More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1010 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 		 710 aa  1463    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  46.18 
 
 		 710 aa  489  1e-137  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  41.55 
 
 		 723 aa  456  1e-127  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  41.3 
 
 		 750 aa  452  1e-125  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  40.47 
 
 		 722 aa  434  1e-120  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  39.51 
 
 		 761 aa  402  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  41.43 
 
 		 712 aa  377  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  36.42 
 
 		 765 aa  377  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  37.89 
 
 		 643 aa  369  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  36.85 
 
 		 640 aa  367  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  36.67 
 
 		 661 aa  369  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  37.89 
 
 		 643 aa  369  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  38.63 
 
 		 776 aa  365  2e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  38.18 
 
 		 643 aa  362  1e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  36.91 
 
 		 618 aa  362  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  39.93 
 
 		 811 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  36.5 
 
 		 654 aa  357  2.9999999999999997e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  38.14 
 
 		 667 aa  357  5.999999999999999e-97  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  35.91 
 
 		 640 aa  356  1e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  36.88 
 
 		 648 aa  349  1e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  36.49 
 
 		 806 aa  345  1e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  37 
 
 		 625 aa  345  2e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  34.43 
 
 		 755 aa  345  2e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  39.4 
 
 		 761 aa  344  2.9999999999999997e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  39.7 
 
 		 824 aa  342  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  37.33 
 
 		 681 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  39.33 
 
 		 824 aa  340  7e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  36.96 
 
 		 693 aa  338  2.9999999999999997e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  36.27 
 
 		 662 aa  337  5.999999999999999e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  35.69 
 
 		 646 aa  336  7.999999999999999e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  36.78 
 
 		 701 aa  336  7.999999999999999e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1832  1A family penicillin-binding protein  36.01 
 
 		 713 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.421648  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0832  1A family penicillin-binding protein  36.01 
 
 		 713 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313161  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1123  1A family penicillin-binding protein  36.01 
 
 		 713 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438177  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  36.52 
 
 		 649 aa  334  4e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  36.86 
 
 		 744 aa  333  6e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  37.16 
 
 		 626 aa  333  6e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  36.51 
 
 		 656 aa  333  8e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  36.19 
 
 		 683 aa  332  1e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  36.55 
 
 		 713 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0432  1A family penicillin-binding protein  36.55 
 
 		 713 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0339  1A family penicillin-binding protein  36.55 
 
 		 713 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  36.19 
 
 		 683 aa  331  3e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  33.71 
 
 		 683 aa  330  4e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  34.37 
 
 		 774 aa  328  1.0000000000000001e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  36.38 
 
 		 727 aa  329  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  35.03 
 
 		 683 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  34.98 
 
 		 683 aa  327  3e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3542  penicillin-binding protein, 1A family  36.14 
 
 		 817 aa  327  5e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1108  glycosyl transferase family protein  37.82 
 
 		 678 aa  327  5e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  33.77 
 
 		 648 aa  325  1e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  34.82 
 
 		 683 aa  326  1e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  34.82 
 
 		 683 aa  326  1e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  37.39 
 
 		 751 aa  325  1e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  36.14 
 
 		 683 aa  325  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  36.39 
 
 		 770 aa  325  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  36.41 
 
 		 683 aa  324  3e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  36.7 
 
 		 695 aa  324  4e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  36.13 
 
 		 683 aa  323  5e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  36.25 
 
 		 723 aa  323  5e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  36.24 
 
 		 683 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  34.72 
 
 		 704 aa  322  9.999999999999999e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  37.06 
 
 		 730 aa  320  3.9999999999999996e-86  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  33.48 
 
 		 727 aa  321  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  37.06 
 
 		 763 aa  320  7e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  36.17 
 
 		 683 aa  319  1e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2145  1A family penicillin-binding protein  35.49 
 
 		 710 aa  319  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5899  glycosyl transferase family 51  34.36 
 
 		 726 aa  318  2e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  34.39 
 
 		 680 aa  317  6e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  34.48 
 
 		 676 aa  317  7e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  34.67 
 
 		 707 aa  316  8e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  36.44 
 
 		 679 aa  316  9e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4779  1A family penicillin-binding protein  35.8 
 
 		 705 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.819685 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5322  1A family penicillin-binding protein  36.12 
 
 		 714 aa  313  7.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  37.26 
 
 		 691 aa  313  7.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3392  glycosyl transferase family 51  34.54 
 
 		 662 aa  313  9e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.305722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4831  1A family penicillin-binding protein  34.92 
 
 		 709 aa  312  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5424  penicillin-binding protein 1A  34.86 
 
 		 709 aa  312  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5438  1A family penicillin-binding protein  34.86 
 
 		 709 aa  312  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1574  penicillin-binding protein 1A  34.4 
 
 		 692 aa  312  2e-83  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  32.38 
 
 		 784 aa  308  2.0000000000000002e-82  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0290  1A family penicillin-binding protein  35.12 
 
 		 757 aa  306  7e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  36.36 
 
 		 709 aa  306  9.000000000000001e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  35.29 
 
 		 779 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  34.46 
 
 		 658 aa  305  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2817  1A family penicillin-binding protein  35.13 
 
 		 709 aa  306  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515125  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3992  bifunctional peptidoglycan glycosyl transferase/transpeptidase  35.82 
 
 		 687 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155009  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  36.18 
 
 		 734 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1310  penicillin-binding protein 1A  35.16 
 
 		 704 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.028236  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3332  1A family penicillin-binding protein  34.8 
 
 		 714 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741858  hitchhiker  0.0086967 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2065  glycosyl transferase family protein  34.58 
 
 		 686 aa  304  4.0000000000000003e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  34.35 
 
 		 801 aa  303  7.000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  33.7 
 
 		 734 aa  303  7.000000000000001e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  35.33 
 
 		 768 aa  303  8.000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0615  penicillin-binding protein 1A  32.76 
 
 		 643 aa  303  1e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0536  penicillin-binding protein 1A  32.76 
 
 		 643 aa  303  1e-80  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  36.74 
 
 		 776 aa  302  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  34.9 
 
 		 641 aa  301  2e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4058  glycosyl transferase family protein  35.34 
 
 		 678 aa  302  2e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1427  penicillin-binding protein 1A  32.32 
 
 		 643 aa  302  2e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>