More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4058 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_1080  penicillin-binding protein  59.51 
 
 		 844 aa  798    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366397  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2081  glycosyl transferase family protein  62.6 
 
 		 846 aa  784    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45351  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0887  peptidoglycan glycosyltransferase  55.53 
 
 		 841 aa  761    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1363  penicillin-binding protein  59.51 
 
 		 844 aa  798    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1674  Peptidoglycan glycosyltransferase  61.98 
 
 		 846 aa  778    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.339847  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2055  1A family penicillin-binding protein  59.32 
 
 		 839 aa  800    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635838  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4259  peptidoglycan glycosyltransferase  60.32 
 
 		 888 aa  790    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1773  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  57.5 
 
 		 698 aa  749    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.488731  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4875  peptidoglycan glycosyltransferase  63.13 
 
 		 850 aa  820    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4244  peptidoglycan glycosyltransferase  58.86 
 
 		 857 aa  788    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1451  penicillin-binding protein  59.51 
 
 		 928 aa  798    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49387  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5146  peptidoglycan glycosyltransferase  58.54 
 
 		 732 aa  781    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.725403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0392  peptidoglycan glycosyltransferase  57.16 
 
 		 742 aa  766    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.431383 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1659  peptidoglycan glycosyltransferase  58.43 
 
 		 862 aa  786    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0514214  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3113  penicillin-binding protein  59.32 
 
 		 839 aa  800    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.988566  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2013  Peptidoglycan glycosyltransferase  60.9 
 
 		 834 aa  766    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.155902 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2346  penicillin-binding protein  59.51 
 
 		 844 aa  798    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2324  1A family penicillin-binding protein  60.92 
 
 		 787 aa  790    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4058  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 678 aa  1368    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3455  peptidoglycan glycosyltransferase  57.25 
 
 		 787 aa  764    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5014  peptidoglycan glycosyltransferase  58.37 
 
 		 743 aa  781    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0205014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  83.19 
 
 		 675 aa  1152    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2329  glycosyl transferase family protein  63.01 
 
 		 801 aa  812    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.212398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2197  putative penicillin-binding 1 (peptidoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  60.45 
 
 		 838 aa  781    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633683  decreased coverage  0.00350534 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3229  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  60.35 
 
 		 844 aa  796    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258839  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2065  glycosyl transferase family protein  78.72 
 
 		 686 aa  1106    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4835  peptidoglycan glycosyl transferase  63.1 
 
 		 826 aa  812    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191037  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2469  glycosyl transferase family protein  62.94 
 
 		 846 aa  790    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3108  peptidoglycan glycosyltransferase  58.08 
 
 		 743 aa  780    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4006  peptidoglycan glycosyltransferase  58.87 
 
 		 857 aa  778    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237546  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5259  peptidoglycan glycosyltransferase  58.08 
 
 		 743 aa  780    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2061  glycosyl transferase family protein  62.89 
 
 		 810 aa  853    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5993  peptidoglycan glycosyltransferase  59.06 
 
 		 858 aa  783    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3899  peptidoglycan glycosyltransferase  60.14 
 
 		 821 aa  812    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4361  peptidoglycan glycosyltransferase  58.87 
 
 		 857 aa  778    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.885871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3770  peptidoglycan glycosyltransferase  59 
 
 		 870 aa  788    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345724  normal  0.277872 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4618  glycosyl transferase family protein  57.76 
 
 		 728 aa  763    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  41.85 
 
 		 783 aa  458  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  35.99 
 
 		 774 aa  405  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  37.54 
 
 		 750 aa  403  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  38.32 
 
 		 730 aa  402  9.999999999999999e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  37.32 
 
 		 762 aa  395  1e-108  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  37.38 
 
 		 755 aa  389  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  37.48 
 
 		 752 aa  387  1e-106  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  36.98 
 
 		 760 aa  386  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0388  glycosyl transferase family 51  35.11 
 
 		 740 aa  382  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  39.25 
 
 		 681 aa  341  2e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0981  hypothetical protein  30.58 
 
 		 786 aa  335  2e-90  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1305  glycosyl transferase family 51  33.43 
 
 		 767 aa  334  3e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.551332 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  35.87 
 
 		 683 aa  333  4e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  34.8 
 
 		 648 aa  331  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  35.16 
 
 		 661 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  36.46 
 
 		 648 aa  324  4e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5029  glycosyl transferase family 51  32.15 
 
 		 765 aa  320  7e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1252  glycosyltransferase  31.98 
 
 		 776 aa  318  2e-85  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  35.32 
 
 		 646 aa  317  4e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0794  penicillin-binding protein 1A, putative  31.2 
 
 		 786 aa  314  2.9999999999999996e-84  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  35.83 
 
 		 811 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  34.77 
 
 		 683 aa  310  4e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0889  glycosyl transferase family protein  30.31 
 
 		 768 aa  310  5.9999999999999995e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  34.42 
 
 		 683 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  34.42 
 
 		 683 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  34.42 
 
 		 683 aa  307  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  34.42 
 
 		 683 aa  306  6e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  34.24 
 
 		 683 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  34.24 
 
 		 683 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3131  glycosyltransferase  30.37 
 
 		 759 aa  306  1.0000000000000001e-81  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47312  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  34.24 
 
 		 683 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  34.78 
 
 		 683 aa  303  7.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  34.77 
 
 		 683 aa  303  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  35.87 
 
 		 776 aa  302  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  34.77 
 
 		 683 aa  301  2e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  34.32 
 
 		 679 aa  301  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  38.1 
 
 		 714 aa  300  7e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  33.79 
 
 		 761 aa  299  1e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  35.28 
 
 		 710 aa  298  2e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  36.77 
 
 		 824 aa  298  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  36.44 
 
 		 765 aa  297  4e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  36.38 
 
 		 761 aa  296  6e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  33.79 
 
 		 649 aa  296  6e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  36.77 
 
 		 824 aa  296  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  37.91 
 
 		 734 aa  295  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  37.31 
 
 		 691 aa  295  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  37 
 
 		 714 aa  293  5e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  35.79 
 
 		 739 aa  293  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  34.27 
 
 		 806 aa  291  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  34.39 
 
 		 755 aa  290  4e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  37.52 
 
 		 728 aa  288  2e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  35.13 
 
 		 712 aa  288  2e-76  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  36.76 
 
 		 720 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  35.66 
 
 		 720 aa  288  2e-76  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  33.45 
 
 		 643 aa  288  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  33.45 
 
 		 643 aa  288  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  35.51 
 
 		 710 aa  286  8e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3332  1A family penicillin-binding protein  35.63 
 
 		 714 aa  286  9e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741858  hitchhiker  0.0086967 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0163  1A family penicillin-binding protein  31.12 
 
 		 713 aa  284  3.0000000000000004e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  31.82 
 
 		 766 aa  285  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  33.44 
 
 		 626 aa  285  3.0000000000000004e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  29.69 
 
 		 823 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  36.43 
 
 		 770 aa  284  5.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>