More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0712 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2728  glycosyl transferase family 51  68.52 
 
 		 918 aa  1322    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0712  glycosyl transferase family 51  100 
 
 		 916 aa  1893    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0438  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  39.12 
 
 		 942 aa  523  1e-147  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00387795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1846  penicillin-binding protein 1B  36.54 
 
 		 807 aa  436  1e-120  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0159  penicillin-binding protein 1B, putative  35.39 
 
 		 765 aa  432  1e-119  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.201709  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0432  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  34.62 
 
 		 812 aa  406  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  32.53 
 
 		 905 aa  339  9.999999999999999e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  32.68 
 
 		 814 aa  324  6e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1812  penicillin-binding protein, 1A family  29.83 
 
 		 941 aa  322  3e-86  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.022556  normal  0.0842954 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2124  glycosyl transferase family 51  31.39 
 
 		 934 aa  319  1e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.563834  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  31.36 
 
 		 828 aa  317  7e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  31.22 
 
 		 761 aa  310  6.999999999999999e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  31.3 
 
 		 765 aa  310  1.0000000000000001e-82  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2069  penicillin-binding protein, 1A family  34.4 
 
 		 843 aa  310  1.0000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.23157 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  30.79 
 
 		 795 aa  307  6e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  31.14 
 
 		 727 aa  303  8.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  32.18 
 
 		 727 aa  301  4e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3835  penicillin-binding protein 1F (PBP-1F)  33.97 
 
 		 680 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288255  hitchhiker  0.000000000138665 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  33.62 
 
 		 680 aa  287  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1547  penicillin-binding protein  33.45 
 
 		 667 aa  286  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000544476 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  33.28 
 
 		 680 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  31.37 
 
 		 640 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0378  penicillin-binding protein, 1A family  32.27 
 
 		 706 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  30.43 
 
 		 795 aa  285  3.0000000000000004e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1336  penicillin-binding protein 2A  33.28 
 
 		 680 aa  284  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000691863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1616  penicillin-binding protein  33.45 
 
 		 680 aa  284  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1578  penicillin-binding protein  33.28 
 
 		 680 aa  283  9e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315585  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1363  penicillin-binding protein  32.93 
 
 		 673 aa  281  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000333103  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1474  penicillin-binding protein  32.93 
 
 		 673 aa  281  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0083684  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  31.83 
 
 		 640 aa  279  2e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  27.47 
 
 		 829 aa  278  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  30.45 
 
 		 668 aa  277  5e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  30.56 
 
 		 683 aa  277  6e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1180  1A family penicillin-binding protein  32.7 
 
 		 679 aa  277  7e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000474619  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2218  1A family penicillin-binding protein  28.55 
 
 		 830 aa  276  9e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  32.04 
 
 		 681 aa  276  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1378  1A family penicillin-binding protein  32.35 
 
 		 679 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1930  membrane carboxypeptidase mrcB  28.27 
 
 		 820 aa  275  3e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1760  1A family penicillin-binding protein  29.29 
 
 		 824 aa  274  4.0000000000000004e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590244  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  30.09 
 
 		 643 aa  274  5.000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  31.3 
 
 		 643 aa  269  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  31.3 
 
 		 643 aa  269  2e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  30.52 
 
 		 618 aa  268  4e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  31.85 
 
 		 625 aa  268  4e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  31.89 
 
 		 708 aa  267  8.999999999999999e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  33.33 
 
 		 734 aa  266  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  29.91 
 
 		 806 aa  264  4.999999999999999e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  29.8 
 
 		 705 aa  263  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  32.84 
 
 		 709 aa  260  8e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  29.52 
 
 		 841 aa  259  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  33.39 
 
 		 728 aa  259  2e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  29.96 
 
 		 880 aa  258  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  33.06 
 
 		 714 aa  258  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  28.26 
 
 		 638 aa  258  5e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0754  penicillin-binding protein, 1A family  30 
 
 		 796 aa  256  2.0000000000000002e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  32.4 
 
 		 720 aa  254  5.000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  31.5 
 
 		 739 aa  254  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  33.63 
 
 		 770 aa  254  7e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  29.1 
 
 		 654 aa  253  9.000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  31.28 
 
 		 710 aa  253  1e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  31.38 
 
 		 683 aa  253  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  32.13 
 
 		 710 aa  253  1e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  31.44 
 
 		 683 aa  253  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  33.44 
 
 		 732 aa  253  1e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  30.89 
 
 		 751 aa  253  2e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  30.9 
 
 		 757 aa  252  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  31.29 
 
 		 683 aa  251  3e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  31.29 
 
 		 683 aa  251  3e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  28.53 
 
 		 748 aa  252  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4203  penicillin-binding protein 1  30.78 
 
 		 705 aa  252  3e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1102  penicillin-binding protein 1  30.62 
 
 		 705 aa  251  4e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  31.22 
 
 		 683 aa  251  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  31.44 
 
 		 683 aa  251  4e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  31.29 
 
 		 683 aa  251  5e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  32.51 
 
 		 626 aa  251  6e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  31.44 
 
 		 683 aa  250  7e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  30.48 
 
 		 683 aa  250  8e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0998  penicillin-binding protein 1  28.39 
 
 		 705 aa  250  9e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1069  penicillin-binding protein 1  28.39 
 
 		 705 aa  250  9e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1151  penicillin-binding protein 1  28.25 
 
 		 705 aa  250  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0983  penicillin-binding protein 1  28.25 
 
 		 705 aa  250  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  32.11 
 
 		 714 aa  249  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  31.44 
 
 		 683 aa  250  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  32.34 
 
 		 779 aa  249  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0985  penicillin-binding protein 1  28.25 
 
 		 705 aa  249  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  32.46 
 
 		 833 aa  249  2e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  30.72 
 
 		 679 aa  249  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2706  glycosyl transferase family 51  32.99 
 
 		 728 aa  249  2e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.488127  normal  0.218116 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3013  penicillin-binding protein 1A/1B  30.31 
 
 		 832 aa  248  3e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.462523 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  30.83 
 
 		 683 aa  248  3e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1229  penicillin-binding protein 1  28.25 
 
 		 705 aa  248  4e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2312  penicillin-binding protein 1A  30.31 
 
 		 830 aa  247  6e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  31.99 
 
 		 776 aa  247  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0988  1A family penicillin-binding protein  30.56 
 
 		 746 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0498  glycosyl transferase family protein  27.46 
 
 		 910 aa  246  9.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000157387  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2871  1A family penicillin-binding protein  32.04 
 
 		 860 aa  246  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  29.95 
 
 		 641 aa  246  9.999999999999999e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0189  penicillin-binding protein, 1A family  27.6 
 
 		 799 aa  245  1.9999999999999999e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.149953  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0290  1A family penicillin-binding protein  30.16 
 
 		 757 aa  246  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  31.7 
 
 		 720 aa  246  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>