More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4618 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A2346  penicillin-binding protein  70.31 
 
 		 844 aa  984    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2061  glycosyl transferase family protein  61.49 
 
 		 810 aa  853    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1080  penicillin-binding protein  70.31 
 
 		 844 aa  984    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366397  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2055  1A family penicillin-binding protein  70.31 
 
 		 839 aa  985    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635838  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5146  peptidoglycan glycosyltransferase  96.83 
 
 		 732 aa  1395    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.725403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1773  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  72.12 
 
 		 698 aa  989    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.488731  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4875  peptidoglycan glycosyltransferase  67.61 
 
 		 850 aa  929    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5259  peptidoglycan glycosyltransferase  90.53 
 
 		 743 aa  1354    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3113  penicillin-binding protein  70.31 
 
 		 839 aa  985    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.988566  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1451  penicillin-binding protein  70.31 
 
 		 928 aa  984    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49387  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4244  peptidoglycan glycosyltransferase  72.85 
 
 		 857 aa  1039    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5993  peptidoglycan glycosyltransferase  71.26 
 
 		 858 aa  1023    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0392  peptidoglycan glycosyltransferase  89.72 
 
 		 742 aa  1332    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.431383 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1659  peptidoglycan glycosyltransferase  71.26 
 
 		 862 aa  1026    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0514214  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2081  glycosyl transferase family protein  66.41 
 
 		 846 aa  879    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45351  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2065  glycosyl transferase family protein  58.54 
 
 		 686 aa  775    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1363  penicillin-binding protein  70.31 
 
 		 844 aa  984    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3455  peptidoglycan glycosyltransferase  83.91 
 
 		 787 aa  1212    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2324  1A family penicillin-binding protein  70.25 
 
 		 787 aa  965    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4058  glycosyl transferase family protein  57.98 
 
 		 678 aa  757    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2469  glycosyl transferase family protein  65.85 
 
 		 846 aa  858    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  58.36 
 
 		 675 aa  783    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2329  glycosyl transferase family protein  63.43 
 
 		 801 aa  866    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.212398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2197  putative penicillin-binding 1 (peptidoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  68.12 
 
 		 838 aa  966    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633683  decreased coverage  0.00350534 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4835  peptidoglycan glycosyl transferase  68.2 
 
 		 826 aa  937    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191037  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4259  peptidoglycan glycosyltransferase  71.85 
 
 		 888 aa  1007    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0887  peptidoglycan glycosyltransferase  59.74 
 
 		 841 aa  813    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3108  peptidoglycan glycosyltransferase  90.53 
 
 		 743 aa  1354    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4006  peptidoglycan glycosyltransferase  71.62 
 
 		 857 aa  1015    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237546  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1674  Peptidoglycan glycosyltransferase  66.11 
 
 		 846 aa  875    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.339847  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2013  Peptidoglycan glycosyltransferase  67.83 
 
 		 834 aa  949    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.155902 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3229  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  70.31 
 
 		 844 aa  984    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258839  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3899  peptidoglycan glycosyltransferase  65.84 
 
 		 821 aa  990    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3770  peptidoglycan glycosyltransferase  72.85 
 
 		 870 aa  1039    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345724  normal  0.277872 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4618  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 728 aa  1476    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5014  peptidoglycan glycosyltransferase  90.39 
 
 		 743 aa  1353    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0205014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4361  peptidoglycan glycosyltransferase  71.62 
 
 		 857 aa  1015    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.885871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  47.44 
 
 		 783 aa  582  1e-164  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4764  glycosyl transferase family 51  38.2 
 
 		 850 aa  468  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193555  normal  0.0626376 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  40.83 
 
 		 774 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  41.1 
 
 		 755 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1888  glycosyltransferase  37.44 
 
 		 743 aa  443  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  39.81 
 
 		 730 aa  443  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  40.31 
 
 		 762 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  40.57 
 
 		 752 aa  435  1e-120  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  39.53 
 
 		 750 aa  434  1e-120  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  39.7 
 
 		 760 aa  432  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3074  glycosyl transferase family 51  37.84 
 
 		 854 aa  429  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.846458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0388  glycosyl transferase family 51  35.52 
 
 		 740 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1915  glycosyl transferase family 51  34.65 
 
 		 815 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.70734 
 
 
-
 
NC_002950  PG0794  penicillin-binding protein 1A, putative  35.44 
 
 		 786 aa  396  1e-109  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0176  glycosyltransferase  34.88 
 
 		 762 aa  399  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.368405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0889  glycosyl transferase family protein  34.76 
 
 		 768 aa  394  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1120  glycosyl transferase family 51  35.98 
 
 		 907 aa  393  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6609  glycosyl transferase family 51  36.16 
 
 		 794 aa  395  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911258  normal  0.0344936 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1474  glycosyl transferase family 51  35.93 
 
 		 772 aa  391  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0249209  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0981  hypothetical protein  33.94 
 
 		 786 aa  391  1e-107  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3131  glycosyltransferase  34.02 
 
 		 759 aa  380  1e-104  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47312  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1305  glycosyl transferase family 51  35.62 
 
 		 767 aa  379  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.551332 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03455  penicillin-binding protein 1A  33.48 
 
 		 773 aa  370  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3220  glycosyl transferase family 51  33.56 
 
 		 785 aa  369  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259437  normal  0.206704 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1252  glycosyltransferase  32.94 
 
 		 776 aa  357  5e-97  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5029  glycosyl transferase family 51  33.75 
 
 		 765 aa  348  2e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  33.66 
 
 		 792 aa  326  9e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  34.57 
 
 		 791 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  36.29 
 
 		 679 aa  318  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3254  penicillin-binding protein, 1A family  32.83 
 
 		 777 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0272171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2907  penicillin-binding protein, 1A family  32.83 
 
 		 777 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0114663 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  32.59 
 
 		 794 aa  314  2.9999999999999996e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  32.73 
 
 		 779 aa  314  2.9999999999999996e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  33.19 
 
 		 797 aa  314  3.9999999999999997e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  32.51 
 
 		 777 aa  313  1e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2976  penicillin-binding 1 transmembrane protein  32.55 
 
 		 801 aa  311  2.9999999999999997e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.893289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0780  penicillin-binding protein 1A  32.28 
 
 		 804 aa  306  8.000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  32.85 
 
 		 766 aa  306  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0209  penicillin-binding protein 1A  33.15 
 
 		 771 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3992  bifunctional peptidoglycan glycosyl transferase/transpeptidase  34.75 
 
 		 687 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155009  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0023  1A family penicillin-binding protein  32.73 
 
 		 799 aa  303  7.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1862  1A family penicillin-binding protein  31.85 
 
 		 839 aa  299  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.000000145704  hitchhiker  0.0000925337 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  32.03 
 
 		 797 aa  299  1e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  33.8 
 
 		 681 aa  297  4e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  34.08 
 
 		 824 aa  297  5e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1935  1A family penicillin-binding protein  31.75 
 
 		 839 aa  297  5e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000247834  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1321  1A family penicillin-binding protein  31.75 
 
 		 837 aa  296  7e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000393559 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1972  1A family penicillin-binding protein  31.67 
 
 		 839 aa  296  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125323  normal  0.0456782 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6131  penicillin-binding protein 1A  31.67 
 
 		 839 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353845  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1948  1A family penicillin-binding protein  31.67 
 
 		 839 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135129  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1016  penicillin-binding protein 1A  33.1 
 
 		 778 aa  294  3e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  33.93 
 
 		 824 aa  295  3e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5582  1A family penicillin-binding protein  31.42 
 
 		 824 aa  294  3e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1139  penicillin-binding protein, 1A family  32.8 
 
 		 774 aa  295  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0388878  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5259  penicillin-binding protein 1A  32.08 
 
 		 838 aa  294  4e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000072806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0088  penicillin-binding protein, 1A family  32.54 
 
 		 778 aa  291  2e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0128257 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0671  1A family penicillin-binding protein  30.66 
 
 		 805 aa  292  2e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.152404 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1961  putative penicillin-binding (peptidoglycan synthetase) transmembrane protein, mrcA  32.1 
 
 		 836 aa  291  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.935067  normal  0.0226413 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  33.24 
 
 		 793 aa  290  6e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  31.73 
 
 		 791 aa  290  6e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0290  1A family penicillin-binding protein  31.36 
 
 		 797 aa  290  9e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308967  normal  0.891054 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1268  1A family penicillin-binding protein  31.4 
 
 		 840 aa  290  9e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3314  1A family penicillin-binding protein  31.4 
 
 		 840 aa  290  9e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.019725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>