More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0277 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0298  penicillin-binding protein 1A  62.8 
 
 		 750 aa  848    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.376505  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0277  penicillin-binding protein 1A  100 
 
 		 773 aa  1573    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0542  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  48.57 
 
 		 623 aa  582  1.0000000000000001e-165  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.158296  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0920  1A family penicillin-binding protein  42.41 
 
 		 754 aa  477  1e-133  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1025  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  42.99 
 
 		 791 aa  475  1e-132  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0651  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  42.11 
 
 		 730 aa  448  1.0000000000000001e-124  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.188168  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2107  penicillin-binding protein, 1A family  38.76 
 
 		 912 aa  439  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1095  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  39.73 
 
 		 879 aa  430  1e-119  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1722  1A family penicillin-binding protein  38.46 
 
 		 836 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.278842  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5637  1A family penicillin-binding protein  35.42 
 
 		 794 aa  413  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.751111  normal  0.833891 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3013  penicillin-binding protein 1A/1B  37.5 
 
 		 832 aa  415  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.462523 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2312  penicillin-binding protein 1A  37.35 
 
 		 830 aa  411  1e-113  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2185  penicillin-binding protein 1A  37.67 
 
 		 846 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.704699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2345  penicillin-binding protein 1A  37.67 
 
 		 820 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.538811  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2122  penicillin-binding protein 1A  37.52 
 
 		 834 aa  405  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0511  penicillin-binding protein, 1A family  38.57 
 
 		 901 aa  404  1e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2364  penicillin-binding protein 1A  37.37 
 
 		 834 aa  403  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2153  1A family penicillin-binding protein  35.27 
 
 		 839 aa  404  1e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2108  penicillin-binding protein 1A  37.44 
 
 		 835 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.60098  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2447  penicillin-binding protein 1A  36.28 
 
 		 837 aa  395  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0929548  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2370  penicillin-binding protein 1A  35.96 
 
 		 837 aa  395  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0572853  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1678  penicillin-binding protein  37.31 
 
 		 905 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1458  penicillin-binding protein  37.14 
 
 		 896 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.126444  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1431  penicillin-binding protein  37.14 
 
 		 897 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1572  penicillin-binding protein  37.14 
 
 		 897 aa  386  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1716  penicillin-binding protein  37.01 
 
 		 900 aa  385  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.749983  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1430  penicillin-binding protein  37.14 
 
 		 897 aa  386  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.14042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1643  penicillin-binding protein  37.14 
 
 		 897 aa  386  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00351839 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1605  penicillin-binding protein  36.53 
 
 		 897 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1272  1A family penicillin-binding protein  35.77 
 
 		 865 aa  377  1e-103  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.932198  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1474  1A family penicillin-binding protein  36.24 
 
 		 914 aa  376  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3739  penicillin-binding protein  37.42 
 
 		 647 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  37.73 
 
 		 905 aa  325  1e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1509  glycosyl transferase family protein  32.24 
 
 		 727 aa  314  3.9999999999999997e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1538  glycosyl transferase family protein  32.24 
 
 		 727 aa  314  3.9999999999999997e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  33.09 
 
 		 880 aa  311  4e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  35.31 
 
 		 727 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  33.44 
 
 		 727 aa  301  4e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  35.24 
 
 		 709 aa  300  5e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  33.01 
 
 		 795 aa  298  2e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  34.11 
 
 		 761 aa  298  3e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  32.23 
 
 		 765 aa  298  3e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1020  penicillin-binding protein 2  32.25 
 
 		 743 aa  283  8.000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  31.9 
 
 		 814 aa  280  5e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1812  penicillin-binding protein, 1A family  31.48 
 
 		 941 aa  278  3e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.022556  normal  0.0842954 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  32.22 
 
 		 828 aa  278  4e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  31.41 
 
 		 638 aa  271  4e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  32.04 
 
 		 806 aa  269  1e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1180  1A family penicillin-binding protein  33.67 
 
 		 679 aa  269  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000474619  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  33.06 
 
 		 680 aa  268  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1760  1A family penicillin-binding protein  33.03 
 
 		 824 aa  266  8.999999999999999e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590244  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1378  1A family penicillin-binding protein  32.34 
 
 		 679 aa  265  3e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3835  penicillin-binding protein 1F (PBP-1F)  33.62 
 
 		 680 aa  264  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288255  hitchhiker  0.000000000138665 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0378  penicillin-binding protein, 1A family  32.44 
 
 		 706 aa  263  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1547  penicillin-binding protein  33.81 
 
 		 667 aa  263  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000544476 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1363  penicillin-binding protein  33.45 
 
 		 673 aa  262  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000333103  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  33.81 
 
 		 680 aa  261  2e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1474  penicillin-binding protein  33.45 
 
 		 673 aa  262  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0083684  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1578  penicillin-binding protein  33.63 
 
 		 680 aa  261  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1336  penicillin-binding protein 2A  33.28 
 
 		 680 aa  261  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000691863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1616  penicillin-binding protein  33.45 
 
 		 680 aa  260  7e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  30.25 
 
 		 705 aa  258  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  31.4 
 
 		 646 aa  258  4e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  34.07 
 
 		 751 aa  257  5e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  32.52 
 
 		 676 aa  257  6e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0998  penicillin-binding protein 1  30.17 
 
 		 705 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0983  penicillin-binding protein 1  30.17 
 
 		 705 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1069  penicillin-binding protein 1  30.17 
 
 		 705 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1151  penicillin-binding protein 1  30.17 
 
 		 705 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1166  penicillin-binding protein 1  29.91 
 
 		 746 aa  255  3e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  30.97 
 
 		 710 aa  254  3e-66  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2876  glycosyl transferase family 51  30.58 
 
 		 861 aa  254  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.186058  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0985  penicillin-binding protein 1  30.02 
 
 		 705 aa  254  6e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  31.68 
 
 		 829 aa  253  8.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  31.69 
 
 		 761 aa  251  4e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4203  penicillin-binding protein 1  30.14 
 
 		 705 aa  250  6e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1229  penicillin-binding protein 1  29.86 
 
 		 705 aa  250  8e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1102  penicillin-binding protein 1  30.76 
 
 		 705 aa  249  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  30.3 
 
 		 732 aa  247  6e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1269  1A family penicillin-binding protein  31.42 
 
 		 721 aa  245  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000185819  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0597  penicillin-binding protein, 1A family  31.5 
 
 		 665 aa  245  1.9999999999999999e-63  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1930  membrane carboxypeptidase mrcB  29.45 
 
 		 820 aa  245  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1032  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  31.24 
 
 		 645 aa  244  3e-63  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00344643  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  30.76 
 
 		 734 aa  244  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0988  1A family penicillin-binding protein  29.71 
 
 		 746 aa  243  7e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  31.13 
 
 		 651 aa  243  1e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2218  1A family penicillin-binding protein  29.13 
 
 		 830 aa  243  1e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  29.14 
 
 		 642 aa  240  6.999999999999999e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  29.55 
 
 		 734 aa  240  9e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  31.45 
 
 		 710 aa  239  1e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1574  penicillin-binding protein 1A  33.51 
 
 		 692 aa  238  5.0000000000000005e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  32.77 
 
 		 649 aa  237  5.0000000000000005e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  31.04 
 
 		 679 aa  237  6e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  32.74 
 
 		 680 aa  236  1.0000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  31.3 
 
 		 757 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2069  penicillin-binding protein, 1A family  30.3 
 
 		 843 aa  235  2.0000000000000002e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.23157 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  30.97 
 
 		 708 aa  234  4.0000000000000004e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  28.46 
 
 		 739 aa  234  6e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  30.23 
 
 		 641 aa  233  8.000000000000001e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  30.96 
 
 		 776 aa  233  8.000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>