More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03455 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_03455  penicillin-binding protein 1A  100 
 
 		 773 aa  1605    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1474  glycosyl transferase family 51  60.05 
 
 		 772 aa  949    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0249209  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0889  glycosyl transferase family protein  58.25 
 
 		 768 aa  884    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0388  glycosyl transferase family 51  44.25 
 
 		 740 aa  609  1e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0176  glycosyltransferase  41.79 
 
 		 762 aa  610  1e-173  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.368405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3131  glycosyltransferase  40.75 
 
 		 759 aa  590  1e-167  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47312  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_002950  PG0794  penicillin-binding protein 1A, putative  41.57 
 
 		 786 aa  587  1e-166  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0981  hypothetical protein  39.76 
 
 		 786 aa  582  1.0000000000000001e-165  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3074  glycosyl transferase family 51  41.08 
 
 		 854 aa  566  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.846458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1305  glycosyl transferase family 51  41.33 
 
 		 767 aa  562  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.551332 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6609  glycosyl transferase family 51  39.71 
 
 		 794 aa  558  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911258  normal  0.0344936 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5029  glycosyl transferase family 51  42.33 
 
 		 765 aa  555  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1888  glycosyltransferase  41.03 
 
 		 743 aa  555  1e-156  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4764  glycosyl transferase family 51  40.43 
 
 		 850 aa  548  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193555  normal  0.0626376 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3220  glycosyl transferase family 51  38.83 
 
 		 785 aa  545  1e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259437  normal  0.206704 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1915  glycosyl transferase family 51  37.13 
 
 		 815 aa  487  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.70734 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  37.24 
 
 		 783 aa  456  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1252  glycosyltransferase  35.28 
 
 		 776 aa  458  1e-127  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1120  glycosyl transferase family 51  35.93 
 
 		 907 aa  439  1e-121  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  35.1 
 
 		 774 aa  412  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  35.77 
 
 		 752 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  34.87 
 
 		 730 aa  405  1e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  35.72 
 
 		 750 aa  399  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  33.8 
 
 		 762 aa  392  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  34.1 
 
 		 760 aa  390  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3899  peptidoglycan glycosyltransferase  34.91 
 
 		 821 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2061  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 		 810 aa  380  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2197  putative penicillin-binding 1 (peptidoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  34.35 
 
 		 838 aa  379  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633683  decreased coverage  0.00350534 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  35.01 
 
 		 755 aa  379  1e-103  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0887  peptidoglycan glycosyltransferase  34.03 
 
 		 841 aa  373  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2013  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.55 
 
 		 834 aa  372  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.155902 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4875  peptidoglycan glycosyltransferase  33.91 
 
 		 850 aa  369  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1659  peptidoglycan glycosyltransferase  33.53 
 
 		 862 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0514214  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2329  glycosyl transferase family protein  35.25 
 
 		 801 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.212398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5014  peptidoglycan glycosyltransferase  33.48 
 
 		 743 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0205014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3770  peptidoglycan glycosyltransferase  32.67 
 
 		 870 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345724  normal  0.277872 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4244  peptidoglycan glycosyltransferase  32.81 
 
 		 857 aa  367  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3455  peptidoglycan glycosyltransferase  33.15 
 
 		 787 aa  366  1e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2081  glycosyl transferase family protein  34.56 
 
 		 846 aa  365  2e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45351  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4835  peptidoglycan glycosyl transferase  34.38 
 
 		 826 aa  365  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191037  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4618  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 		 728 aa  365  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2469  glycosyl transferase family protein  35.32 
 
 		 846 aa  364  4e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5993  peptidoglycan glycosyltransferase  33.67 
 
 		 858 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3108  peptidoglycan glycosyltransferase  32.55 
 
 		 743 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5259  peptidoglycan glycosyltransferase  32.55 
 
 		 743 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1674  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.33 
 
 		 846 aa  363  9e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.339847  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0392  peptidoglycan glycosyltransferase  33.05 
 
 		 742 aa  362  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.431383 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2324  1A family penicillin-binding protein  35.23 
 
 		 787 aa  363  1e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5146  peptidoglycan glycosyltransferase  33.47 
 
 		 732 aa  362  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.725403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4259  peptidoglycan glycosyltransferase  33.43 
 
 		 888 aa  362  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4006  peptidoglycan glycosyltransferase  33.53 
 
 		 857 aa  361  3e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237546  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4361  peptidoglycan glycosyltransferase  33.53 
 
 		 857 aa  361  3e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.885871  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2055  1A family penicillin-binding protein  33.9 
 
 		 839 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635838  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2346  penicillin-binding protein  33.9 
 
 		 844 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1080  penicillin-binding protein  33.9 
 
 		 844 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366397  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1363  penicillin-binding protein  33.9 
 
 		 844 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3229  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  33.9 
 
 		 844 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258839  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3113  penicillin-binding protein  34.05 
 
 		 839 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.988566  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1451  penicillin-binding protein  33.9 
 
 		 928 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49387  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1773  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  32.95 
 
 		 698 aa  345  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.488731  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0754  penicillin-binding protein, 1A family  31.08 
 
 		 796 aa  319  1e-85  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  28.84 
 
 		 818 aa  314  2.9999999999999996e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  27.81 
 
 		 841 aa  311  2e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  29.33 
 
 		 773 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  29.8 
 
 		 748 aa  311  4e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  28.07 
 
 		 794 aa  303  8.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  28.07 
 
 		 794 aa  303  1e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  27.92 
 
 		 827 aa  301  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2321  1A family penicillin-binding protein  29.99 
 
 		 862 aa  302  2e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.10527  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  28.32 
 
 		 818 aa  301  4e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  27.42 
 
 		 795 aa  299  1e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  29.37 
 
 		 830 aa  298  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  29.13 
 
 		 802 aa  298  4e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3133  1A family penicillin-binding protein  28.99 
 
 		 796 aa  296  7e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1716  penicillin-binding protein 1A  30.33 
 
 		 831 aa  296  7e-79  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0706575  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  27.97 
 
 		 829 aa  296  7e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4435  penicillin-binding protein, 1A family  29.34 
 
 		 838 aa  296  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5843  1A family penicillin-binding protein  28.61 
 
 		 808 aa  295  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.36925  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5582  1A family penicillin-binding protein  27.99 
 
 		 824 aa  293  1e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  29.95 
 
 		 797 aa  290  6e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  28.99 
 
 		 766 aa  290  6e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2266  1A family penicillin-binding protein  28.61 
 
 		 819 aa  288  2e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6049  penicillin-binding protein, 1A family  28.33 
 
 		 805 aa  288  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4121  1A family penicillin-binding protein  27.07 
 
 		 814 aa  288  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.739203  hitchhiker  0.00000203551 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0404  penicillin-binding protein 1A  28.5 
 
 		 815 aa  287  4e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0818527  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2444  penicillin-binding protein 1A  29.5 
 
 		 830 aa  286  9e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257563  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0189  penicillin-binding protein, 1A family  29.35 
 
 		 799 aa  286  9e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.149953  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0911  putative penicillin-binding protein 1A  28.48 
 
 		 819 aa  286  1.0000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.477143  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1824  penicillin-binding protein 1A  30.42 
 
 		 843 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0792156  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0253  peptidoglycan synthetase  28.12 
 
 		 852 aa  285  3.0000000000000004e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.570569  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0023  1A family penicillin-binding protein  27.7 
 
 		 799 aa  285  3.0000000000000004e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432475  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0916  penicillin-binding protein 1A, putative  28.36 
 
 		 819 aa  284  4.0000000000000003e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4201  putative membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  28.44 
 
 		 835 aa  284  5.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603081  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  27.32 
 
 		 779 aa  284  5.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  27.01 
 
 		 794 aa  283  6.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0402  peptidoglycan glycosyltransferase  27.01 
 
 		 814 aa  283  9e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.527889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3949  penicillin-binding protein, 1A family  27.64 
 
 		 805 aa  282  1e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.665129 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3662  1A family penicillin-binding protein  27.52 
 
 		 833 aa  282  2e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3955  penicillin-binding protein, 1A family  27.52 
 
 		 805 aa  281  2e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.755336 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  28.08 
 
 		 797 aa  282  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>