More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0324 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 		 802 aa  1637    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2534  1A family penicillin-binding protein  46.84 
 
 		 804 aa  683    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.401637  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3215  penicillin-binding protein, 1A family  61.42 
 
 		 778 aa  943    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2326  1A family penicillin-binding protein  54.78 
 
 		 807 aa  862    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.774073  unclonable  0.0000291309 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1918  penicillin-binding protein, 1A family  49.33 
 
 		 812 aa  689    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.176585  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3124  penicillin-binding protein 1A  57.18 
 
 		 807 aa  910    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2630  penicillin-binding protein, 1A family  55.84 
 
 		 807 aa  883    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  44.4 
 
 		 797 aa  630  1e-179  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  43.43 
 
 		 795 aa  617  1e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  42.48 
 
 		 818 aa  617  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  41.87 
 
 		 841 aa  605  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  43.82 
 
 		 773 aa  600  1e-170  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3133  1A family penicillin-binding protein  42.05 
 
 		 796 aa  598  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  40.84 
 
 		 827 aa  589  1e-167  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  43.13 
 
 		 818 aa  591  1e-167  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2321  1A family penicillin-binding protein  41.31 
 
 		 862 aa  582  1.0000000000000001e-165  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.10527  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  40.46 
 
 		 829 aa  585  1.0000000000000001e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1824  penicillin-binding protein 1A  40.42 
 
 		 843 aa  566  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0792156  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1716  penicillin-binding protein 1A  39.55 
 
 		 831 aa  561  1e-158  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0706575  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2444  penicillin-binding protein 1A  40.2 
 
 		 830 aa  561  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4201  putative membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  40.2 
 
 		 835 aa  561  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603081  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0060  1A family penicillin-binding protein  41.66 
 
 		 852 aa  558  1e-157  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.133649 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2147  penicillin-binding protein 1A  40.71 
 
 		 831 aa  555  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.173589  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4669  1A family penicillin-binding protein  40.56 
 
 		 804 aa  550  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3007  penicillin-binding protein 1A  40.81 
 
 		 830 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.160235 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2730  penicillin-binding protein, 1A family  40.25 
 
 		 832 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2852  penicillin-binding protein 1A  39.93 
 
 		 830 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1395  penicillin-binding protein, 1A family  38.7 
 
 		 809 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47778  normal  0.639288 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3405  1A family penicillin-binding protein  41.38 
 
 		 857 aa  535  1e-151  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0379347  normal  0.659287 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1304  penicillin-binding protein, 1A family  38.71 
 
 		 819 aa  534  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0651627 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1708  1A family penicillin-binding protein  39.04 
 
 		 818 aa  530  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0062  penicillin-binding protein, 1A family  40.61 
 
 		 852 aa  527  1e-148  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0057  penicillin-binding protein 1A  40.92 
 
 		 852 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0916  penicillin-binding protein 1A, putative  37.52 
 
 		 819 aa  524  1e-147  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0074  penicillin-binding protein, 1A family  40.68 
 
 		 852 aa  525  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0246  penicillin-binding protein 1A  38.32 
 
 		 814 aa  520  1e-146  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2266  1A family penicillin-binding protein  37.17 
 
 		 819 aa  521  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0727  penicillin-binding protein, 1A family  37.85 
 
 		 804 aa  519  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0911  putative penicillin-binding protein 1A  37.39 
 
 		 819 aa  521  1e-146  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.477143  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1797  penicillin-binding protein 1a  38.24 
 
 		 818 aa  518  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4359  1A family penicillin-binding protein  38.14 
 
 		 810 aa  511  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0960  1A family penicillin-binding protein  38.11 
 
 		 817 aa  511  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0340726 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  37.67 
 
 		 803 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3949  penicillin-binding protein, 1A family  38.25 
 
 		 805 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.665129 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1298  1A family penicillin-binding protein  36.96 
 
 		 833 aa  507  9.999999999999999e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.144183  normal  0.788784 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2253  1A family penicillin-binding protein  41.47 
 
 		 803 aa  505  1e-141  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.816825  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3955  penicillin-binding protein, 1A family  38.61 
 
 		 805 aa  501  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.755336 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5084  penicillin-binding protein, 1A family  37.93 
 
 		 817 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.846696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  38.3 
 
 		 817 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6049  penicillin-binding protein, 1A family  37.53 
 
 		 805 aa  500  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  38.03 
 
 		 777 aa  499  1e-140  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3276  1A family penicillin-binding protein  39.78 
 
 		 908 aa  502  1e-140  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.658356  normal  0.980736 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3662  1A family penicillin-binding protein  38.04 
 
 		 833 aa  501  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4957  1A family penicillin-binding protein  37.93 
 
 		 817 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0118  multimodular transpeptidase-transglycosylase PBP 1A  39.03 
 
 		 793 aa  498  1e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5843  1A family penicillin-binding protein  37.79 
 
 		 808 aa  496  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.36925  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2091  penicillin-binding protein 1A  39.16 
 
 		 793 aa  499  1e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.36 
 
 		 817 aa  493  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  38.16 
 
 		 830 aa  491  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0402  peptidoglycan glycosyltransferase  36.25 
 
 		 814 aa  491  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.527889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0825  1A family penicillin-binding protein  37.41 
 
 		 846 aa  490  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397118  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0381  1A family penicillin-binding protein  37.16 
 
 		 817 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2574  1A family penicillin-binding protein  39.09 
 
 		 791 aa  491  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.95541 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5133  penicillin-binding protein  36.47 
 
 		 814 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0554788  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0404  penicillin-binding protein 1A  36.5 
 
 		 815 aa  486  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0818527  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  39.39 
 
 		 794 aa  487  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  40.19 
 
 		 779 aa  488  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0780  penicillin-binding protein 1A  40.3 
 
 		 804 aa  487  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4121  1A family penicillin-binding protein  35.75 
 
 		 814 aa  488  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.739203  hitchhiker  0.00000203551 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0934  1A family penicillin-binding protein  36.51 
 
 		 803 aa  488  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.305447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  38.24 
 
 		 800 aa  489  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  38.58 
 
 		 796 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  37.45 
 
 		 804 aa  485  1e-135  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  36.82 
 
 		 823 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4435  penicillin-binding protein, 1A family  38.9 
 
 		 838 aa  483  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  36.58 
 
 		 823 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  36.11 
 
 		 748 aa  481  1e-134  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2715  penicillin-binding protein 1A  34.64 
 
 		 832 aa  482  1e-134  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2212  penicillin-binding protein 1A  35.93 
 
 		 835 aa  478  1e-133  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3603  penicillin-binding protein, 1A family  39.11 
 
 		 799 aa  478  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00689676  hitchhiker  0.000000108854 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0024  penicillin-binding protein, 1A family  41.18 
 
 		 802 aa  477  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  38.7 
 
 		 797 aa  477  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3394  penicillin-binding protein, 1A family  38.7 
 
 		 808 aa  478  1e-133  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.145767  normal  0.859795 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0354  putative penicillin-binding 1 (peptoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  39.23 
 
 		 799 aa  478  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0803  penicillin-binding protein, 1A  35.45 
 
 		 823 aa  477  1e-133  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0671  1A family penicillin-binding protein  37.92 
 
 		 805 aa  478  1e-133  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.152404 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45310  Penicillin binding protein 1A  35.38 
 
 		 819 aa  478  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1321  1A family penicillin-binding protein  39.3 
 
 		 837 aa  473  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000393559 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  40.08 
 
 		 797 aa  474  1e-132  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  35.66 
 
 		 794 aa  474  1e-132  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  35.53 
 
 		 794 aa  475  1e-132  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  38.57 
 
 		 793 aa  474  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  38.81 
 
 		 792 aa  475  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1816  1A family penicillin-binding protein  37.55 
 
 		 845 aa  476  1e-132  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0319957 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1972  1A family penicillin-binding protein  38.95 
 
 		 839 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125323  normal  0.0456782 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  38.32 
 
 		 791 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6131  penicillin-binding protein 1A  39.08 
 
 		 839 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353845  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1862  1A family penicillin-binding protein  39 
 
 		 839 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.000000145704  hitchhiker  0.0000925337 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1935  1A family penicillin-binding protein  39 
 
 		 839 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000247834  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1948  1A family penicillin-binding protein  39.08 
 
 		 839 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>