More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0080 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  68.42 
 
 		 662 aa  929    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  64.48 
 
 		 744 aa  852    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  64.74 
 
 		 701 aa  854    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  67.77 
 
 		 693 aa  934    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  64.13 
 
 		 656 aa  822    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  71.08 
 
 		 667 aa  966    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 		 704 aa  1444    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  38.84 
 
 		 661 aa  437  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  39.8 
 
 		 648 aa  439  1e-121  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  41.18 
 
 		 761 aa  420  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  37.15 
 
 		 646 aa  410  1e-113  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  38.46 
 
 		 806 aa  409  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  37.56 
 
 		 649 aa  409  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  37.95 
 
 		 668 aa  392  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  36.74 
 
 		 727 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0290  1A family penicillin-binding protein  38.04 
 
 		 757 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  34.98 
 
 		 683 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  37.17 
 
 		 681 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  38.19 
 
 		 765 aa  375  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  37.12 
 
 		 905 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  36.26 
 
 		 683 aa  369  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  36.26 
 
 		 683 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  36.26 
 
 		 683 aa  369  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  36.09 
 
 		 683 aa  367  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  36.26 
 
 		 683 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  37.61 
 
 		 618 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  36.74 
 
 		 648 aa  369  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  36.62 
 
 		 751 aa  369  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  36.26 
 
 		 683 aa  366  1e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  35.58 
 
 		 683 aa  365  2e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  36.09 
 
 		 683 aa  364  4e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  38.57 
 
 		 643 aa  364  4e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  38.57 
 
 		 643 aa  364  4e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4779  1A family penicillin-binding protein  38.23 
 
 		 705 aa  363  4e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.819685 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  35.92 
 
 		 683 aa  363  6e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1892  penicillin-binding protein 1A  36.27 
 
 		 655 aa  362  1e-98  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  35.92 
 
 		 683 aa  362  1e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5424  penicillin-binding protein 1A  38.05 
 
 		 709 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4831  1A family penicillin-binding protein  36.88 
 
 		 709 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5438  1A family penicillin-binding protein  38.05 
 
 		 709 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  35.35 
 
 		 828 aa  362  2e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0339  1A family penicillin-binding protein  37.78 
 
 		 713 aa  360  5e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0432  1A family penicillin-binding protein  37.78 
 
 		 713 aa  360  5e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  37.78 
 
 		 713 aa  360  5e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  36.26 
 
 		 707 aa  360  7e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  38.01 
 
 		 643 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3332  1A family penicillin-binding protein  37.14 
 
 		 714 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741858  hitchhiker  0.0086967 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1832  1A family penicillin-binding protein  37.65 
 
 		 713 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.421648  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0832  1A family penicillin-binding protein  37.65 
 
 		 713 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313161  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1123  1A family penicillin-binding protein  37.65 
 
 		 713 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438177  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  39.66 
 
 		 734 aa  356  6.999999999999999e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5322  1A family penicillin-binding protein  37.71 
 
 		 714 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  38.08 
 
 		 712 aa  354  2.9999999999999997e-96  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2145  1A family penicillin-binding protein  36.41 
 
 		 710 aa  354  2.9999999999999997e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  32.94 
 
 		 683 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  35.93 
 
 		 727 aa  354  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2871  1A family penicillin-binding protein  38.33 
 
 		 860 aa  351  3e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  37.06 
 
 		 811 aa  348  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2885  penicillin-binding protein, 1A family  34.83 
 
 		 705 aa  348  2e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.060613  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  35.97 
 
 		 654 aa  348  2e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0597  penicillin-binding protein, 1A family  34.41 
 
 		 665 aa  345  1e-93  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2557  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1B  36.59 
 
 		 778 aa  345  2e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000207966  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  37.36 
 
 		 625 aa  345  2e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  40.11 
 
 		 732 aa  343  4e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  37.22 
 
 		 776 aa  342  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1948  1A family penicillin-binding protein  36.57 
 
 		 855 aa  341  2e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2797  penicillin-binding protein, 1A family  37.56 
 
 		 677 aa  340  7e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0163  1A family penicillin-binding protein  32.37 
 
 		 713 aa  338  1.9999999999999998e-91  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3834  1A family penicillin-binding protein  36.56 
 
 		 861 aa  338  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  33.5 
 
 		 638 aa  337  5.999999999999999e-91  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2605  1A family penicillin-binding protein  36.45 
 
 		 853 aa  336  9e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  37.95 
 
 		 739 aa  336  1e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  38.4 
 
 		 734 aa  335  2e-90  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1421  penicillin-binding protein, 1A family  35.58 
 
 		 801 aa  335  2e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  32.37 
 
 		 829 aa  334  3e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  38.37 
 
 		 720 aa  334  4e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  36.64 
 
 		 640 aa  333  5e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  39.43 
 
 		 723 aa  332  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  36.85 
 
 		 770 aa  330  4e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  30.82 
 
 		 760 aa  330  7e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  37.43 
 
 		 735 aa  329  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  35.75 
 
 		 640 aa  328  2.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  37.84 
 
 		 728 aa  327  3e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  33.16 
 
 		 641 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  38.15 
 
 		 709 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  34.68 
 
 		 676 aa  327  4.0000000000000003e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  34.78 
 
 		 814 aa  327  5e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  32.19 
 
 		 642 aa  327  6e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  37.44 
 
 		 691 aa  326  7e-88  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  37.82 
 
 		 714 aa  326  8.000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  35.81 
 
 		 679 aa  326  9e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  37.48 
 
 		 727 aa  326  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  37.43 
 
 		 727 aa  326  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  35.51 
 
 		 757 aa  326  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  35.83 
 
 		 824 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3225  1A family penicillin-binding protein  36.75 
 
 		 952 aa  324  3e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00720883  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  36.96 
 
 		 712 aa  324  4e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  37.91 
 
 		 714 aa  324  4e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  36.49 
 
 		 720 aa  323  5e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  31.57 
 
 		 642 aa  323  5e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>