More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1305 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3074  glycosyl transferase family 51  46.48 
 
 		 854 aa  682    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.846458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4764  glycosyl transferase family 51  44.47 
 
 		 850 aa  672    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193555  normal  0.0626376 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3220  glycosyl transferase family 51  57.07 
 
 		 785 aa  910    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259437  normal  0.206704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5029  glycosyl transferase family 51  73.9 
 
 		 765 aa  1185    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0981  hypothetical protein  49.18 
 
 		 786 aa  740    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0176  glycosyltransferase  49.38 
 
 		 762 aa  712    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.368405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3131  glycosyltransferase  48.01 
 
 		 759 aa  686    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47312  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1305  glycosyl transferase family 51  100 
 
 		 767 aa  1597    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.551332 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0889  glycosyl transferase family protein  42.88 
 
 		 768 aa  624  1e-177  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1888  glycosyltransferase  42.56 
 
 		 743 aa  622  1e-177  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1915  glycosyl transferase family 51  43.75 
 
 		 815 aa  618  1e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.70734 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1474  glycosyl transferase family 51  43.72 
 
 		 772 aa  602  1.0000000000000001e-171  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0249209  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03455  penicillin-binding protein 1A  41.33 
 
 		 773 aa  569  1e-161  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0388  glycosyl transferase family 51  42.98 
 
 		 740 aa  550  1e-155  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0794  penicillin-binding protein 1A, putative  41.06 
 
 		 786 aa  529  1e-149  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6609  glycosyl transferase family 51  40.28 
 
 		 794 aa  530  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911258  normal  0.0344936 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  37.53 
 
 		 783 aa  456  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1252  glycosyltransferase  36.36 
 
 		 776 aa  451  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  36.98 
 
 		 774 aa  438  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4835  peptidoglycan glycosyl transferase  38.29 
 
 		 826 aa  432  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191037  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  36.87 
 
 		 730 aa  429  1e-118  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  36.39 
 
 		 752 aa  425  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1120  glycosyl transferase family 51  35.65 
 
 		 907 aa  421  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  36.51 
 
 		 755 aa  421  1e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2197  putative penicillin-binding 1 (peptidoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  37.25 
 
 		 838 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633683  decreased coverage  0.00350534 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  35.86 
 
 		 760 aa  417  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  36.4 
 
 		 750 aa  418  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2013  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.98 
 
 		 834 aa  415  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.155902 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4875  peptidoglycan glycosyltransferase  35.46 
 
 		 850 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  36.19 
 
 		 762 aa  409  1e-113  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3899  peptidoglycan glycosyltransferase  35.71 
 
 		 821 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0887  peptidoglycan glycosyltransferase  37.45 
 
 		 841 aa  406  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2061  glycosyl transferase family protein  35.14 
 
 		 810 aa  404  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2324  1A family penicillin-binding protein  36.38 
 
 		 787 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4006  peptidoglycan glycosyltransferase  35.28 
 
 		 857 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237546  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4361  peptidoglycan glycosyltransferase  35.28 
 
 		 857 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.885871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4244  peptidoglycan glycosyltransferase  35.34 
 
 		 857 aa  397  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5993  peptidoglycan glycosyltransferase  35.14 
 
 		 858 aa  399  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1659  peptidoglycan glycosyltransferase  35.95 
 
 		 862 aa  399  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0514214  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2329  glycosyl transferase family protein  36 
 
 		 801 aa  399  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.212398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3770  peptidoglycan glycosyltransferase  35.2 
 
 		 870 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345724  normal  0.277872 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2081  glycosyl transferase family protein  35.86 
 
 		 846 aa  393  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45351  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1674  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.07 
 
 		 846 aa  393  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.339847  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5259  peptidoglycan glycosyltransferase  36.01 
 
 		 743 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3108  peptidoglycan glycosyltransferase  36.01 
 
 		 743 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2469  glycosyl transferase family protein  34.34 
 
 		 846 aa  389  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4259  peptidoglycan glycosyltransferase  35.7 
 
 		 888 aa  389  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0392  peptidoglycan glycosyltransferase  34.76 
 
 		 742 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.431383 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5014  peptidoglycan glycosyltransferase  35.08 
 
 		 743 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0205014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4618  glycosyl transferase family protein  35.62 
 
 		 728 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3455  peptidoglycan glycosyltransferase  35.18 
 
 		 787 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5146  peptidoglycan glycosyltransferase  34.16 
 
 		 732 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.725403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  34.71 
 
 		 675 aa  369  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1363  penicillin-binding protein  33.7 
 
 		 844 aa  365  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2346  penicillin-binding protein  33.7 
 
 		 844 aa  365  1e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3113  penicillin-binding protein  33.7 
 
 		 839 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.988566  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1451  penicillin-binding protein  33.7 
 
 		 928 aa  365  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49387  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1080  penicillin-binding protein  33.7 
 
 		 844 aa  365  1e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366397  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2055  1A family penicillin-binding protein  33.7 
 
 		 839 aa  365  2e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635838  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3229  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  33.7 
 
 		 844 aa  365  2e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258839  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1773  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  35.78 
 
 		 698 aa  362  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.488731  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4058  glycosyl transferase family protein  33.72 
 
 		 678 aa  337  5e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  31.39 
 
 		 795 aa  330  7e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  31.44 
 
 		 818 aa  327  6e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  29.9 
 
 		 817 aa  323  7e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2065  glycosyl transferase family protein  31.7 
 
 		 686 aa  322  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56119  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5084  penicillin-binding protein, 1A family  29.51 
 
 		 817 aa  320  7e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.846696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4957  1A family penicillin-binding protein  29.51 
 
 		 817 aa  320  7e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0381  1A family penicillin-binding protein  28.75 
 
 		 817 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  31.67 
 
 		 797 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  30.78 
 
 		 830 aa  313  7.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0404  penicillin-binding protein 1A  29.78 
 
 		 815 aa  313  7.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0818527  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  29.65 
 
 		 841 aa  312  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  29.39 
 
 		 794 aa  311  2e-83  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  29.39 
 
 		 794 aa  311  2.9999999999999997e-83  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  29.46 
 
 		 827 aa  310  5e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0402  peptidoglycan glycosyltransferase  28.99 
 
 		 814 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.527889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  29.25 
 
 		 829 aa  308  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  28.04 
 
 		 748 aa  306  9.000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1298  1A family penicillin-binding protein  29.61 
 
 		 833 aa  305  2.0000000000000002e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.144183  normal  0.788784 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5133  penicillin-binding protein  29.17 
 
 		 814 aa  304  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0554788  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45310  Penicillin binding protein 1A  28.74 
 
 		 819 aa  303  7.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  27.45 
 
 		 823 aa  300  5e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4359  1A family penicillin-binding protein  30.05 
 
 		 810 aa  299  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1395  penicillin-binding protein, 1A family  29.97 
 
 		 809 aa  300  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47778  normal  0.639288 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  29.61 
 
 		 777 aa  298  2e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3949  penicillin-binding protein, 1A family  29.79 
 
 		 805 aa  298  2e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.665129 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3662  1A family penicillin-binding protein  29.91 
 
 		 833 aa  298  3e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  28.48 
 
 		 800 aa  298  4e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3955  penicillin-binding protein, 1A family  29.91 
 
 		 805 aa  297  4e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.755336 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4090  1A family penicillin-binding protein  28.34 
 
 		 844 aa  297  6e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5843  1A family penicillin-binding protein  29.1 
 
 		 808 aa  296  7e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.36925  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4009  penicillin-binding protein, 1A family  27.94 
 
 		 844 aa  296  8e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4119  1A family penicillin-binding protein  27.94 
 
 		 844 aa  296  8e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.922666  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  27.7 
 
 		 823 aa  296  9e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  28.32 
 
 		 794 aa  296  1e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  28.46 
 
 		 779 aa  296  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4669  1A family penicillin-binding protein  28.85 
 
 		 804 aa  295  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4271  peptidoglycan glycosyltransferase  28.13 
 
 		 843 aa  294  4e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  28.81 
 
 		 803 aa  293  6e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>