More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_02290 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 		 710 aa  1466    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  50.45 
 
 		 750 aa  608  9.999999999999999e-173  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  50.4 
 
 		 723 aa  595  1e-168  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  46.06 
 
 		 722 aa  523  1e-147  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  48.18 
 
 		 710 aa  493  9.999999999999999e-139  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  37.84 
 
 		 761 aa  374  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  37.46 
 
 		 806 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3542  penicillin-binding protein, 1A family  36.9 
 
 		 817 aa  362  1e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  36.3 
 
 		 643 aa  354  4e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  36.3 
 
 		 643 aa  354  4e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  38.07 
 
 		 661 aa  352  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  36.9 
 
 		 640 aa  352  1e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  36.24 
 
 		 640 aa  349  9e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  35.82 
 
 		 765 aa  347  4e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  36.52 
 
 		 618 aa  347  4e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  38.35 
 
 		 626 aa  345  1e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  35.69 
 
 		 648 aa  344  4e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  38.35 
 
 		 648 aa  343  4e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  36.07 
 
 		 683 aa  343  5e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  37.46 
 
 		 776 aa  340  4e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  36.05 
 
 		 654 aa  340  4e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  38.76 
 
 		 681 aa  340  5e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  38.1 
 
 		 833 aa  337  2.9999999999999997e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5899  glycosyl transferase family 51  38.32 
 
 		 726 aa  337  2.9999999999999997e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1310  penicillin-binding protein 1A  38.79 
 
 		 704 aa  337  5.999999999999999e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.028236  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  40.33 
 
 		 712 aa  335  2e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31830  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  36.05 
 
 		 859 aa  334  3e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  35.51 
 
 		 646 aa  333  9e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  34.18 
 
 		 774 aa  332  1e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  38.76 
 
 		 751 aa  332  1e-89  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  39.24 
 
 		 811 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  36.48 
 
 		 643 aa  332  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  34.14 
 
 		 658 aa  330  5.0000000000000004e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3529  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  40.08 
 
 		 751 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.554162  normal  0.675674 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  34.86 
 
 		 755 aa  329  1.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  37.16 
 
 		 683 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  36.14 
 
 		 727 aa  328  3e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  34.92 
 
 		 625 aa  324  4e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  37.78 
 
 		 709 aa  324  4e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  35.85 
 
 		 739 aa  323  6e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  36.56 
 
 		 770 aa  323  6e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  37.76 
 
 		 779 aa  323  8e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1832  1A family penicillin-binding protein  35.53 
 
 		 713 aa  323  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.421648  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1123  1A family penicillin-binding protein  35.53 
 
 		 713 aa  323  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438177  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  33.86 
 
 		 667 aa  323  9.000000000000001e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0832  1A family penicillin-binding protein  35.53 
 
 		 713 aa  323  9.000000000000001e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313161  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  37.65 
 
 		 741 aa  322  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  35.87 
 
 		 704 aa  322  9.999999999999999e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  36.59 
 
 		 683 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  37.41 
 
 		 734 aa  322  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  37.41 
 
 		 776 aa  322  1.9999999999999998e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  35.33 
 
 		 680 aa  321  3e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  35.17 
 
 		 795 aa  321  3e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  36.78 
 
 		 683 aa  321  3e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  36.41 
 
 		 683 aa  321  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  36.95 
 
 		 732 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  36.41 
 
 		 683 aa  321  3.9999999999999996e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  36.78 
 
 		 683 aa  320  5e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  33.86 
 
 		 693 aa  320  5e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1574  penicillin-binding protein 1A  36.78 
 
 		 692 aa  320  6e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  36.59 
 
 		 683 aa  320  7e-86  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  36.59 
 
 		 683 aa  320  7e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  36.59 
 
 		 683 aa  319  9e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3332  1A family penicillin-binding protein  34.06 
 
 		 714 aa  318  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741858  hitchhiker  0.0086967 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0339  1A family penicillin-binding protein  35.46 
 
 		 713 aa  318  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  35.46 
 
 		 713 aa  318  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0432  1A family penicillin-binding protein  35.46 
 
 		 713 aa  318  3e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  38.01 
 
 		 714 aa  316  9.999999999999999e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  35.11 
 
 		 720 aa  315  9.999999999999999e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  34.81 
 
 		 708 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  36.78 
 
 		 683 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  35.85 
 
 		 735 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  36.66 
 
 		 723 aa  314  2.9999999999999996e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0163  1A family penicillin-binding protein  34.18 
 
 		 713 aa  313  5.999999999999999e-84  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2473  glycosyl transferase/transpeptidase  37.54 
 
 		 756 aa  313  6.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.879248 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  38.56 
 
 		 824 aa  312  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  38.56 
 
 		 824 aa  313  1e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  35.58 
 
 		 720 aa  312  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  34.25 
 
 		 662 aa  312  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  38.76 
 
 		 712 aa  312  2e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3011  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  37.73 
 
 		 750 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  36.52 
 
 		 714 aa  311  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  36.59 
 
 		 683 aa  311  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0021  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  36.19 
 
 		 762 aa  311  2.9999999999999997e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1919  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  36.8 
 
 		 751 aa  311  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1945  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  36.8 
 
 		 751 aa  310  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5424  penicillin-binding protein 1A  33.56 
 
 		 709 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5438  1A family penicillin-binding protein  33.56 
 
 		 709 aa  310  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  36.2 
 
 		 761 aa  310  5.9999999999999995e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4831  1A family penicillin-binding protein  33.56 
 
 		 709 aa  310  8e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2326  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  36.96 
 
 		 757 aa  309  9e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3392  glycosyl transferase family 51  37.46 
 
 		 662 aa  310  9e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.305722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  36.19 
 
 		 734 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  37.4 
 
 		 649 aa  308  2.0000000000000002e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  35.48 
 
 		 656 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  35.55 
 
 		 730 aa  307  4.0000000000000004e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  35.55 
 
 		 763 aa  307  5.0000000000000004e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.21 
 
 		 764 aa  307  5.0000000000000004e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  36.27 
 
 		 905 aa  307  5.0000000000000004e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  36.28 
 
 		 727 aa  306  6e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>