More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1773 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5146  peptidoglycan glycosyltransferase  71.63 
 
 		 732 aa  981    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.725403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5014  peptidoglycan glycosyltransferase  71.33 
 
 		 743 aa  1004    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0205014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2469  glycosyl transferase family protein  62.35 
 
 		 846 aa  806    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3113  penicillin-binding protein  72.98 
 
 		 839 aa  996    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.988566  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2061  glycosyl transferase family protein  59.91 
 
 		 810 aa  833    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1080  penicillin-binding protein  72.98 
 
 		 844 aa  996    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366397  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2055  1A family penicillin-binding protein  72.98 
 
 		 839 aa  996    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635838  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4244  peptidoglycan glycosyltransferase  70.93 
 
 		 857 aa  1002    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1773  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  100 
 
 		 698 aa  1426    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.488731  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4875  peptidoglycan glycosyltransferase  66.82 
 
 		 850 aa  904    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1451  penicillin-binding protein  72.98 
 
 		 928 aa  995    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49387  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3899  peptidoglycan glycosyltransferase  66.28 
 
 		 821 aa  941    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3229  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  72.98 
 
 		 844 aa  995    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258839  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0392  peptidoglycan glycosyltransferase  71.74 
 
 		 742 aa  992    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.431383 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1659  peptidoglycan glycosyltransferase  70.1 
 
 		 862 aa  989    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0514214  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2013  Peptidoglycan glycosyltransferase  67.89 
 
 		 834 aa  936    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.155902 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2346  penicillin-binding protein  72.98 
 
 		 844 aa  996    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0887  peptidoglycan glycosyltransferase  58.83 
 
 		 841 aa  779    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1363  penicillin-binding protein  72.98 
 
 		 844 aa  996    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5993  peptidoglycan glycosyltransferase  69.96 
 
 		 858 aa  981    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2324  1A family penicillin-binding protein  73.24 
 
 		 787 aa  979    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4058  glycosyl transferase family protein  57.81 
 
 		 678 aa  728    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  56.35 
 
 		 675 aa  750    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2329  glycosyl transferase family protein  62.78 
 
 		 801 aa  836    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.212398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2197  putative penicillin-binding 1 (peptidoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  68.19 
 
 		 838 aa  953    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633683  decreased coverage  0.00350534 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2081  glycosyl transferase family protein  62.61 
 
 		 846 aa  823    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45351  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4259  peptidoglycan glycosyltransferase  70.69 
 
 		 888 aa  951    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4835  peptidoglycan glycosyl transferase  66.22 
 
 		 826 aa  889    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191037  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1674  Peptidoglycan glycosyltransferase  62.31 
 
 		 846 aa  819    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.339847  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3108  peptidoglycan glycosyltransferase  70.9 
 
 		 743 aa  998    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4006  peptidoglycan glycosyltransferase  69.96 
 
 		 857 aa  965    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237546  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3455  peptidoglycan glycosyltransferase  73.37 
 
 		 787 aa  998    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5259  peptidoglycan glycosyltransferase  70.9 
 
 		 743 aa  998    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2065  glycosyl transferase family protein  55.75 
 
 		 686 aa  741    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3770  peptidoglycan glycosyltransferase  70.63 
 
 		 870 aa  999    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345724  normal  0.277872 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4618  glycosyl transferase family protein  70.86 
 
 		 728 aa  971    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4361  peptidoglycan glycosyltransferase  69.96 
 
 		 857 aa  965    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.885871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  48.12 
 
 		 783 aa  565  1e-160  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4764  glycosyl transferase family 51  39.07 
 
 		 850 aa  428  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193555  normal  0.0626376 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1888  glycosyltransferase  37.14 
 
 		 743 aa  425  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  37.33 
 
 		 750 aa  408  1.0000000000000001e-112  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  37.98 
 
 		 774 aa  405  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  36.8 
 
 		 730 aa  396  1e-109  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  38.3 
 
 		 755 aa  393  1e-108  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  37.11 
 
 		 752 aa  389  1e-107  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0176  glycosyltransferase  35.52 
 
 		 762 aa  386  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.368405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3074  glycosyl transferase family 51  36.22 
 
 		 854 aa  382  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.846458 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  36.72 
 
 		 762 aa  384  1e-105  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  37.01 
 
 		 760 aa  380  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0981  hypothetical protein  34.35 
 
 		 786 aa  373  1e-102  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6609  glycosyl transferase family 51  35.99 
 
 		 794 aa  375  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911258  normal  0.0344936 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0388  glycosyl transferase family 51  34.99 
 
 		 740 aa  371  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1915  glycosyl transferase family 51  33.96 
 
 		 815 aa  372  1e-101  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.70734 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1120  glycosyl transferase family 51  35.11 
 
 		 907 aa  365  2e-99  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0794  penicillin-binding protein 1A, putative  35.8 
 
 		 786 aa  363  6e-99  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3131  glycosyltransferase  31.85 
 
 		 759 aa  355  1e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47312  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1305  glycosyl transferase family 51  35.78 
 
 		 767 aa  354  4e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.551332 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0889  glycosyl transferase family protein  33.24 
 
 		 768 aa  353  8e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1474  glycosyl transferase family 51  33.71 
 
 		 772 aa  349  9e-95  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0249209  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03455  penicillin-binding protein 1A  32.95 
 
 		 773 aa  345  2e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5029  glycosyl transferase family 51  34.39 
 
 		 765 aa  342  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3220  glycosyl transferase family 51  33.71 
 
 		 785 aa  338  2.9999999999999997e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259437  normal  0.206704 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1252  glycosyltransferase  31.31 
 
 		 776 aa  336  1e-90  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  33.06 
 
 		 791 aa  302  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  32.27 
 
 		 797 aa  299  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  33.54 
 
 		 683 aa  298  3e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3949  penicillin-binding protein, 1A family  31.51 
 
 		 805 aa  297  4e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.665129 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0727  penicillin-binding protein, 1A family  33 
 
 		 804 aa  295  1e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0780  penicillin-binding protein 1A  32.87 
 
 		 804 aa  296  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0671  1A family penicillin-binding protein  32.34 
 
 		 805 aa  294  3e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.152404 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  34.69 
 
 		 646 aa  293  7e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1304  penicillin-binding protein, 1A family  32.88 
 
 		 819 aa  292  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0651627 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5843  1A family penicillin-binding protein  31.37 
 
 		 808 aa  290  8e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.36925  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6049  penicillin-binding protein, 1A family  31.94 
 
 		 805 aa  290  9e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4611  peptidoglycan synthetase  31.02 
 
 		 852 aa  289  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.241075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5582  1A family penicillin-binding protein  31.93 
 
 		 824 aa  289  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  30.75 
 
 		 748 aa  287  4e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  34.33 
 
 		 681 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4359  1A family penicillin-binding protein  31.65 
 
 		 810 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  32.26 
 
 		 797 aa  280  4e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  34.26 
 
 		 707 aa  280  6e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  34.07 
 
 		 679 aa  279  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0934  1A family penicillin-binding protein  30.66 
 
 		 803 aa  278  3e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.305447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3662  1A family penicillin-binding protein  30.89 
 
 		 833 aa  278  3e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3955  penicillin-binding protein, 1A family  30.89 
 
 		 805 aa  277  4e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.755336 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3992  bifunctional peptidoglycan glycosyl transferase/transpeptidase  33.75 
 
 		 687 aa  277  6e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155009  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  34.18 
 
 		 776 aa  276  7e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  32.24 
 
 		 830 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5438  1A family penicillin-binding protein  34.57 
 
 		 709 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4831  1A family penicillin-binding protein  34.57 
 
 		 709 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5424  penicillin-binding protein 1A  34.57 
 
 		 709 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1862  1A family penicillin-binding protein  31.42 
 
 		 839 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.000000145704  hitchhiker  0.0000925337 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  30.05 
 
 		 817 aa  275  3e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1935  1A family penicillin-binding protein  31.35 
 
 		 839 aa  274  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000247834  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0867  penicillin-binding protein 1A  32.3 
 
 		 835 aa  273  6e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.371617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4957  1A family penicillin-binding protein  30.13 
 
 		 817 aa  272  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  32.83 
 
 		 710 aa  272  2e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2082  1A family penicillin-binding protein  30.9 
 
 		 840 aa  272  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264276  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6131  penicillin-binding protein 1A  31.22 
 
 		 839 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353845  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1948  1A family penicillin-binding protein  31.22 
 
 		 839 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>