 804 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3007  penicillin-binding protein 1A  40.72 
 
 		 830 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.160235 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2852  penicillin-binding protein 1A  39.95 
 
 		 830 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1708  1A family penicillin-binding protein  39.3 
 
 		 818 aa  541  9.999999999999999e-153  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1298  1A family penicillin-binding protein  38.65 
 
 		 833 aa  539  9.999999999999999e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.144183  normal  0.788784 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0960  1A family penicillin-binding protein  40.65 
 
 		 817 aa  537  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0340726 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1797  penicillin-binding protein 1a  39.04 
 
 		 818 aa  536  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1304  penicillin-binding protein, 1A family  40.66 
 
 		 819 aa  534  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0651627 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0911  putative penicillin-binding protein 1A  37.95 
 
 		 819 aa  526  1e-148  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.477143  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0916  penicillin-binding protein 1A, putative  37.82 
 
 		 819 aa  524  1e-147  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6049  penicillin-binding protein, 1A family  38.56 
 
 		 805 aa  523  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5843  1A family penicillin-binding protein  38.43 
 
 		 808 aa  520  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.36925  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2266  1A family penicillin-binding protein  37.18 
 
 		 819 aa  521  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3949  penicillin-binding protein, 1A family  40.13 
 
 		 805 aa  512  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.665129 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3662  1A family penicillin-binding protein  39.59 
 
 		 833 aa  506  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4359  1A family penicillin-binding protein  39.29 
 
 		 810 aa  506  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3955  penicillin-binding protein, 1A family  39.59 
 
 		 805 aa  505  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.755336 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2534  penicillin-binding protein 1A  36.44 
 
 		 854 aa  491  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.175244 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1816  1A family penicillin-binding protein  37.68 
 
 		 845 aa  484  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0319957 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1857  1A family penicillin-binding protein  37.39 
 
 		 849 aa  483  1e-135  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.874221 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2574  1A family penicillin-binding protein  37.16 
 
 		 791 aa  480  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.95541 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2978  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a)  37.42 
 
 		 849 aa  477  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1171  penicillin-binding protein  37.28 
 
 		 840 aa  477  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0742026  normal  0.682279 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1624  1A family penicillin-binding protein  37.29 
 
 		 849 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.521017  normal  0.641281 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0867  penicillin-binding protein 1A  35.89 
 
 		 835 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.371617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3176  glycosyl transferase family protein  37.64 
 
 		 838 aa  463  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.632903 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2321  1A family penicillin-binding protein  35.97 
 
 		 862 aa  461  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.10527  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3846  1A family penicillin-binding protein  35.18 
 
 		 824 aa  445  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  36.72 
 
 		 800 aa  441  9.999999999999999e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2316  peptidoglycan glycosyltransferase  34.91 
 
 		 844 aa  436  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.067837  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  36.44 
 
 		 830 aa  432  1e-119  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  33.45 
 
 		 823 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  35.67 
 
 		 804 aa  427  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  34.29 
 
 		 818 aa  422  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  32.62 
 
 		 823 aa  422  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  34.75 
 
 		 841 aa  419  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  33.94 
 
 		 802 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3215  penicillin-binding protein, 1A family  35.43 
 
 		 778 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3133  1A family penicillin-binding protein  33.59 
 
 		 796 aa  413  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.48 
 
 		 817 aa  416  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45310  Penicillin binding protein 1A  33.42 
 
 		 819 aa  409  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0246  penicillin-binding protein 1A  33.85 
 
 		 814 aa  412  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  34.56 
 
 		 773 aa  411  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0825  1A family penicillin-binding protein  33.33 
 
 		 846 aa  409  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397118  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2630  penicillin-binding protein, 1A family  34.79 
 
 		 807 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  33.91 
 
 		 794 aa  405  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  34.04 
 
 		 794 aa  404  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0402  peptidoglycan glycosyltransferase  33.29 
 
 		 814 aa  403  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.527889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2091  penicillin-binding protein 1A  35.29 
 
 		 793 aa  405  1e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1936  penicillin-binding protein, 1A family  36.11 
 
 		 790 aa  403  1e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  33.16 
 
 		 818 aa  403  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0118  multimodular transpeptidase-transglycosylase PBP 1A  35.16 
 
 		 793 aa  403  1e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  33.38 
 
 		 829 aa  404  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5133  penicillin-binding protein  33.46 
 
 		 814 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0554788  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  32.16 
 
 		 827 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0315  1A family penicillin-binding protein  34.66 
 
 		 795 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.640379 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0404  penicillin-binding protein 1A  33.46 
 
 		 815 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0818527  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  34.74 
 
 		 797 aa  400  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0060  1A family penicillin-binding protein  34.3 
 
 		 852 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.133649 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0290  1A family penicillin-binding protein  34.62 
 
 		 797 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308967  normal  0.891054 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  34.94 
 
 		 796 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  33.55 
 
 		 803 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0306  1A family penicillin-binding protein  34.66 
 
 		 797 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0671  1A family penicillin-binding protein  33.75 
 
 		 805 aa  399  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.152404 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0387  1A family penicillin-binding protein  34.35 
 
 		 797 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495893  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2976  penicillin-binding 1 transmembrane protein  34.25 
 
 		 801 aa  394  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.893289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0366  1A family penicillin-binding protein  34.22 
 
 		 797 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.941804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  33.59 
 
 		 795 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3486  penicillin-binding protein 1A  34.22 
 
 		 796 aa  395  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2720  penicillin-binding protein 1A  34.35 
 
 		 797 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5084  penicillin-binding protein, 1A family  32.52 
 
 		 817 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.846696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  33.08 
 
 		 817 aa  392  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2907  penicillin-binding protein, 1A family  33.75 
 
 		 777 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0114663 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4957  1A family penicillin-binding protein  32.65 
 
 		 817 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1918  penicillin-binding protein, 1A family  32.77 
 
 		 812 aa  390  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.176585  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2534  1A family penicillin-binding protein  31.88 
 
 		 804 aa  389  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.401637  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1268  1A family penicillin-binding protein  34.05 
 
 		 786 aa  388  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00608444  normal  0.905221 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3254  penicillin-binding protein, 1A family  33.61 
 
 		 777 aa  388  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0272171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0381  1A family penicillin-binding protein  32.27 
 
 		 817 aa  389  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2326  1A family penicillin-binding protein  33.92 
 
 		 807 aa  386  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.774073  unclonable  0.0000291309 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  33.42 
 
 		 797 aa  388  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0354  putative penicillin-binding 1 (peptoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  33.59 
 
 		 799 aa  389  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3603  penicillin-binding protein, 1A family  33.59 
 
 		 799 aa  389  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00689676  hitchhiker  0.000000108854 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  34.05 
 
 		 792 aa  389  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  34.85 
 
 		 748 aa  388  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4121  1A family penicillin-binding protein  33.29 
 
 		 814 aa  389  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.739203  hitchhiker  0.00000203551 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2692  penicillin-binding protein  32.33 
 
 		 846 aa  385  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000762848  hitchhiker  0.0050562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>