More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0235 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 		 880 aa  1816    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  47.12 
 
 		 905 aa  589  1e-167  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  41.12 
 
 		 765 aa  508  9.999999999999999e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  39.81 
 
 		 828 aa  482  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  40.76 
 
 		 761 aa  477  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  39.66 
 
 		 795 aa  471  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  41.25 
 
 		 727 aa  428  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  39.8 
 
 		 727 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  35.6 
 
 		 829 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0378  penicillin-binding protein, 1A family  40.38 
 
 		 706 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  35.48 
 
 		 814 aa  402  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  42.24 
 
 		 709 aa  399  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  36.62 
 
 		 806 aa  395  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0998  penicillin-binding protein 1  38.34 
 
 		 705 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0983  penicillin-binding protein 1  38.19 
 
 		 705 aa  390  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0985  penicillin-binding protein 1  38.04 
 
 		 705 aa  390  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1151  penicillin-binding protein 1  38.04 
 
 		 705 aa  391  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1069  penicillin-binding protein 1  38.34 
 
 		 705 aa  390  1e-107  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  37.14 
 
 		 705 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1229  penicillin-binding protein 1  38.23 
 
 		 705 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4203  penicillin-binding protein 1  38.5 
 
 		 705 aa  390  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1102  penicillin-binding protein 1  38.34 
 
 		 705 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1166  penicillin-binding protein 1  38.63 
 
 		 746 aa  383  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1760  1A family penicillin-binding protein  35.72 
 
 		 824 aa  382  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590244  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2107  penicillin-binding protein, 1A family  36.05 
 
 		 912 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0511  penicillin-binding protein, 1A family  36.92 
 
 		 901 aa  382  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0988  1A family penicillin-binding protein  37.42 
 
 		 746 aa  375  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1378  1A family penicillin-binding protein  36.73 
 
 		 679 aa  371  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1812  penicillin-binding protein, 1A family  33.78 
 
 		 941 aa  369  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.022556  normal  0.0842954 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2069  penicillin-binding protein, 1A family  33.93 
 
 		 843 aa  369  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.23157 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  36.95 
 
 		 680 aa  365  1e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  37.39 
 
 		 680 aa  363  6e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1547  penicillin-binding protein  37.39 
 
 		 667 aa  363  6e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000544476 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1616  penicillin-binding protein  38.01 
 
 		 680 aa  362  1e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1578  penicillin-binding protein  37.84 
 
 		 680 aa  362  2e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315585  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1336  penicillin-binding protein 2A  37.23 
 
 		 680 aa  361  3e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000691863  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1363  penicillin-binding protein  37.06 
 
 		 673 aa  359  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000333103  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1474  penicillin-binding protein  37.06 
 
 		 673 aa  359  9.999999999999999e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0083684  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3835  penicillin-binding protein 1F (PBP-1F)  37.84 
 
 		 680 aa  359  9.999999999999999e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288255  hitchhiker  0.000000000138665 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1269  1A family penicillin-binding protein  37.01 
 
 		 721 aa  356  7.999999999999999e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000185819  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2876  glycosyl transferase family 51  35.01 
 
 		 861 aa  357  7.999999999999999e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.186058  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1180  1A family penicillin-binding protein  34.73 
 
 		 679 aa  352  1e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000474619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2153  1A family penicillin-binding protein  37.04 
 
 		 839 aa  353  1e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2312  penicillin-binding protein 1A  36.59 
 
 		 830 aa  352  2e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1452  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  38.09 
 
 		 685 aa  350  6e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3013  penicillin-binding protein 1A/1B  36.43 
 
 		 832 aa  349  1e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.462523 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2364  penicillin-binding protein 1A  36.59 
 
 		 834 aa  348  2e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2185  penicillin-binding protein 1A  36.3 
 
 		 846 aa  347  4e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.704699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2345  penicillin-binding protein 1A  36.3 
 
 		 820 aa  347  4e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.538811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2108  penicillin-binding protein 1A  36.3 
 
 		 835 aa  347  6e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.60098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2122  penicillin-binding protein 1A  36.3 
 
 		 834 aa  346  1e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2370  penicillin-binding protein 1A  36.43 
 
 		 837 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0572853  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2447  penicillin-binding protein 1A  36.43 
 
 		 837 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0929548  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  36.88 
 
 		 649 aa  343  7e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1722  1A family penicillin-binding protein  35.6 
 
 		 836 aa  341  4e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.278842  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1025  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  36.76 
 
 		 791 aa  338  1.9999999999999998e-91  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  35.84 
 
 		 683 aa  337  5e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5637  1A family penicillin-binding protein  35.38 
 
 		 794 aa  337  5e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.751111  normal  0.833891 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  34.93 
 
 		 683 aa  337  5.999999999999999e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  35.11 
 
 		 734 aa  336  9e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  33.88 
 
 		 683 aa  336  9e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  35.52 
 
 		 683 aa  334  3e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  35.84 
 
 		 683 aa  335  3e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1930  membrane carboxypeptidase mrcB  34.94 
 
 		 820 aa  334  4e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  35.52 
 
 		 683 aa  334  5e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  32.44 
 
 		 791 aa  333  6e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  35.36 
 
 		 683 aa  333  7.000000000000001e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  37.27 
 
 		 643 aa  333  9e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  34.75 
 
 		 618 aa  333  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  35.68 
 
 		 683 aa  333  1e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  35.52 
 
 		 683 aa  331  4e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  35.52 
 
 		 683 aa  331  4e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2218  1A family penicillin-binding protein  33.8 
 
 		 830 aa  330  6e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  36.13 
 
 		 728 aa  330  9e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  36.49 
 
 		 681 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  35.14 
 
 		 757 aa  329  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  35.55 
 
 		 734 aa  329  2.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  36.77 
 
 		 679 aa  325  2e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0597  penicillin-binding protein, 1A family  36.35 
 
 		 665 aa  325  2e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  34.04 
 
 		 732 aa  325  2e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3992  bifunctional peptidoglycan glycosyl transferase/transpeptidase  37.5 
 
 		 687 aa  325  2e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155009  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  34.88 
 
 		 683 aa  324  4e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1272  1A family penicillin-binding protein  34.45 
 
 		 865 aa  323  9.000000000000001e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.932198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  34.72 
 
 		 683 aa  323  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  33.74 
 
 		 735 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  34.62 
 
 		 654 aa  322  9.999999999999999e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  34.41 
 
 		 693 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  34.09 
 
 		 833 aa  321  3.9999999999999996e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1430  penicillin-binding protein  34.76 
 
 		 897 aa  320  5e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.14042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1643  penicillin-binding protein  34.76 
 
 		 897 aa  321  5e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00351839 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1458  penicillin-binding protein  34.76 
 
 		 896 aa  320  6e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.126444  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1572  penicillin-binding protein  34.76 
 
 		 897 aa  320  6e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1716  penicillin-binding protein  34.91 
 
 		 900 aa  320  7e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.749983  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1474  1A family penicillin-binding protein  35.7 
 
 		 914 aa  320  1e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  35.99 
 
 		 714 aa  319  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  36.1 
 
 		 648 aa  319  1e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1678  penicillin-binding protein  34.91 
 
 		 905 aa  319  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1832  1A family penicillin-binding protein  35.99 
 
 		 713 aa  319  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.421648  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  35.65 
 
 		 648 aa  318  2e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0832  1A family penicillin-binding protein  35.99 
 
 		 713 aa  319  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>