More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1646 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  49.2 
 
 		 727 aa  664    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  49.38 
 
 		 761 aa  692    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 		 828 aa  1711    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  51.73 
 
 		 765 aa  758    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  49.6 
 
 		 727 aa  689    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  40.7 
 
 		 905 aa  546  1e-154  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  45.57 
 
 		 709 aa  509  1e-143  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  39.81 
 
 		 880 aa  490  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  34.97 
 
 		 795 aa  471  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1812  penicillin-binding protein, 1A family  35.35 
 
 		 941 aa  461  9.999999999999999e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.022556  normal  0.0842954 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  38.46 
 
 		 806 aa  455  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  36.35 
 
 		 814 aa  452  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2069  penicillin-binding protein, 1A family  34.65 
 
 		 843 aa  417  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.23157 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0378  penicillin-binding protein, 1A family  37.41 
 
 		 706 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2107  penicillin-binding protein, 1A family  37.75 
 
 		 912 aa  396  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1760  1A family penicillin-binding protein  33.69 
 
 		 824 aa  388  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590244  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0511  penicillin-binding protein, 1A family  37.68 
 
 		 901 aa  388  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  37.08 
 
 		 648 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  38.47 
 
 		 640 aa  380  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  37.65 
 
 		 643 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  38 
 
 		 618 aa  374  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2312  penicillin-binding protein 1A  37.54 
 
 		 830 aa  373  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  38.01 
 
 		 643 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  38.01 
 
 		 643 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  33.09 
 
 		 829 aa  370  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1722  1A family penicillin-binding protein  35.65 
 
 		 836 aa  366  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.278842  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  33.99 
 
 		 680 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1547  penicillin-binding protein  34.14 
 
 		 667 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000544476 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  35.4 
 
 		 661 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5637  1A family penicillin-binding protein  36.21 
 
 		 794 aa  369  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.751111  normal  0.833891 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3013  penicillin-binding protein 1A/1B  37.39 
 
 		 832 aa  369  1e-100  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.462523 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2153  1A family penicillin-binding protein  37.18 
 
 		 839 aa  368  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1272  1A family penicillin-binding protein  37.7 
 
 		 865 aa  367  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.932198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3835  penicillin-binding protein 1F (PBP-1F)  34.9 
 
 		 680 aa  365  2e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288255  hitchhiker  0.000000000138665 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  33.29 
 
 		 693 aa  365  2e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1180  1A family penicillin-binding protein  36.16 
 
 		 679 aa  364  3e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000474619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2345  penicillin-binding protein 1A  36.79 
 
 		 820 aa  365  3e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.538811  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  34.04 
 
 		 680 aa  364  4e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1336  penicillin-binding protein 2A  33.99 
 
 		 680 aa  363  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000691863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1363  penicillin-binding protein  33.84 
 
 		 673 aa  363  6e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000333103  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  37.1 
 
 		 640 aa  363  6e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1474  penicillin-binding protein  33.84 
 
 		 673 aa  363  6e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0083684  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  34.33 
 
 		 704 aa  363  6e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  36.97 
 
 		 705 aa  363  6e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2185  penicillin-binding protein 1A  36.79 
 
 		 846 aa  363  7.0000000000000005e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.704699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2122  penicillin-binding protein 1A  36.79 
 
 		 834 aa  363  9e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0988  1A family penicillin-binding protein  36.05 
 
 		 746 aa  362  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1578  penicillin-binding protein  33.99 
 
 		 680 aa  361  2e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2108  penicillin-binding protein 1A  36.49 
 
 		 835 aa  361  2e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.60098  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1616  penicillin-binding protein  33.99 
 
 		 680 aa  362  2e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2364  penicillin-binding protein 1A  36.64 
 
 		 834 aa  361  4e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2447  penicillin-binding protein 1A  36.47 
 
 		 837 aa  360  6e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0929548  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2605  1A family penicillin-binding protein  34.57 
 
 		 853 aa  360  6e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2370  penicillin-binding protein 1A  36.38 
 
 		 837 aa  360  7e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0572853  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  36.88 
 
 		 712 aa  360  7e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  35.84 
 
 		 776 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1378  1A family penicillin-binding protein  34.2 
 
 		 679 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  34.38 
 
 		 646 aa  357  5.999999999999999e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1605  penicillin-binding protein  36.76 
 
 		 897 aa  357  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1431  penicillin-binding protein  37.22 
 
 		 897 aa  355  1e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1474  1A family penicillin-binding protein  35.33 
 
 		 914 aa  356  1e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  36.69 
 
 		 648 aa  355  2e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1458  penicillin-binding protein  36.17 
 
 		 896 aa  354  4e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.126444  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1430  penicillin-binding protein  36.17 
 
 		 897 aa  354  4e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.14042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1643  penicillin-binding protein  36.17 
 
 		 897 aa  354  4e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00351839 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1572  penicillin-binding protein  36.17 
 
 		 897 aa  354  4e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1716  penicillin-binding protein  36.17 
 
 		 900 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.749983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4203  penicillin-binding protein 1  35.13 
 
 		 705 aa  353  7e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  33.53 
 
 		 662 aa  353  8e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2876  glycosyl transferase family 51  32.12 
 
 		 861 aa  352  2e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.186058  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  36.67 
 
 		 761 aa  352  2e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  35.67 
 
 		 649 aa  352  2e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1166  penicillin-binding protein 1  35.56 
 
 		 746 aa  351  3e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0998  penicillin-binding protein 1  35.4 
 
 		 705 aa  350  5e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1069  penicillin-binding protein 1  35.4 
 
 		 705 aa  350  5e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1102  penicillin-binding protein 1  34.97 
 
 		 705 aa  350  5e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1678  penicillin-binding protein  35.87 
 
 		 905 aa  350  7e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0983  penicillin-binding protein 1  35.24 
 
 		 705 aa  350  7e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  35.03 
 
 		 755 aa  350  8e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0985  penicillin-binding protein 1  35.07 
 
 		 705 aa  349  1e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1151  penicillin-binding protein 1  35.07 
 
 		 705 aa  349  1e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  35.24 
 
 		 656 aa  348  2e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  34.81 
 
 		 744 aa  348  3e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  34.81 
 
 		 701 aa  348  3e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3739  penicillin-binding protein  36.48 
 
 		 647 aa  348  3e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  35.93 
 
 		 708 aa  346  8e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1229  penicillin-binding protein 1  34.75 
 
 		 705 aa  343  5e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  34.75 
 
 		 654 aa  344  5e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  34.84 
 
 		 667 aa  343  1e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  33.72 
 
 		 642 aa  340  5e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  34.19 
 
 		 625 aa  339  9.999999999999999e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  32.95 
 
 		 668 aa  339  9.999999999999999e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  33.04 
 
 		 642 aa  338  2.9999999999999997e-91  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  34.9 
 
 		 824 aa  337  5.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  36.15 
 
 		 824 aa  337  7e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1421  penicillin-binding protein, 1A family  33.42 
 
 		 801 aa  335  2e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2871  1A family penicillin-binding protein  34.55 
 
 		 860 aa  333  8e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0597  penicillin-binding protein, 1A family  32.5 
 
 		 665 aa  332  2e-89  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  34.22 
 
 		 658 aa  330  7e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  36.53 
 
 		 676 aa  330  8e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>