More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3195 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3133  1A family penicillin-binding protein  66.92 
 
 		 796 aa  1064    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2534  1A family penicillin-binding protein  45.43 
 
 		 804 aa  652    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.401637  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  66.17 
 
 		 818 aa  1084    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  48.59 
 
 		 797 aa  706    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  67.17 
 
 		 841 aa  1062    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  64.36 
 
 		 827 aa  1043    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  67.73 
 
 		 818 aa  1062    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 		 773 aa  1579    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  63.59 
 
 		 829 aa  1032    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  43.82 
 
 		 802 aa  622  1e-177  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  43.19 
 
 		 795 aa  610  1e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3215  penicillin-binding protein, 1A family  44.33 
 
 		 778 aa  590  1e-167  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2630  penicillin-binding protein, 1A family  41.52 
 
 		 807 aa  581  1e-164  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0074  penicillin-binding protein, 1A family  40.15 
 
 		 852 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2147  penicillin-binding protein 1A  40.73 
 
 		 831 aa  568  1e-160  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.173589  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0057  penicillin-binding protein 1A  40.15 
 
 		 852 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0060  1A family penicillin-binding protein  39.21 
 
 		 852 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.133649 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2326  1A family penicillin-binding protein  41.26 
 
 		 807 aa  567  1e-160  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.774073  unclonable  0.0000291309 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0062  penicillin-binding protein, 1A family  40.28 
 
 		 852 aa  563  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2266  1A family penicillin-binding protein  40.8 
 
 		 819 aa  561  1e-158  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0916  penicillin-binding protein 1A, putative  40.67 
 
 		 819 aa  558  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0911  putative penicillin-binding protein 1A  40.67 
 
 		 819 aa  558  1e-157  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.477143  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3124  penicillin-binding protein 1A  40.68 
 
 		 807 aa  555  1e-156  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  42.74 
 
 		 793 aa  551  1e-155  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2444  penicillin-binding protein 1A  38.57 
 
 		 830 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2730  penicillin-binding protein, 1A family  39.54 
 
 		 832 aa  542  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  40.92 
 
 		 777 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4201  putative membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  39.54 
 
 		 835 aa  541  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603081  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  41.64 
 
 		 791 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0727  penicillin-binding protein, 1A family  38.4 
 
 		 804 aa  537  1e-151  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  42.27 
 
 		 794 aa  537  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1716  penicillin-binding protein 1A  38.6 
 
 		 831 aa  536  1e-151  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0706575  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3007  penicillin-binding protein 1A  39.41 
 
 		 830 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.160235 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2852  penicillin-binding protein 1A  39.17 
 
 		 830 aa  538  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  42.41 
 
 		 779 aa  536  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1395  penicillin-binding protein, 1A family  39.41 
 
 		 809 aa  537  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47778  normal  0.639288 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2321  1A family penicillin-binding protein  39.64 
 
 		 862 aa  536  1e-151  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.10527  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0803  penicillin-binding protein, 1A  38.81 
 
 		 823 aa  532  1e-150  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1824  penicillin-binding protein 1A  38.94 
 
 		 843 aa  535  1e-150  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0792156  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1708  1A family penicillin-binding protein  39.67 
 
 		 818 aa  533  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0780  penicillin-binding protein 1A  40.51 
 
 		 804 aa  529  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3276  1A family penicillin-binding protein  40.05 
 
 		 908 aa  530  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.658356  normal  0.980736 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0960  1A family penicillin-binding protein  39.58 
 
 		 817 aa  531  1e-149  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0340726 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0934  1A family penicillin-binding protein  37.8 
 
 		 803 aa  526  1e-148  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.305447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  40.41 
 
 		 797 aa  528  1e-148  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3405  1A family penicillin-binding protein  39.98 
 
 		 857 aa  525  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0379347  normal  0.659287 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1304  penicillin-binding protein, 1A family  39.54 
 
 		 819 aa  525  1e-147  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0651627 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4669  1A family penicillin-binding protein  36.24 
 
 		 804 aa  519  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2907  penicillin-binding protein, 1A family  41.76 
 
 		 777 aa  519  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0114663 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4359  1A family penicillin-binding protein  38.69 
 
 		 810 aa  521  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  38.22 
 
 		 830 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5843  1A family penicillin-binding protein  37.8 
 
 		 808 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.36925  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  41.49 
 
 		 797 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0671  1A family penicillin-binding protein  39.11 
 
 		 805 aa  518  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.152404 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6049  penicillin-binding protein, 1A family  38.26 
 
 		 805 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1918  penicillin-binding protein, 1A family  39.95 
 
 		 812 aa  517  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.176585  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3254  penicillin-binding protein, 1A family  41.76 
 
 		 777 aa  519  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0272171  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2976  penicillin-binding 1 transmembrane protein  41.48 
 
 		 801 aa  513  1e-144  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.893289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3603  penicillin-binding protein, 1A family  39.03 
 
 		 799 aa  513  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00689676  hitchhiker  0.000000108854 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3394  penicillin-binding protein, 1A family  40.03 
 
 		 808 aa  514  1e-144  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.145767  normal  0.859795 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1797  penicillin-binding protein 1a  37.89 
 
 		 818 aa  513  1e-144  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  39.89 
 
 		 796 aa  515  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1298  1A family penicillin-binding protein  37.9 
 
 		 833 aa  513  1e-144  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.144183  normal  0.788784 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0315  1A family penicillin-binding protein  38.82 
 
 		 795 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.640379 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4435  penicillin-binding protein, 1A family  38.69 
 
 		 838 aa  511  1e-143  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0354  putative penicillin-binding 1 (peptoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  39.62 
 
 		 799 aa  509  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  40.03 
 
 		 792 aa  511  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0306  1A family penicillin-binding protein  38.82 
 
 		 797 aa  511  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0023  1A family penicillin-binding protein  40.84 
 
 		 799 aa  507  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5582  1A family penicillin-binding protein  40.19 
 
 		 824 aa  509  9.999999999999999e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0366  1A family penicillin-binding protein  38.66 
 
 		 797 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.941804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2720  penicillin-binding protein 1A  38.82 
 
 		 797 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  39.43 
 
 		 800 aa  507  9.999999999999999e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0387  1A family penicillin-binding protein  38.95 
 
 		 797 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495893  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0209  penicillin-binding protein 1A  38.86 
 
 		 771 aa  505  1e-141  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3486  penicillin-binding protein 1A  38.69 
 
 		 796 aa  503  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3114  peptidoglycan glycosyltransferase  40.34 
 
 		 793 aa  503  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.183749 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  37.47 
 
 		 748 aa  504  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  39.57 
 
 		 766 aa  505  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  40.93 
 
 		 791 aa  500  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0246  penicillin-binding protein 1A  36.59 
 
 		 814 aa  500  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0290  1A family penicillin-binding protein  38.17 
 
 		 797 aa  500  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308967  normal  0.891054 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0024  penicillin-binding protein, 1A family  40.03 
 
 		 802 aa  500  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2091  penicillin-binding protein 1A  36.79 
 
 		 793 aa  497  1e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3949  penicillin-binding protein, 1A family  37.47 
 
 		 805 aa  497  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.665129 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0118  multimodular transpeptidase-transglycosylase PBP 1A  36.66 
 
 		 793 aa  496  1e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3955  penicillin-binding protein, 1A family  36.86 
 
 		 805 aa  496  1e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.755336 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3662  1A family penicillin-binding protein  36.86 
 
 		 833 aa  496  1e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.24 
 
 		 817 aa  494  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0088  penicillin-binding protein, 1A family  39.35 
 
 		 778 aa  495  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0128257 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  36.52 
 
 		 804 aa  494  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1961  putative penicillin-binding (peptidoglycan synthetase) transmembrane protein, mrcA  39.7 
 
 		 836 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.935067  normal  0.0226413 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45310  Penicillin binding protein 1A  35.9 
 
 		 819 aa  489  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1139  penicillin-binding protein, 1A family  40.08 
 
 		 774 aa  490  1e-137  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0388878  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2082  1A family penicillin-binding protein  39.23 
 
 		 840 aa  491  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264276  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  35.82 
 
 		 823 aa  490  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2296  penicillin-binding protein, 1A family  39.7 
 
 		 833 aa  488  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0092  1A family penicillin-binding protein  38.59 
 
 		 778 aa  487  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000436892  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1268  1A family penicillin-binding protein  39.43 
 
 		 786 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00608444  normal  0.905221 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2574  1A family penicillin-binding protein  36.52 
 
 		 791 aa  487  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.95541 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>