More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0209 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_0088  penicillin-binding protein, 1A family  55.88 
 
 
778 aa  830    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0128257 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  57.46 
 
 
779 aa  874    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2976  penicillin-binding 1 transmembrane protein  59.42 
 
 
801 aa  884    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.893289  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3603  penicillin-binding protein, 1A family  60.25 
 
 
799 aa  899    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00689676  hitchhiker  0.000000108854 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1497  1A family penicillin-binding protein  56.43 
 
 
846 aa  855    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178558  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2752  1A family penicillin-binding protein  58.68 
 
 
797 aa  850    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  59.77 
 
 
797 aa  863    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0209  penicillin-binding protein 1A  100 
 
 
771 aa  1581    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1016  penicillin-binding protein 1A  53.3 
 
 
778 aa  773    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0833  penicillin-binding protein, 1A family  57.14 
 
 
807 aa  846    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  57.46 
 
 
791 aa  902    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2369  1A family penicillin-binding protein  56.56 
 
 
852 aa  858    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  53.29 
 
 
793 aa  819    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1752  1A family penicillin-binding protein  58.54 
 
 
770 aa  849    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2518  1A family penicillin-binding protein  56.56 
 
 
840 aa  848    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.316382  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3734  1A family penicillin-binding protein  58.68 
 
 
797 aa  850    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1972  1A family penicillin-binding protein  57.5 
 
 
839 aa  846    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125323  normal  0.0456782 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1321  1A family penicillin-binding protein  58.3 
 
 
837 aa  845    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000393559 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3486  penicillin-binding protein 1A  58.51 
 
 
796 aa  880    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5259  penicillin-binding protein 1A  57.72 
 
 
838 aa  846    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000072806  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1139  penicillin-binding protein, 1A family  58.12 
 
 
774 aa  839    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0388878  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3314  1A family penicillin-binding protein  56.43 
 
 
840 aa  856    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.019725  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2802  1A family penicillin-binding protein  58.54 
 
 
797 aa  848    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.437708  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1948  1A family penicillin-binding protein  57.88 
 
 
839 aa  844    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135129  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5582  1A family penicillin-binding protein  55.97 
 
 
824 aa  850    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  60.06 
 
 
777 aa  903    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1862  1A family penicillin-binding protein  57.74 
 
 
839 aa  843    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.000000145704  hitchhiker  0.0000925337 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2082  1A family penicillin-binding protein  58.75 
 
 
840 aa  860    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3029  1A family penicillin-binding protein  58.17 
 
 
797 aa  842    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2411  1A family penicillin-binding protein  56.56 
 
 
840 aa  848    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0290  1A family penicillin-binding protein  58.95 
 
 
797 aa  880    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308967  normal  0.891054 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1268  1A family penicillin-binding protein  56.43 
 
 
840 aa  856    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0366  1A family penicillin-binding protein  58.81 
 
 
797 aa  880    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.941804  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0917  penicillin-binding protein 1A  49.93 
 
 
752 aa  731    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  58.38 
 
 
797 aa  884    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0024  penicillin-binding protein, 1A family  56.57 
 
 
802 aa  816    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  58.93 
 
 
791 aa  840    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0780  penicillin-binding protein 1A  56.09 
 
 
804 aa  877    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0354  putative penicillin-binding 1 (peptoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  59.78 
 
 
799 aa  901    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1961  putative penicillin-binding (peptidoglycan synthetase) transmembrane protein, mrcA  58 
 
 
836 aa  858    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.935067  normal  0.0226413 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2907  penicillin-binding protein, 1A family  60.26 
 
 
777 aa  882    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0114663 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3254  penicillin-binding protein, 1A family  60.26 
 
 
777 aa  882    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0272171  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  56.81 
 
 
794 aa  875    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  57.78 
 
 
792 aa  898    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3763  1A family penicillin-binding protein  58.54 
 
 
797 aa  849    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.763292  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0092  1A family penicillin-binding protein  57 
 
 
778 aa  838    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000436892  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2720  penicillin-binding protein 1A  58.81 
 
 
797 aa  878    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3705  1A family penicillin-binding protein  58.68 
 
 
797 aa  850    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3114  peptidoglycan glycosyltransferase  56.49 
 
 
793 aa  822    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.183749 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0671  1A family penicillin-binding protein  58.07 
 
 
805 aa  874    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.152404 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6131  penicillin-binding protein 1A  57.88 
 
 
839 aa  844    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353845  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0176  1A family penicillin-binding protein  51.06 
 
 
776 aa  676    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0315  1A family penicillin-binding protein  58.53 
 
 
795 aa  875    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.640379 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1996  1A family penicillin-binding protein  56.43 
 
 
840 aa  856    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.704723  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  59.56 
 
 
796 aa  900    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3201  1A family penicillin-binding protein  58.68 
 
 
797 aa  850    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2296  penicillin-binding protein, 1A family  59.03 
 
 
833 aa  865    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  54.99 
 
 
766 aa  821    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1268  1A family penicillin-binding protein  56.62 
 
 
786 aa  842    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00608444  normal  0.905221 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0306  1A family penicillin-binding protein  58.25 
 
 
797 aa  872    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1935  1A family penicillin-binding protein  57.74 
 
 
839 aa  843    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000247834  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0023  1A family penicillin-binding protein  57.08 
 
 
799 aa  834    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432475  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0387  1A family penicillin-binding protein  58.81 
 
 
797 aa  880    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495893  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.45 
 
 
817 aa  632  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  44.58 
 
 
830 aa  619  1e-176  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0381  1A family penicillin-binding protein  41.85 
 
 
817 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5084  penicillin-binding protein, 1A family  41.46 
 
 
817 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.846696  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4957  1A family penicillin-binding protein  41.46 
 
 
817 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0246  penicillin-binding protein 1A  43.01 
 
 
814 aa  600  1e-170  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  40.81 
 
 
817 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal