More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1930 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2218  1A family penicillin-binding protein  93.03 
 
 		 830 aa  1488    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1930  membrane carboxypeptidase mrcB  100 
 
 		 820 aa  1678    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  37.79 
 
 		 829 aa  434  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  38.25 
 
 		 814 aa  410  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1760  1A family penicillin-binding protein  33.29 
 
 		 824 aa  382  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590244  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2876  glycosyl transferase family 51  35.16 
 
 		 861 aa  364  4e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.186058  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  33.29 
 
 		 795 aa  355  2e-96  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  34.12 
 
 		 761 aa  341  2.9999999999999998e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  33.19 
 
 		 765 aa  340  5e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  34.94 
 
 		 880 aa  333  7.000000000000001e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2312  penicillin-binding protein 1A  34.45 
 
 		 830 aa  326  1e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2370  penicillin-binding protein 1A  34.14 
 
 		 837 aa  321  3e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0572853  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  32.93 
 
 		 905 aa  322  3e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2153  1A family penicillin-binding protein  34.39 
 
 		 839 aa  320  9e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2447  penicillin-binding protein 1A  33.69 
 
 		 837 aa  316  9e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0929548  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2185  penicillin-binding protein 1A  34.04 
 
 		 846 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.704699  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2122  penicillin-binding protein 1A  34.04 
 
 		 834 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2345  penicillin-binding protein 1A  34.04 
 
 		 820 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.538811  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  30.62 
 
 		 828 aa  315  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2364  penicillin-binding protein 1A  34.04 
 
 		 834 aa  314  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2108  penicillin-binding protein 1A  33.89 
 
 		 835 aa  313  5.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.60098  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3013  penicillin-binding protein 1A/1B  33.69 
 
 		 832 aa  313  9e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.462523 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1722  1A family penicillin-binding protein  32.88 
 
 		 836 aa  311  4e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.278842  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  33.29 
 
 		 727 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1678  penicillin-binding protein  33.73 
 
 		 905 aa  305  3.0000000000000004e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5637  1A family penicillin-binding protein  33.19 
 
 		 794 aa  304  6.000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.751111  normal  0.833891 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  33.44 
 
 		 727 aa  303  9e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  31.95 
 
 		 806 aa  303  1e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1458  penicillin-binding protein  33.99 
 
 		 896 aa  301  4e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.126444  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1572  penicillin-binding protein  33.99 
 
 		 897 aa  301  4e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1643  penicillin-binding protein  33.99 
 
 		 897 aa  300  5e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00351839 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1430  penicillin-binding protein  33.99 
 
 		 897 aa  300  5e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.14042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1431  penicillin-binding protein  33.84 
 
 		 897 aa  301  5e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1716  penicillin-binding protein  33.84 
 
 		 900 aa  300  5e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.749983  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  33.88 
 
 		 709 aa  299  1e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1474  1A family penicillin-binding protein  32.29 
 
 		 914 aa  297  4e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  32.19 
 
 		 649 aa  297  5e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1812  penicillin-binding protein, 1A family  29.1 
 
 		 941 aa  296  1e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.022556  normal  0.0842954 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1272  1A family penicillin-binding protein  32.6 
 
 		 865 aa  295  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.932198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3739  penicillin-binding protein  33.23 
 
 		 647 aa  295  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1605  penicillin-binding protein  33.18 
 
 		 897 aa  293  8e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2069  penicillin-binding protein, 1A family  30.18 
 
 		 843 aa  293  1e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.23157 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0378  penicillin-binding protein, 1A family  31.95 
 
 		 706 aa  289  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  31.51 
 
 		 662 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  32.66 
 
 		 648 aa  284  6.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  30.06 
 
 		 744 aa  283  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  29.82 
 
 		 701 aa  281  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2728  glycosyl transferase family 51  29.4 
 
 		 918 aa  276  9e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  33.06 
 
 		 680 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  31.65 
 
 		 680 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1578  penicillin-binding protein  32.73 
 
 		 680 aa  275  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315585  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  31.6 
 
 		 661 aa  275  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1547  penicillin-binding protein  32.89 
 
 		 667 aa  275  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000544476 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1616  penicillin-binding protein  32.57 
 
 		 680 aa  274  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1025  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  31.44 
 
 		 791 aa  274  5.000000000000001e-72  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1336  penicillin-binding protein 2A  32.57 
 
 		 680 aa  273  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000691863  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0712  glycosyl transferase family 51  28.61 
 
 		 916 aa  272  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1363  penicillin-binding protein  32.57 
 
 		 673 aa  271  5e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000333103  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1474  penicillin-binding protein  32.57 
 
 		 673 aa  271  5e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0083684  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  30.17 
 
 		 693 aa  270  8e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3835  penicillin-binding protein 1F (PBP-1F)  32.07 
 
 		 680 aa  270  1e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288255  hitchhiker  0.000000000138665 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1378  1A family penicillin-binding protein  31.25 
 
 		 679 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  30.05 
 
 		 704 aa  267  7e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1180  1A family penicillin-binding protein  31.56 
 
 		 679 aa  265  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000474619  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1892  penicillin-binding protein 1A  31.98 
 
 		 655 aa  265  4e-69  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1074  penicillin-binding protein 1A  31.4 
 
 		 644 aa  263  6.999999999999999e-69  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  31.89 
 
 		 705 aa  263  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2885  penicillin-binding protein, 1A family  28.12 
 
 		 705 aa  261  3e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.060613  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  31.7 
 
 		 676 aa  260  7e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  31.26 
 
 		 638 aa  260  7e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  29.94 
 
 		 667 aa  260  8e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  32.34 
 
 		 643 aa  260  9e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0615  penicillin-binding protein 1A  31.63 
 
 		 643 aa  259  1e-67  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0536  penicillin-binding protein 1A  31.63 
 
 		 643 aa  259  1e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1427  penicillin-binding protein 1A  31.33 
 
 		 643 aa  258  3e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  31.13 
 
 		 640 aa  258  4e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  30.18 
 
 		 656 aa  258  4e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0988  1A family penicillin-binding protein  32.4 
 
 		 746 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0998  penicillin-binding protein 1  32.53 
 
 		 705 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  30.64 
 
 		 640 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  29.31 
 
 		 668 aa  256  1.0000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1069  penicillin-binding protein 1  32.53 
 
 		 705 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0983  penicillin-binding protein 1  32.53 
 
 		 705 aa  256  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0511  penicillin-binding protein, 1A family  29.43 
 
 		 901 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1151  penicillin-binding protein 1  32.19 
 
 		 705 aa  255  3e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0985  penicillin-binding protein 1  32.19 
 
 		 705 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1102  penicillin-binding protein 1  32.29 
 
 		 705 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1229  penicillin-binding protein 1  32.38 
 
 		 705 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4203  penicillin-binding protein 1  32.79 
 
 		 705 aa  254  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  32.99 
 
 		 718 aa  253  8.000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  30.96 
 
 		 618 aa  253  9.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  32.55 
 
 		 641 aa  253  1e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1095  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  31.59 
 
 		 879 aa  251  3e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2871  1A family penicillin-binding protein  31.3 
 
 		 860 aa  251  5e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  30.69 
 
 		 643 aa  250  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  30.69 
 
 		 643 aa  250  6e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0298  penicillin-binding protein 1A  31.28 
 
 		 750 aa  250  8e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.376505  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  31.6 
 
 		 761 aa  249  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  29.94 
 
 		 683 aa  248  3e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1032  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  32.06 
 
 		 645 aa  248  4e-64  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00344643  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>