More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2728 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2728  glycosyl transferase family 51  100 
 
 		 918 aa  1911    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0712  glycosyl transferase family 51  68.87 
 
 		 916 aa  1272    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0438  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  37.16 
 
 		 942 aa  502  1e-140  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00387795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1846  penicillin-binding protein 1B  36.14 
 
 		 807 aa  425  1e-117  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0159  penicillin-binding protein 1B, putative  35.89 
 
 		 765 aa  420  1e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.201709  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0432  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  36.36 
 
 		 812 aa  405  1e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  32.41 
 
 		 905 aa  338  1.9999999999999998e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2124  glycosyl transferase family 51  30.81 
 
 		 934 aa  332  2e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.563834  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  30.37 
 
 		 795 aa  315  2.9999999999999996e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  31.76 
 
 		 727 aa  310  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  31.74 
 
 		 727 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  32.36 
 
 		 761 aa  306  1.0000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2069  penicillin-binding protein, 1A family  33.33 
 
 		 843 aa  303  1e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.23157 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1812  penicillin-binding protein, 1A family  32.07 
 
 		 941 aa  299  2e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.022556  normal  0.0842954 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  29.81 
 
 		 765 aa  296  1e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  30.36 
 
 		 828 aa  295  3e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  29.82 
 
 		 814 aa  294  5e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  31.67 
 
 		 795 aa  294  5e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  31.59 
 
 		 806 aa  292  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  31.13 
 
 		 640 aa  289  2e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3835  penicillin-binding protein 1F (PBP-1F)  33.5 
 
 		 680 aa  284  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288255  hitchhiker  0.000000000138665 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  31.51 
 
 		 618 aa  283  8.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  32.17 
 
 		 680 aa  283  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2218  1A family penicillin-binding protein  29.89 
 
 		 830 aa  281  4e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  29.2 
 
 		 829 aa  279  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1180  1A family penicillin-binding protein  31.85 
 
 		 679 aa  278  4e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000474619  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1547  penicillin-binding protein  33 
 
 		 667 aa  278  4e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000544476 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  33 
 
 		 680 aa  278  5e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1930  membrane carboxypeptidase mrcB  29.67 
 
 		 820 aa  277  8e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.382512  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1760  1A family penicillin-binding protein  28.92 
 
 		 824 aa  276  1.0000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1336  penicillin-binding protein 2A  32.83 
 
 		 680 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000691863  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1616  penicillin-binding protein  32.83 
 
 		 680 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1578  penicillin-binding protein  32.66 
 
 		 680 aa  275  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315585  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1363  penicillin-binding protein  32.66 
 
 		 673 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000333103  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1474  penicillin-binding protein  32.66 
 
 		 673 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0083684  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0378  penicillin-binding protein, 1A family  33.28 
 
 		 706 aa  274  7e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  31.39 
 
 		 640 aa  271  4e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1378  1A family penicillin-binding protein  31.66 
 
 		 679 aa  270  8e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  30 
 
 		 654 aa  270  1e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  29.76 
 
 		 643 aa  268  2e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  31.82 
 
 		 625 aa  266  1e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  32.4 
 
 		 709 aa  264  4.999999999999999e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2312  penicillin-binding protein 1A  30.56 
 
 		 830 aa  264  6e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3013  penicillin-binding protein 1A/1B  30.56 
 
 		 832 aa  262  2e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.462523 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  29.66 
 
 		 638 aa  262  2e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  30.58 
 
 		 681 aa  261  3e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  31.05 
 
 		 683 aa  260  8e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  29.47 
 
 		 705 aa  258  3e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  30.85 
 
 		 643 aa  257  7e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  30.85 
 
 		 643 aa  257  7e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  31.18 
 
 		 750 aa  255  3e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  29.02 
 
 		 646 aa  254  4.0000000000000004e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  28.79 
 
 		 668 aa  254  5.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  32.05 
 
 		 734 aa  254  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  30.96 
 
 		 744 aa  253  1e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  29.33 
 
 		 748 aa  253  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0983  penicillin-binding protein 1  29.86 
 
 		 705 aa  252  2e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  30.87 
 
 		 679 aa  252  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  29.42 
 
 		 641 aa  253  2e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  31.84 
 
 		 714 aa  252  3e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0998  penicillin-binding protein 1  29.71 
 
 		 705 aa  251  4e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0985  penicillin-binding protein 1  29.86 
 
 		 705 aa  251  4e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1069  penicillin-binding protein 1  29.71 
 
 		 705 aa  251  4e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  29.55 
 
 		 880 aa  251  5e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4203  penicillin-binding protein 1  28.99 
 
 		 705 aa  251  6e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  30.32 
 
 		 774 aa  250  7e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3899  peptidoglycan glycosyltransferase  29.95 
 
 		 821 aa  249  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1151  penicillin-binding protein 1  29.42 
 
 		 705 aa  250  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1166  penicillin-binding protein 1  31.89 
 
 		 746 aa  249  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2197  putative penicillin-binding 1 (peptidoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  29.52 
 
 		 838 aa  249  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633683  decreased coverage  0.00350534 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  28.77 
 
 		 683 aa  249  2e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1269  1A family penicillin-binding protein  32.06 
 
 		 721 aa  249  2e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000185819  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  30.28 
 
 		 701 aa  248  4e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  31.82 
 
 		 710 aa  248  4e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1229  penicillin-binding protein 1  29.71 
 
 		 705 aa  248  4e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  29.31 
 
 		 783 aa  248  4.9999999999999997e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1102  penicillin-binding protein 1  29.54 
 
 		 705 aa  248  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2153  1A family penicillin-binding protein  30 
 
 		 839 aa  247  6e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0988  1A family penicillin-binding protein  31.05 
 
 		 746 aa  247  6e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2013  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.99 
 
 		 834 aa  247  6.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.155902 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2447  penicillin-binding protein 1A  29.58 
 
 		 837 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0929548  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  32.43 
 
 		 714 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  29.5 
 
 		 683 aa  246  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  32.39 
 
 		 770 aa  245  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  27.68 
 
 		 656 aa  244  7e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2108  penicillin-binding protein 1A  29.11 
 
 		 835 aa  243  7.999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.60098  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  30.18 
 
 		 724 aa  243  7.999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  29.65 
 
 		 683 aa  243  9e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  29.3 
 
 		 683 aa  243  1e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  29.35 
 
 		 683 aa  243  1e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2364  penicillin-binding protein 1A  29.11 
 
 		 834 aa  243  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  28.77 
 
 		 730 aa  243  1e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  32.75 
 
 		 728 aa  243  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  30.78 
 
 		 779 aa  243  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2370  penicillin-binding protein 1A  29.2 
 
 		 837 aa  243  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0572853  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  30.03 
 
 		 718 aa  242  2e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  29.2 
 
 		 683 aa  243  2e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  28.59 
 
 		 683 aa  243  2e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2677  1A family penicillin-binding protein  30.54 
 
 		 724 aa  243  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288371  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  29.59 
 
 		 760 aa  242  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>