More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1120 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1120  glycosyl transferase family 51  100 
 
 		 907 aa  1870    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1252  glycosyltransferase  43.02 
 
 		 776 aa  553  1e-156  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1888  glycosyltransferase  38.53 
 
 		 743 aa  465  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0889  glycosyl transferase family protein  38.14 
 
 		 768 aa  457  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1474  glycosyl transferase family 51  37.1 
 
 		 772 aa  452  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0249209  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3220  glycosyl transferase family 51  37.47 
 
 		 785 aa  446  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259437  normal  0.206704 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03455  penicillin-binding protein 1A  36.2 
 
 		 773 aa  446  1e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0388  glycosyl transferase family 51  35.98 
 
 		 740 aa  441  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6609  glycosyl transferase family 51  36.54 
 
 		 794 aa  438  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911258  normal  0.0344936 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4764  glycosyl transferase family 51  36.02 
 
 		 850 aa  436  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193555  normal  0.0626376 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3131  glycosyltransferase  35.63 
 
 		 759 aa  431  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47312  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1915  glycosyl transferase family 51  36.68 
 
 		 815 aa  422  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.70734 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0981  hypothetical protein  35.34 
 
 		 786 aa  420  1e-116  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5029  glycosyl transferase family 51  36.56 
 
 		 765 aa  418  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3074  glycosyl transferase family 51  35.55 
 
 		 854 aa  419  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.846458 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  36.24 
 
 		 783 aa  415  1e-114  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  37.96 
 
 		 762 aa  414  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0176  glycosyltransferase  35.97 
 
 		 762 aa  413  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.368405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  36.48 
 
 		 730 aa  411  1e-113  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1305  glycosyl transferase family 51  35.23 
 
 		 767 aa  412  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.551332 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  36.26 
 
 		 752 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  36.12 
 
 		 760 aa  409  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0392  peptidoglycan glycosyltransferase  35.39 
 
 		 742 aa  405  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.431383 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3899  peptidoglycan glycosyltransferase  36.43 
 
 		 821 aa  405  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0794  penicillin-binding protein 1A, putative  36.38 
 
 		 786 aa  401  9.999999999999999e-111  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2197  putative penicillin-binding 1 (peptidoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  36.2 
 
 		 838 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633683  decreased coverage  0.00350534 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2013  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.32 
 
 		 834 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.155902 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5259  peptidoglycan glycosyltransferase  35.54 
 
 		 743 aa  399  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5014  peptidoglycan glycosyltransferase  35.54 
 
 		 743 aa  399  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0205014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2061  glycosyl transferase family protein  36.97 
 
 		 810 aa  397  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3108  peptidoglycan glycosyltransferase  35.54 
 
 		 743 aa  399  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5993  peptidoglycan glycosyltransferase  36.2 
 
 		 858 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4361  peptidoglycan glycosyltransferase  35.91 
 
 		 857 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.885871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4875  peptidoglycan glycosyltransferase  34.56 
 
 		 850 aa  391  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1659  peptidoglycan glycosyltransferase  35.45 
 
 		 862 aa  392  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0514214  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5146  peptidoglycan glycosyltransferase  35.24 
 
 		 732 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.725403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4006  peptidoglycan glycosyltransferase  35.91 
 
 		 857 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237546  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  37.72 
 
 		 750 aa  391  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3455  peptidoglycan glycosyltransferase  35.04 
 
 		 787 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4244  peptidoglycan glycosyltransferase  34.75 
 
 		 857 aa  388  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0887  peptidoglycan glycosyltransferase  36.04 
 
 		 841 aa  386  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3770  peptidoglycan glycosyltransferase  34.75 
 
 		 870 aa  388  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345724  normal  0.277872 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4618  glycosyl transferase family protein  35.73 
 
 		 728 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  35.02 
 
 		 755 aa  384  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1674  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.05 
 
 		 846 aa  384  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.339847  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2081  glycosyl transferase family protein  34.36 
 
 		 846 aa  385  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45351  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2329  glycosyl transferase family protein  36.01 
 
 		 801 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.212398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2469  glycosyl transferase family protein  35.97 
 
 		 846 aa  382  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4259  peptidoglycan glycosyltransferase  35.4 
 
 		 888 aa  381  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  35.75 
 
 		 774 aa  382  1e-104  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4835  peptidoglycan glycosyl transferase  35.92 
 
 		 826 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191037  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1773  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  34.65 
 
 		 698 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.488731  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1080  penicillin-binding protein  34.36 
 
 		 844 aa  364  4e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366397  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2346  penicillin-binding protein  34.36 
 
 		 844 aa  364  4e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1363  penicillin-binding protein  34.36 
 
 		 844 aa  364  4e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1451  penicillin-binding protein  34.36 
 
 		 928 aa  364  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49387  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3113  penicillin-binding protein  34.36 
 
 		 839 aa  363  6e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.988566  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2055  1A family penicillin-binding protein  34.36 
 
 		 839 aa  363  7.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635838  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3229  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  34.36 
 
 		 844 aa  363  7.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258839  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2324  1A family penicillin-binding protein  34.52 
 
 		 787 aa  358  3.9999999999999996e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2065  glycosyl transferase family protein  33.24 
 
 		 686 aa  340  5.9999999999999996e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56119  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0754  penicillin-binding protein, 1A family  31.77 
 
 		 796 aa  317  5e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  30.01 
 
 		 830 aa  303  1e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  30.91 
 
 		 841 aa  301  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  30.94 
 
 		 791 aa  299  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  29.45 
 
 		 794 aa  297  5e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  29.59 
 
 		 779 aa  297  5e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1268  1A family penicillin-binding protein  29.94 
 
 		 786 aa  297  7e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00608444  normal  0.905221 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  29.59 
 
 		 797 aa  296  1e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  29.85 
 
 		 823 aa  294  6e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  29.85 
 
 		 823 aa  294  7e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  29.81 
 
 		 792 aa  293  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  29.55 
 
 		 829 aa  293  1e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3486  penicillin-binding protein 1A  29.36 
 
 		 796 aa  292  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  29.71 
 
 		 817 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  29.74 
 
 		 827 aa  291  3e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0354  putative penicillin-binding 1 (peptoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  30.12 
 
 		 799 aa  291  4e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2296  penicillin-binding protein, 1A family  30.32 
 
 		 833 aa  291  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  29.96 
 
 		 796 aa  290  7e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3603  penicillin-binding protein, 1A family  29.99 
 
 		 799 aa  290  8e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00689676  hitchhiker  0.000000108854 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  31.68 
 
 		 794 aa  288  2e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  31.68 
 
 		 794 aa  289  2e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  29.33 
 
 		 803 aa  289  2e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0387  1A family penicillin-binding protein  29.09 
 
 		 797 aa  289  2e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495893  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0366  1A family penicillin-binding protein  29.09 
 
 		 797 aa  289  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.941804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  30.75 
 
 		 818 aa  289  2e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1961  putative penicillin-binding (peptidoglycan synthetase) transmembrane protein, mrcA  29.62 
 
 		 836 aa  289  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.935067  normal  0.0226413 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  30.14 
 
 		 795 aa  289  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5084  penicillin-binding protein, 1A family  29.51 
 
 		 817 aa  288  4e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.846696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0404  penicillin-binding protein 1A  29.58 
 
 		 815 aa  288  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0818527  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4957  1A family penicillin-binding protein  29.51 
 
 		 817 aa  288  4e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2976  penicillin-binding 1 transmembrane protein  29.94 
 
 		 801 aa  288  5e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.893289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0402  peptidoglycan glycosyltransferase  29.22 
 
 		 814 aa  287  5e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.527889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  29.29 
 
 		 804 aa  287  5.999999999999999e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0290  1A family penicillin-binding protein  28.72 
 
 		 797 aa  287  7e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308967  normal  0.891054 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3254  penicillin-binding protein, 1A family  29.62 
 
 		 777 aa  287  7e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0272171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45310  Penicillin binding protein 1A  29.71 
 
 		 819 aa  286  8e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0315  1A family penicillin-binding protein  29.16 
 
 		 795 aa  287  8e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.640379 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2720  penicillin-binding protein 1A  29.09 
 
 		 797 aa  287  8e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  28.78 
 
 		 791 aa  286  9e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>