More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0542 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_0542  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  100 
 
 		 623 aa  1270    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.158296  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0277  penicillin-binding protein 1A  48.57 
 
 		 773 aa  581  1e-164  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0298  penicillin-binding protein 1A  50.58 
 
 		 750 aa  571  1e-161  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.376505  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1025  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  44.05 
 
 		 791 aa  448  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0651  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  42.55 
 
 		 730 aa  429  1e-118  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.188168  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2107  penicillin-binding protein, 1A family  41.16 
 
 		 912 aa  415  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1095  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  41.71 
 
 		 879 aa  410  1e-113  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0920  1A family penicillin-binding protein  40.99 
 
 		 754 aa  407  1.0000000000000001e-112  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1722  1A family penicillin-binding protein  39.67 
 
 		 836 aa  392  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.278842  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2364  penicillin-binding protein 1A  39.74 
 
 		 834 aa  393  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2122  penicillin-binding protein 1A  39.41 
 
 		 834 aa  390  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2108  penicillin-binding protein 1A  39.74 
 
 		 835 aa  392  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.60098  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0511  penicillin-binding protein, 1A family  41.03 
 
 		 901 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2312  penicillin-binding protein 1A  40.19 
 
 		 830 aa  391  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2185  penicillin-binding protein 1A  39.25 
 
 		 846 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.704699  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1272  1A family penicillin-binding protein  40.27 
 
 		 865 aa  386  1e-106  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.932198  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2345  penicillin-binding protein 1A  39.25 
 
 		 820 aa  388  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.538811  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3013  penicillin-binding protein 1A/1B  40.03 
 
 		 832 aa  385  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.462523 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2370  penicillin-binding protein 1A  39.84 
 
 		 837 aa  383  1e-105  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0572853  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2447  penicillin-binding protein 1A  39.45 
 
 		 837 aa  383  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0929548  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2153  1A family penicillin-binding protein  39.87 
 
 		 839 aa  381  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1678  penicillin-binding protein  40.03 
 
 		 905 aa  378  1e-103  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1458  penicillin-binding protein  40.2 
 
 		 896 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.126444  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1430  penicillin-binding protein  40.2 
 
 		 897 aa  375  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.14042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1431  penicillin-binding protein  40.2 
 
 		 897 aa  377  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1605  penicillin-binding protein  39.59 
 
 		 897 aa  376  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3739  penicillin-binding protein  39.53 
 
 		 647 aa  376  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1572  penicillin-binding protein  40.2 
 
 		 897 aa  376  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1643  penicillin-binding protein  40.2 
 
 		 897 aa  376  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00351839 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1716  penicillin-binding protein  40.2 
 
 		 900 aa  375  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.749983  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5637  1A family penicillin-binding protein  38.42 
 
 		 794 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.751111  normal  0.833891 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1474  1A family penicillin-binding protein  38.32 
 
 		 914 aa  367  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  34.38 
 
 		 814 aa  298  2e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1020  penicillin-binding protein 2  34.69 
 
 		 743 aa  288  2e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  34.28 
 
 		 727 aa  287  5e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  34.18 
 
 		 905 aa  281  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1509  glycosyl transferase family protein  32.97 
 
 		 727 aa  278  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1538  glycosyl transferase family protein  32.97 
 
 		 727 aa  278  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  31.72 
 
 		 795 aa  276  8e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  34.09 
 
 		 765 aa  274  4.0000000000000004e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  32.25 
 
 		 761 aa  272  2e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  33.39 
 
 		 880 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  34.15 
 
 		 829 aa  269  8.999999999999999e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  32.63 
 
 		 828 aa  266  8.999999999999999e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  32.14 
 
 		 727 aa  244  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  33.27 
 
 		 709 aa  241  4e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  30.82 
 
 		 680 aa  236  8e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1547  penicillin-binding protein  30.82 
 
 		 667 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000544476 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1378  1A family penicillin-binding protein  30.47 
 
 		 679 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  32.21 
 
 		 806 aa  234  4.0000000000000004e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1336  penicillin-binding protein 2A  30.65 
 
 		 680 aa  234  5e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000691863  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  30.82 
 
 		 680 aa  233  6e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1578  penicillin-binding protein  30.65 
 
 		 680 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315585  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3835  penicillin-binding protein 1F (PBP-1F)  30.82 
 
 		 680 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288255  hitchhiker  0.000000000138665 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1616  penicillin-binding protein  30.47 
 
 		 680 aa  233  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1363  penicillin-binding protein  30.47 
 
 		 673 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000333103  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1474  penicillin-binding protein  30.47 
 
 		 673 aa  231  2e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0083684  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  31.1 
 
 		 744 aa  230  8e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1812  penicillin-binding protein, 1A family  28.94 
 
 		 941 aa  228  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.022556  normal  0.0842954 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1180  1A family penicillin-binding protein  29.63 
 
 		 679 aa  227  5.0000000000000005e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000474619  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  30.85 
 
 		 701 aa  226  7e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  30.11 
 
 		 646 aa  226  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  31.06 
 
 		 761 aa  224  3e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1229  penicillin-binding protein 1  29.7 
 
 		 705 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1269  1A family penicillin-binding protein  30.08 
 
 		 721 aa  223  8e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000185819  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  32.11 
 
 		 643 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  32.11 
 
 		 643 aa  222  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  29.34 
 
 		 676 aa  222  1.9999999999999999e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  31.13 
 
 		 656 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1213  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  32.97 
 
 		 686 aa  221  3e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0924333  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4203  penicillin-binding protein 1  29.21 
 
 		 705 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3992  bifunctional peptidoglycan glycosyl transferase/transpeptidase  29.9 
 
 		 687 aa  220  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155009  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  30.02 
 
 		 704 aa  219  1e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  29.43 
 
 		 638 aa  219  2e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  29.55 
 
 		 679 aa  219  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1297  penicillin-binding protein 1B  31.4 
 
 		 780 aa  218  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0998  penicillin-binding protein 1  29.21 
 
 		 705 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0983  penicillin-binding protein 1  29.21 
 
 		 705 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1069  penicillin-binding protein 1  29.21 
 
 		 705 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  32.19 
 
 		 618 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1166  penicillin-binding protein 1  29.08 
 
 		 746 aa  217  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1102  penicillin-binding protein 1  29 
 
 		 705 aa  217  5.9999999999999996e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0378  penicillin-binding protein, 1A family  30.92 
 
 		 706 aa  216  7e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0988  1A family penicillin-binding protein  28.83 
 
 		 746 aa  216  7e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  30.28 
 
 		 751 aa  216  7e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0985  penicillin-binding protein 1  28.88 
 
 		 705 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1760  1A family penicillin-binding protein  30.74 
 
 		 824 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590244  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1151  penicillin-binding protein 1  29.09 
 
 		 705 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  30.34 
 
 		 642 aa  214  3.9999999999999995e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0260  penicillin-binding protein 2A  30.28 
 
 		 775 aa  214  3.9999999999999995e-54  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.882065  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1452  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  29.86 
 
 		 685 aa  214  4.9999999999999996e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  29 
 
 		 705 aa  213  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  28.03 
 
 		 683 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  29.78 
 
 		 667 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  30.37 
 
 		 693 aa  212  2e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  32.24 
 
 		 654 aa  211  5e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3164  penicillin-binding protein 1B  32.88 
 
 		 768 aa  210  8e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1672  penicillin-binding protein, putative  30.06 
 
 		 759 aa  209  9e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  28.91 
 
 		 662 aa  208  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2876  glycosyl transferase family 51  28.8 
 
 		 861 aa  207  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.186058  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>