More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2107 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_2370  penicillin-binding protein 1A  51.44 
 
 		 837 aa  656    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0572853  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2447  penicillin-binding protein 1A  51.14 
 
 		 837 aa  652    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0929548  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2185  penicillin-binding protein 1A  51.82 
 
 		 846 aa  662    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.704699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2122  penicillin-binding protein 1A  51.82 
 
 		 834 aa  662    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2108  penicillin-binding protein 1A  51.52 
 
 		 835 aa  658    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.60098  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2364  penicillin-binding protein 1A  51.52 
 
 		 834 aa  657    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0511  penicillin-binding protein, 1A family  75.92 
 
 		 901 aa  1197    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3013  penicillin-binding protein 1A/1B  51.44 
 
 		 832 aa  658    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.462523 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2345  penicillin-binding protein 1A  51.82 
 
 		 820 aa  661    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.538811  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2107  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 		 912 aa  1880    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1272  1A family penicillin-binding protein  45.29 
 
 		 865 aa  640    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.932198  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1722  1A family penicillin-binding protein  51.58 
 
 		 836 aa  653    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.278842  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2153  1A family penicillin-binding protein  51.52 
 
 		 839 aa  665    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2312  penicillin-binding protein 1A  51.75 
 
 		 830 aa  657    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5637  1A family penicillin-binding protein  49.39 
 
 		 794 aa  624  1e-177  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.751111  normal  0.833891 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1474  1A family penicillin-binding protein  43.2 
 
 		 914 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1430  penicillin-binding protein  43.31 
 
 		 897 aa  599  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.14042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1431  penicillin-binding protein  43.56 
 
 		 897 aa  600  1e-170  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1643  penicillin-binding protein  43.31 
 
 		 897 aa  599  1e-170  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00351839 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1458  penicillin-binding protein  43.31 
 
 		 896 aa  598  1e-169  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.126444  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1716  penicillin-binding protein  43.06 
 
 		 900 aa  597  1e-169  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.749983  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1572  penicillin-binding protein  43.31 
 
 		 897 aa  598  1e-169  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1678  penicillin-binding protein  42.8 
 
 		 905 aa  595  1e-168  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1605  penicillin-binding protein  43.36 
 
 		 897 aa  591  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3739  penicillin-binding protein  48.84 
 
 		 647 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1025  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  42.64 
 
 		 791 aa  489  1e-137  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1538  glycosyl transferase family protein  42.25 
 
 		 727 aa  478  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1509  glycosyl transferase family protein  42.25 
 
 		 727 aa  478  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0920  1A family penicillin-binding protein  41.09 
 
 		 754 aa  475  1e-132  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1020  penicillin-binding protein 2  40.41 
 
 		 743 aa  464  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0277  penicillin-binding protein 1A  38.12 
 
 		 773 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0298  penicillin-binding protein 1A  39.17 
 
 		 750 aa  434  1e-120  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.376505  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  39.85 
 
 		 765 aa  435  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0542  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  40.29 
 
 		 623 aa  418  9.999999999999999e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.158296  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0651  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  39.4 
 
 		 730 aa  417  9.999999999999999e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.188168  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1095  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  38.43 
 
 		 879 aa  410  1e-113  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  37.8 
 
 		 761 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  35.41 
 
 		 795 aa  401  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  42.73 
 
 		 709 aa  394  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  37.93 
 
 		 905 aa  391  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  38.06 
 
 		 828 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  38.36 
 
 		 727 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  35.9 
 
 		 880 aa  386  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  35.59 
 
 		 814 aa  366  1e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  38.76 
 
 		 727 aa  355  2e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1151  penicillin-binding protein 1  35.51 
 
 		 705 aa  353  5.9999999999999994e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0983  penicillin-binding protein 1  35.51 
 
 		 705 aa  353  1e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1229  penicillin-binding protein 1  35.36 
 
 		 705 aa  353  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0998  penicillin-binding protein 1  35.36 
 
 		 705 aa  352  2e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0985  penicillin-binding protein 1  35.36 
 
 		 705 aa  352  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1069  penicillin-binding protein 1  35.36 
 
 		 705 aa  352  2e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1166  penicillin-binding protein 1  35.52 
 
 		 746 aa  350  5e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0988  1A family penicillin-binding protein  35.3 
 
 		 746 aa  345  2e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  35.1 
 
 		 806 aa  345  2.9999999999999997e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4203  penicillin-binding protein 1  35.76 
 
 		 705 aa  345  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  35.37 
 
 		 680 aa  343  9e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  36.1 
 
 		 829 aa  343  1e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1102  penicillin-binding protein 1  35.28 
 
 		 705 aa  343  1e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1547  penicillin-binding protein  36.65 
 
 		 667 aa  342  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000544476 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1616  penicillin-binding protein  36.65 
 
 		 680 aa  340  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1578  penicillin-binding protein  36.48 
 
 		 680 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1336  penicillin-binding protein 2A  36.48 
 
 		 680 aa  339  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000691863  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  34.77 
 
 		 680 aa  338  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1378  1A family penicillin-binding protein  34.44 
 
 		 679 aa  338  2.9999999999999997e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1363  penicillin-binding protein  36.12 
 
 		 673 aa  337  7e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000333103  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1474  penicillin-binding protein  36.12 
 
 		 673 aa  337  7e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0083684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3835  penicillin-binding protein 1F (PBP-1F)  36.12 
 
 		 680 aa  336  1e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288255  hitchhiker  0.000000000138665 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  33.28 
 
 		 705 aa  336  1e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0378  penicillin-binding protein, 1A family  34.04 
 
 		 706 aa  335  3e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1760  1A family penicillin-binding protein  34.94 
 
 		 824 aa  332  1e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590244  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1180  1A family penicillin-binding protein  35.87 
 
 		 679 aa  332  2e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000474619  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1812  penicillin-binding protein, 1A family  32.43 
 
 		 941 aa  327  6e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.022556  normal  0.0842954 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1269  1A family penicillin-binding protein  34.49 
 
 		 721 aa  320  7e-86  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000185819  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2066  penicillin-binding protein 2A  35.1 
 
 		 773 aa  314  4.999999999999999e-84  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  36.07 
 
 		 618 aa  311  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0346  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.15 
 
 		 863 aa  310  6.999999999999999e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  35.62 
 
 		 648 aa  310  9e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1452  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.83 
 
 		 685 aa  310  1.0000000000000001e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0260  penicillin-binding protein 2A  32.97 
 
 		 775 aa  307  7e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.882065  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2069  penicillin-binding protein, 1A family  32.37 
 
 		 843 aa  306  1.0000000000000001e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.23157 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  35.42 
 
 		 761 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  34.41 
 
 		 649 aa  303  1e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0900  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  35.18 
 
 		 687 aa  302  2e-80  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.813992  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1213  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  36.13 
 
 		 686 aa  302  2e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0924333  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  33.14 
 
 		 681 aa  301  4e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  34.31 
 
 		 643 aa  296  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  34.31 
 
 		 643 aa  296  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1065  penicillin-binding protein 1A  34.1 
 
 		 890 aa  295  3e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.375339  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  35.73 
 
 		 643 aa  294  4e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  35.63 
 
 		 734 aa  290  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  33.81 
 
 		 661 aa  288  4e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2876  glycosyl transferase family 51  33.43 
 
 		 861 aa  287  5e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.186058  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  34.81 
 
 		 776 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  32.84 
 
 		 708 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  31.65 
 
 		 683 aa  283  1e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  33.12 
 
 		 833 aa  283  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  33.75 
 
 		 751 aa  282  2e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  35.53 
 
 		 654 aa  282  2e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2410  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.28 
 
 		 743 aa  282  2e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  30.54 
 
 		 760 aa  281  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>