More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0889 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1474  glycosyl transferase family 51  59.49 
 
 
772 aa  914    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0249209  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03455  penicillin-binding protein 1A  58.25 
 
 
773 aa  883    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0889  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
768 aa  1607    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0176  glycosyltransferase  43.48 
 
 
762 aa  632  1e-180  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.368405  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0388  glycosyl transferase family 51  44.1 
 
 
740 aa  624  1e-177  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1305  glycosyl transferase family 51  42.61 
 
 
767 aa  616  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.551332 
 
 
-
 
NC_002950  PG0794  penicillin-binding protein 1A, putative  44.14 
 
 
786 aa  610  1e-173  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3131  glycosyltransferase  42.62 
 
 
759 aa  604  1.0000000000000001e-171  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47312  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5029  glycosyl transferase family 51  44.2 
 
 
765 aa  605  1.0000000000000001e-171  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1888  glycosyltransferase  42.84 
 
 
743 aa  589  1e-167  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3074  glycosyl transferase family 51  42.74 
 
 
854 aa  588  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.846458 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0981  hypothetical protein  40.34 
 
 
786 aa  587  1e-166  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6609  glycosyl transferase family 51  42.44 
 
 
794 aa  581  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911258  normal  0.0344936 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3220  glycosyl transferase family 51  42.04 
 
 
785 aa  582  1e-164  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259437  normal  0.206704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4764  glycosyl transferase family 51  42.67 
 
 
850 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193555  normal  0.0626376 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1915  glycosyl transferase family 51  38.21 
 
 
815 aa  530  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.70734 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1252  glycosyltransferase  38.33 
 
 
776 aa  487  1e-136  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314687  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  37.03 
 
 
774 aa  455  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1120  glycosyl transferase family 51  38.12 
 
 
907 aa  450  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  37.94 
 
 
752 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  36.38 
 
 
783 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  36.75 
 
 
762 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  36.25 
 
 
730 aa  439  1e-121  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  36.24 
 
 
750 aa  437  1e-121  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  35.97 
 
 
755 aa  434  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  35.94 
 
 
760 aa  432  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2013  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.51 
 
 
834 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.155902 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2197  putative penicillin-binding 1 (peptidoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  35.7 
 
 
838 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633683  decreased coverage  0.00350534 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5993  peptidoglycan glycosyltransferase  36.03 
 
 
858 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3899  peptidoglycan glycosyltransferase  33.93 
 
 
821 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0887  peptidoglycan glycosyltransferase  35.38 
 
 
841 aa  402  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1659  peptidoglycan glycosyltransferase  36.71 
 
 
862 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0514214  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4006  peptidoglycan glycosyltransferase  36.71 
 
 
857 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237546  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4361  peptidoglycan glycosyltransferase  36.71 
 
 
857 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.885871  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4244  peptidoglycan glycosyltransferase  36 
 
 
857 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164258  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3770  peptidoglycan glycosyltransferase  35.86 
 
 
870 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345724  normal  0.277872 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5014  peptidoglycan glycosyltransferase  34.41 
 
 
743 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0205014  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4875  peptidoglycan glycosyltransferase  34.27 
 
 
850 aa  393  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5259  peptidoglycan glycosyltransferase  34.48 
 
 
743 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297119  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3108  peptidoglycan glycosyltransferase  34.48 
 
 
743 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2061  glycosyl transferase family protein  34.41 
 
 
810 aa  392  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4835  peptidoglycan glycosyl transferase  34.96 
 
 
826 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191037  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4259  peptidoglycan glycosyltransferase  36.36 
 
 
888 aa  392  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990931  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3455  peptidoglycan glycosyltransferase  35.06 
 
 
787 aa  388  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19889  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0392  peptidoglycan glycosyltransferase  33.91 
 
 
742 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.431383 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2329  glycosyl transferase family protein  35.16 
 
 
801 aa  388  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.212398  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1674  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.19 
 
 
846 aa  384  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.339847  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2324  1A family penicillin-binding protein  35.64 
 
 
787 aa  384  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2081  glycosyl transferase family protein  35.09 
 
 
846 aa  385  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45351  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2469  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 
846 aa  379  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5146  peptidoglycan glycosyltransferase  33.76 
 
 
732 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.725403  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4618  glycosyl transferase family protein  34.85 
 
 
728 aa  372  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1773  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  33.24 
 
 
698 aa  352  1e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.488731  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2055  1A family penicillin-binding protein  33.67 
 
 
839 aa  350  7e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635838  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1451  penicillin-binding protein  33.67 
 
 
928 aa  350  7e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49387  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3113  penicillin-binding protein  33.67 
 
 
839 aa  350  7e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.988566  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2346  penicillin-binding protein  33.67 
 
 
844 aa  350  7e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1080  penicillin-binding protein  33.67 
 
 
844 aa  350  7e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366397  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1363  penicillin-binding protein  33.67 
 
 
844 aa  350  7e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3229  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  33.67 
 
 
844 aa  350  7e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258839  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  30.72 
 
 
818 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  31.16 
 
 
748 aa  332  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  29.97 
 
 
795 aa  326  9e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  31.15 
 
 
675 aa  320  7e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  27.2 
 
 
841 aa  315  2.9999999999999996e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  28.55 
 
 
794 aa  313  9e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  28.55 
 
 
794 aa  312  2e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  28.82 
 
 
829 aa  311  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  28.52 
 
 
827 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  28.23 
 
 
802 aa  308  3e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4058  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 
678 aa  307  5.0000000000000004e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0754  penicillin-binding protein, 1A family  30.91 
 
 
796 aa  302  1e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  28.32 
 
 
830 aa  298  3e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0334  1A family penicillin-binding protein  29.47 
 
 
847 aa  298  3e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  27.83 
 
 
804 aa  295  2e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0060  1A family penicillin-binding protein  28.36 
 
 
852 aa  295  3e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.133649 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1918  penicillin-binding protein, 1A family  29.93 
 
 
812 aa  293  7e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.176585  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2692  penicillin-binding protein  28.24 
 
 
846 aa  291  3e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000762848  hitchhiker  0.0050562 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2444  penicillin-binding protein 1A  28.54 
 
 
830 aa  291  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257563  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  29.43 
 
 
773 aa  291  3e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  28.54 
 
 
818 aa  291  4e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3374  penicillin-binding protein 1A  27.88 
 
 
846 aa  289  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  28.08 
 
 
797 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  29.62 
 
 
791 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1298  1A family penicillin-binding protein  27.81 
 
 
833 aa  288  4e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.144183  normal  0.788784 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4201  putative membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  27.94 
 
 
835 aa  287  5.999999999999999e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603081  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1016  penicillin-binding protein 1A  29.38 
 
 
778 aa  286  8e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2147  penicillin-binding protein 1A  28.38 
 
 
831 aa  286  8e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.173589  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1065  penicillin-binding protein 1A  30.23 
 
 
890 aa  286  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.375339  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0232  1A family penicillin-binding protein  29.43 
 
 
849 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.748115  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2212  penicillin-binding protein 1A  28.41 
 
 
835 aa  283  9e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4435  penicillin-binding protein, 1A family  29.23 
 
 
838 aa  283  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290819  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0911  putative penicillin-binding protein 1A  28.07 
 
 
819 aa  281  2e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.477143  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0916  penicillin-binding protein 1A, putative  28.39 
 
 
819 aa  281  3e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0207  1A family penicillin-binding protein  27.14 
 
 
861 aa  281  3e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0421791 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4119  1A family penicillin-binding protein  28.5 
 
 
844 aa  281  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.922666  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4090  1A family penicillin-binding protein  28.13 
 
 
844 aa  281  3e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4009  penicillin-binding protein, 1A family  28.38 
 
 
844 aa  281  4e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45310  Penicillin binding protein 1A  27.34 
 
 
819 aa  281  4e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5582  1A family penicillin-binding protein  28.23 
 
 
824 aa  280  6e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>