More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0607 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_5084  penicillin-binding protein, 1A family  45.38 
 
 
817 aa  714    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.846696  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  45.11 
 
 
803 aa  692    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  45.74 
 
 
817 aa  727    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5133  penicillin-binding protein  45.42 
 
 
814 aa  711    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0554788  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0825  1A family penicillin-binding protein  44.13 
 
 
846 aa  667    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397118  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  44.03 
 
 
794 aa  688    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  43.91 
 
 
794 aa  688    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0402  peptidoglycan glycosyltransferase  45.42 
 
 
814 aa  721    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.527889  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0381  1A family penicillin-binding protein  45.5 
 
 
817 aa  717    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.47 
 
 
817 aa  673    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0246  penicillin-binding protein 1A  44.52 
 
 
814 aa  686    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0404  penicillin-binding protein 1A  45.97 
 
 
815 aa  708    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0818527  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00034  penicillin-binding protein 1A  40.31 
 
 
855 aa  639    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2091  penicillin-binding protein 1A  44.52 
 
 
793 aa  701    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0118  multimodular transpeptidase-transglycosylase PBP 1A  44.4 
 
 
793 aa  699    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4121  1A family penicillin-binding protein  45.44 
 
 
814 aa  704    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.739203  hitchhiker  0.00000203551 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4957  1A family penicillin-binding protein  45.38 
 
 
817 aa  714    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2692  penicillin-binding protein  46.34 
 
 
846 aa  739    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000762848  hitchhiker  0.0050562 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  46.43 
 
 
823 aa  724    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0607  penicillin-binding protein 1A  100 
 
 
839 aa  1714    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0360567  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2253  1A family penicillin-binding protein  45.82 
 
 
803 aa  650    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.816825  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0207  1A family penicillin-binding protein  41.74 
 
 
861 aa  640    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0421791 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  46.26 
 
 
800 aa  684    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  46.79 
 
 
823 aa  728    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45310  Penicillin binding protein 1A  44.33 
 
 
819 aa  701    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  42.73 
 
 
830 aa  633  1e-180  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3704  1A family penicillin-binding protein  41.92 
 
 
839 aa  632  1e-180  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2288  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4009  penicillin-binding protein, 1A family  40.97 
 
 
844 aa  630  1e-179  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0280  penicillin-binding protein 1A  42.21 
 
 
839 aa  630  1e-179  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3374  penicillin-binding protein 1A  41.34 
 
 
846 aa  631  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3900  1A family penicillin-binding protein  41.92 
 
 
839 aa  630  1e-179  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247667  normal  0.227457 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  42.21 
 
 
804 aa  629  1e-179  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4090  1A family penicillin-binding protein  40.85 
 
 
844 aa  630  1e-179  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0241  1A family penicillin-binding protein  41.81 
 
 
839 aa  630  1e-179  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4119  1A family penicillin-binding protein  40.85 
 
 
844 aa  630  1e-179  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.922666  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4271  peptidoglycan glycosyltransferase  40.78 
 
 
843 aa  623  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0466  penicillin-binding protein  42.11 
 
 
863 aa  619  1e-176  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4208  1A family penicillin-binding protein  41.29 
 
 
822 aa  619  1e-176  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3712  1A family penicillin-binding protein  41.57 
 
 
839 aa  622  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.637834  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0232  1A family penicillin-binding protein  41.25 
 
 
849 aa  619  1e-176  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.748115  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0255  penicillin-binding protein 1A  41.52 
 
 
865 aa  616  1e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0334  1A family penicillin-binding protein  40.59 
 
 
847 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002321  multimodular transpeptidase-transglycosylase  40.53 
 
 
825 aa  613  9.999999999999999e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000241558  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0369  penicillin-binding protein, 1A family protein  40.67 
 
 
885 aa  609  1e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0358767  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1884  penicillin-binding protein 1A  38.62 
 
 
868 aa  606  9.999999999999999e-173  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00516  bifunctional murein transglycosylase/transpeptidase  40.44 
 
 
887 aa  605  9.999999999999999e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0723  1A family penicillin-binding protein  39.46 
 
 
866 aa  601  1e-170  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1936  penicillin-binding protein, 1A family  41.14 
 
 
790 aa  595  1e-168  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2212  penicillin-binding protein 1A  39.08 
 
 
835 aa  590  1e-167  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2715  penicillin-binding protein 1A  37.4 
 
 
832 aa  586  1e-166  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3972  peptidoglycan synthetase  39.34 
 
 
851 aa  583  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0219  peptidoglycan synthetase  39.34 
 
 
851 aa  583  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3733  peptidoglycan synthetase  39.34 
 
 
851 aa  583  1.0000000000000001e-165  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0253  peptidoglycan synthetase  38.68 
 
 
852 aa  582  1e-164  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.570569  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0157  penicillin-binding protein, 1A family protein  38.47 
 
 
851 aa  574  1.0000000000000001e-162  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3241  penicillin-binding protein, 1A family  40.98 
 
 
807 aa  574  1.0000000000000001e-162  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3862  peptidoglycan synthetase  38.52 
 
 
850 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4067  peptidoglycan synthetase  38.58 
 
 
851 aa  570  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3799  peptidoglycan synthetase  38.64 
 
 
850 aa  571  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3690  peptidoglycan synthetase  38.52 
 
 
850 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3765  peptidoglycan synthetase  38.64 
 
 
850 aa  571  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3692  peptidoglycan synthetase  38.64 
 
 
850 aa  571  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3889  peptidoglycan synthetase  37.54 
 
 
851 aa  570  1e-161  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3603  penicillin-binding protein, 1A family  40.71 
 
 
799 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00689676  hitchhiker  0.000000108854 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3809  peptidoglycan synthetase  38.17 
 
 
850 aa  564  1.0000000000000001e-159  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  39.36 
 
 
791 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03248  fused penicillin-binding protein 1a: murein transglycosylase/murein transpeptidase  37.65 
 
 
850 aa  556  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.952695  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0317  penicillin-binding protein, 1A family  37.65 
 
 
850 aa  556  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0332  peptidoglycan synthetase  38.01 
 
 
851 aa  557  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3673  peptidoglycan synthetase  37.24 
 
 
858 aa  556  1e-157  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0454505  normal  0.370172 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1861  peptidoglycan glycosyltransferase  40.81 
 
 
854 aa  556  1e-157  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.894237  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3867  peptidoglycan synthetase  37.65 
 
 
850 aa  556  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.505357  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  38.99 
 
 
777 aa  558  1e-157  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0317  peptidoglycan synthetase  37.65 
 
 
850 aa  557  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.47804  normal  0.149248 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0354  putative penicillin-binding 1 (peptoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  40.59 
 
 
799 aa  558  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3591  peptidoglycan synthetase  37.65 
 
 
850 aa  557  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.322941  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0274  penicillin-binding protein, 1A family  41.17 
 
 
790 aa  558  1e-157  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.565405  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  39.82 
 
 
796 aa  555  1e-156  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3773  peptidoglycan synthetase  37.53 
 
 
850 aa  553  1e-156  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4701  peptidoglycan synthetase  37.53 
 
 
850 aa  555  1e-156  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0315  1A family penicillin-binding protein  39.39 
 
 
795 aa  549  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.640379 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4611  peptidoglycan synthetase  36.3 
 
 
852 aa  549  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.241075  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1790  1A family penicillin-binding protein  39.88 
 
 
809 aa  552  1e-155  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2296  penicillin-binding protein, 1A family  39.95 
 
 
833 aa  545  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0306  1A family penicillin-binding protein  39.16 
 
 
797 aa  545  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  39.72 
 
 
793 aa  540  9.999999999999999e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3486  penicillin-binding protein 1A  39.49 
 
 
796 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0366  1A family penicillin-binding protein  39.49 
 
 
797 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.941804  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0290  1A family penicillin-binding protein  39.23 
 
 
797 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308967  normal  0.891054 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  40 
 
 
794 aa  537  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3201  1A family penicillin-binding protein  40.53 
 
 
797 aa  538  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2752  1A family penicillin-binding protein  40.53 
 
 
797 aa  538  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3734  1A family penicillin-binding protein  40.53 
 
 
797 aa  538  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3705  1A family penicillin-binding protein  40.53 
 
 
797 aa  538  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2174  penicillin-binding protein 1A  40.21 
 
 
897 aa  538  1e-151  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.354055 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2802  1A family penicillin-binding protein  40.41 
 
 
797 aa  536  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.437708  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2720  penicillin-binding protein 1A  39.24 
 
 
797 aa  538  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3763  1A family penicillin-binding protein  40.53 
 
 
797 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.763292  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  40.13 
 
 
779 aa  538  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0387  1A family penicillin-binding protein  39.24 
 
 
797 aa  538  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>