More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5146 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A3229  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  72.35 
 
 
844 aa  979    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258839  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2346  penicillin-binding protein  70.37 
 
 
844 aa  983    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2061  glycosyl transferase family protein  61.13 
 
 
810 aa  855    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0887  peptidoglycan glycosyltransferase  59.17 
 
 
841 aa  807    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4244  peptidoglycan glycosyltransferase  71.19 
 
 
857 aa  1042    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164258  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3113  penicillin-binding protein  71.59 
 
 
839 aa  982    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.988566  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2055  1A family penicillin-binding protein  71.59 
 
 
839 aa  981    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635838  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1773  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  72.57 
 
 
698 aa  996    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.488731  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4875  peptidoglycan glycosyltransferase  67.61 
 
 
850 aa  928    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3899  peptidoglycan glycosyltransferase  65.84 
 
 
821 aa  991    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1451  penicillin-binding protein  71.59 
 
 
928 aa  981    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49387  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0392  peptidoglycan glycosyltransferase  89.5 
 
 
742 aa  1330    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.431383 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1659  peptidoglycan glycosyltransferase  69.26 
 
 
862 aa  1026    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0514214  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1080  penicillin-binding protein  70.37 
 
 
844 aa  983    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366397  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2324  1A family penicillin-binding protein  72.41 
 
 
787 aa  965    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3455  peptidoglycan glycosyltransferase  83.45 
 
 
787 aa  1220    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19889  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4058  glycosyl transferase family protein  59.97 
 
 
678 aa  761    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1363  penicillin-binding protein  70.37 
 
 
844 aa  983    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  57.7 
 
 
675 aa  780    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2329  glycosyl transferase family protein  64.75 
 
 
801 aa  862    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.212398  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2197  putative penicillin-binding 1 (peptidoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  66.53 
 
 
838 aa  964    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633683  decreased coverage  0.00350534 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2469  glycosyl transferase family protein  65.69 
 
 
846 aa  855    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4835  peptidoglycan glycosyl transferase  68.34 
 
 
826 aa  938    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191037  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2081  glycosyl transferase family protein  63.86 
 
 
846 aa  874    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45351  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3108  peptidoglycan glycosyltransferase  89.64 
 
 
743 aa  1342    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4006  peptidoglycan glycosyltransferase  71.91 
 
 
857 aa  1014    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237546  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5993  peptidoglycan glycosyltransferase  71.55 
 
 
858 aa  1023    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4259  peptidoglycan glycosyltransferase  73.43 
 
 
888 aa  1004    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990931  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5014  peptidoglycan glycosyltransferase  89.64 
 
 
743 aa  1344    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0205014  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5146  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
732 aa  1483    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.725403  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2013  Peptidoglycan glycosyltransferase  67.54 
 
 
834 aa  951    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.155902 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3770  peptidoglycan glycosyltransferase  73.28 
 
 
870 aa  1041    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345724  normal  0.277872 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4618  glycosyl transferase family protein  96.83 
 
 
728 aa  1378    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2065  glycosyl transferase family protein  58.69 
 
 
686 aa  773    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56119  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4361  peptidoglycan glycosyltransferase  71.91 
 
 
857 aa  1014    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.885871  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5259  peptidoglycan glycosyltransferase  89.64 
 
 
743 aa  1342    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297119  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1674  Peptidoglycan glycosyltransferase  63.57 
 
 
846 aa  870    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.339847  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  45.93 
 
 
783 aa  579  1e-164  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4764  glycosyl transferase family 51  38.07 
 
 
850 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193555  normal  0.0626376 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  40.71 
 
 
755 aa  451  1e-125  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1888  glycosyltransferase  37.44 
 
 
743 aa  444  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  39.81 
 
 
730 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  40.65 
 
 
774 aa  442  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  40.31 
 
 
762 aa  438  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  40.41 
 
 
752 aa  433  1e-120  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  39.38 
 
 
750 aa  429  1e-119  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  39.39 
 
 
760 aa  426  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3074  glycosyl transferase family 51  37.61 
 
 
854 aa  423  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.846458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1915  glycosyl transferase family 51  33.65 
 
 
815 aa  400  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.70734 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0388  glycosyl transferase family 51  35.2 
 
 
740 aa  402  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0794  penicillin-binding protein 1A, putative  35.44 
 
 
786 aa  394  1e-108  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1120  glycosyl transferase family 51  35.98 
 
 
907 aa  394  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0981  hypothetical protein  34.4 
 
 
786 aa  395  1e-108  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0176  glycosyltransferase  34.58 
 
 
762 aa  394  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.368405  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0889  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 
768 aa  390  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1474  glycosyl transferase family 51  36.07 
 
 
772 aa  392  1e-107  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0249209  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6609  glycosyl transferase family 51  36.46 
 
 
794 aa  392  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911258  normal  0.0344936 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3131  glycosyltransferase  33.88 
 
 
759 aa  377  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47312  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1305  glycosyl transferase family 51  34.57 
 
 
767 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.551332 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03455  penicillin-binding protein 1A  33.19 
 
 
773 aa  366  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3220  glycosyl transferase family 51  33.15 
 
 
785 aa  362  2e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259437  normal  0.206704 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1252  glycosyltransferase  32.52 
 
 
776 aa  359  9.999999999999999e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314687  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5029  glycosyl transferase family 51  34.33 
 
 
765 aa  347  4e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  33.88 
 
 
792 aa  326  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  34.56 
 
 
791 aa  321  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  36.29 
 
 
679 aa  318  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  32.02 
 
 
777 aa  313  7.999999999999999e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3254  penicillin-binding protein, 1A family  32.51 
 
 
777 aa  311  4e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0272171  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2907  penicillin-binding protein, 1A family  32.51 
 
 
777 aa  311  4e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0114663 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  33.28 
 
 
661 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0780  penicillin-binding protein 1A  32.77 
 
 
804 aa  308  2.0000000000000002e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  31.9 
 
 
794 aa  307  5.0000000000000004e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2976  penicillin-binding 1 transmembrane protein  32.41 
 
 
801 aa  306  6e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.893289  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  32.85 
 
 
766 aa  306  6e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3992  bifunctional peptidoglycan glycosyl transferase/transpeptidase  34.75 
 
 
687 aa  306  6e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155009  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  31.9 
 
 
779 aa  306  1.0000000000000001e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  32.46 
 
 
797 aa  304  4.0000000000000003e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0209  penicillin-binding protein 1A  32.44 
 
 
771 aa  301  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1862  1A family penicillin-binding protein  31.94 
 
 
839 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.000000145704  hitchhiker  0.0000925337 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  33.89 
 
 
681 aa  298  2e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1935  1A family penicillin-binding protein  31.84 
 
 
839 aa  296  7e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000247834  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  33.78 
 
 
824 aa  296  9e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  33.53 
 
 
793 aa  296  1e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1972  1A family penicillin-binding protein  31.81 
 
 
839 aa  296  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125323  normal  0.0456782 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6131  penicillin-binding protein 1A  31.81 
 
 
839 aa  296  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353845  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1948  1A family penicillin-binding protein  31.81 
 
 
839 aa  296  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135129  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1139  penicillin-binding protein, 1A family  32.89 
 
 
774 aa  295  3e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0388878  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0092  1A family penicillin-binding protein  32.59 
 
 
778 aa  295  3e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000436892  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1321  1A family penicillin-binding protein  31.7 
 
 
837 aa  294  4e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000393559 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  33.63 
 
 
824 aa  294  4e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  34.65 
 
 
811 aa  291  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1961  putative penicillin-binding (peptidoglycan synthetase) transmembrane protein, mrcA  32.01 
 
 
836 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.935067  normal  0.0226413 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  29.97 
 
 
817 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2369  1A family penicillin-binding protein  31.47 
 
 
852 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0727  penicillin-binding protein, 1A family  33.38 
 
 
804 aa  289  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0290  1A family penicillin-binding protein  31.13 
 
 
797 aa  289  1e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308967  normal  0.891054 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  33.54 
 
 
646 aa  289  1e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3486  penicillin-binding protein 1A  31.06 
 
 
796 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2253  1A family penicillin-binding protein  32.78 
 
 
803 aa  288  2.9999999999999996e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.816825  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2296  penicillin-binding protein, 1A family  32.54 
 
 
833 aa  287  5e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>