More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0189 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0189  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 
799 aa  1645    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.149953  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  34.87 
 
 
795 aa  439  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0757  penicillin-binding protein  32.83 
 
 
932 aa  430  1e-119  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  34.78 
 
 
797 aa  425  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0803  penicillin-binding protein, 1A  35.09 
 
 
823 aa  422  1e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  34.69 
 
 
796 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  34.8 
 
 
777 aa  409  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0354  putative penicillin-binding 1 (peptoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  35.06 
 
 
799 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  35.69 
 
 
794 aa  403  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  35.83 
 
 
779 aa  404  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2321  1A family penicillin-binding protein  34.22 
 
 
862 aa  405  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.10527  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3603  penicillin-binding protein, 1A family  34.93 
 
 
799 aa  406  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00689676  hitchhiker  0.000000108854 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  34.71 
 
 
818 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0671  1A family penicillin-binding protein  33.66 
 
 
805 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.152404 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0780  penicillin-binding protein 1A  34.82 
 
 
804 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0290  1A family penicillin-binding protein  35.55 
 
 
797 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308967  normal  0.891054 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  34.34 
 
 
793 aa  397  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  34.79 
 
 
791 aa  398  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0315  1A family penicillin-binding protein  35.22 
 
 
795 aa  399  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.640379 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1741  penicillin-binding protein  32.55 
 
 
846 aa  394  1e-108  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.213477  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  33.21 
 
 
830 aa  394  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0366  1A family penicillin-binding protein  35.45 
 
 
797 aa  394  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.941804  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0404  penicillin-binding protein 1A  32.1 
 
 
815 aa  393  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0818527  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1395  penicillin-binding protein, 1A family  32.94 
 
 
809 aa  395  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47778  normal  0.639288 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1752  1A family penicillin-binding protein  36.36 
 
 
770 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1797  penicillin-binding protein 1a  33.59 
 
 
818 aa  395  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2720  penicillin-binding protein 1A  34.87 
 
 
797 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  35.5 
 
 
797 aa  396  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0306  1A family penicillin-binding protein  34.96 
 
 
797 aa  395  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2802  1A family penicillin-binding protein  36.36 
 
 
797 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.437708  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3705  1A family penicillin-binding protein  36.23 
 
 
797 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2752  1A family penicillin-binding protein  36.23 
 
 
797 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0209  penicillin-binding protein 1A  34.62 
 
 
771 aa  392  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3763  1A family penicillin-binding protein  36.1 
 
 
797 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.763292  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3486  penicillin-binding protein 1A  34.83 
 
 
796 aa  391  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  34.87 
 
 
797 aa  392  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  35.16 
 
 
748 aa  391  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4271  peptidoglycan glycosyltransferase  31.71 
 
 
843 aa  392  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3201  1A family penicillin-binding protein  36.23 
 
 
797 aa  391  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0387  1A family penicillin-binding protein  35.1 
 
 
797 aa  392  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495893  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3133  1A family penicillin-binding protein  32.91 
 
 
796 aa  389  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2976  penicillin-binding 1 transmembrane protein  34.44 
 
 
801 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.893289  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0402  peptidoglycan glycosyltransferase  32.23 
 
 
814 aa  389  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.527889  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  34.28 
 
 
791 aa  386  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3734  1A family penicillin-binding protein  36.1 
 
 
797 aa  389  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5582  1A family penicillin-binding protein  34.62 
 
 
824 aa  389  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0381  1A family penicillin-binding protein  32.65 
 
 
817 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1961  putative penicillin-binding (peptidoglycan synthetase) transmembrane protein, mrcA  34.18 
 
 
836 aa  388  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.935067  normal  0.0226413 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1862  1A family penicillin-binding protein  34.57 
 
 
839 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.000000145704  hitchhiker  0.0000925337 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3114  peptidoglycan glycosyltransferase  34.72 
 
 
793 aa  388  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.183749 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  34.07 
 
 
800 aa  387  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5084  penicillin-binding protein, 1A family  31.51 
 
 
817 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.846696  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0024  penicillin-binding protein, 1A family  34.44 
 
 
802 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0023  1A family penicillin-binding protein  35.44 
 
 
799 aa  385  1e-105  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432475  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4957  1A family penicillin-binding protein  31.51 
 
 
817 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3254  penicillin-binding protein, 1A family  34.58 
 
 
777 aa  385  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0272171  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  33.68 
 
 
792 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  32.12 
 
 
823 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6131  penicillin-binding protein 1A  34.74 
 
 
839 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353845  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0092  1A family penicillin-binding protein  35.33 
 
 
778 aa  384  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000436892  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1935  1A family penicillin-binding protein  34.44 
 
 
839 aa  386  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000247834  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  33.29 
 
 
802 aa  383  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  31.88 
 
 
823 aa  383  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1948  1A family penicillin-binding protein  34.74 
 
 
839 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135129  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2907  penicillin-binding protein, 1A family  34.58 
 
 
777 aa  385  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0114663 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  33.25 
 
 
818 aa  381  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0088  penicillin-binding protein, 1A family  34.26 
 
 
778 aa  382  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0128257 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  33.04 
 
 
794 aa  380  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2253  1A family penicillin-binding protein  35.95 
 
 
803 aa  381  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.816825  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  31.55 
 
 
817 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  31.19 
 
 
803 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1972  1A family penicillin-binding protein  34.61 
 
 
839 aa  382  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125323  normal  0.0456782 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0060  1A family penicillin-binding protein  31.85 
 
 
852 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.133649 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1321  1A family penicillin-binding protein  33.82 
 
 
837 aa  378  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000393559 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5259  penicillin-binding protein 1A  34.3 
 
 
838 aa  379  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000072806  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  32.27 
 
 
841 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  33.73 
 
 
804 aa  379  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2147  penicillin-binding protein 1A  33.67 
 
 
831 aa  377  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.173589  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2082  1A family penicillin-binding protein  33.55 
 
 
840 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264276  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  33.08 
 
 
827 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2266  1A family penicillin-binding protein  33.63 
 
 
819 aa  379  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  33.12 
 
 
829 aa  378  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  33.52 
 
 
766 aa  375  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2091  penicillin-binding protein 1A  31.65 
 
 
793 aa  375  1e-102  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4669  1A family penicillin-binding protein  32.29 
 
 
804 aa  374  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0960  1A family penicillin-binding protein  33.82 
 
 
817 aa  376  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0340726 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2574  1A family penicillin-binding protein  33.96 
 
 
791 aa  374  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.95541 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1139  penicillin-binding protein, 1A family  34.28 
 
 
774 aa  373  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0388878  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3374  penicillin-binding protein 1A  31.35 
 
 
846 aa  370  1e-101  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0074  penicillin-binding protein, 1A family  32.01 
 
 
852 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0118  multimodular transpeptidase-transglycosylase PBP 1A  31.41 
 
 
793 aa  372  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1298  1A family penicillin-binding protein  32.99 
 
 
833 aa  372  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.144183  normal  0.788784 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45310  Penicillin binding protein 1A  31.02 
 
 
819 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0727  penicillin-binding protein, 1A family  33.08 
 
 
804 aa  368  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2369  1A family penicillin-binding protein  33.38 
 
 
852 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5843  1A family penicillin-binding protein  33.42 
 
 
808 aa  367  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.36925  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  31.52 
 
 
817 aa  366  1e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6049  penicillin-binding protein, 1A family  34.08 
 
 
805 aa  365  1e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.141532  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3949  penicillin-binding protein, 1A family  32.79 
 
 
805 aa  365  2e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.665129 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3215  penicillin-binding protein, 1A family  33.38 
 
 
778 aa  365  2e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>