More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0754 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0754  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 		 796 aa  1626    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0444  penicillin-binding protein, 1A family  40.69 
 
 		 848 aa  587  1e-166  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0671851  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  36.61 
 
 		 827 aa  504  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  36.69 
 
 		 829 aa  501  1e-140  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  36.92 
 
 		 818 aa  489  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  37.17 
 
 		 795 aa  483  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  36.61 
 
 		 797 aa  479  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3133  1A family penicillin-binding protein  36.99 
 
 		 796 aa  477  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  36.18 
 
 		 818 aa  474  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  36.65 
 
 		 841 aa  471  1.0000000000000001e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  34.21 
 
 		 802 aa  462  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2534  1A family penicillin-binding protein  34.71 
 
 		 804 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.401637  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  35.01 
 
 		 793 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  35.99 
 
 		 773 aa  456  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2326  1A family penicillin-binding protein  33.76 
 
 		 807 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.774073  unclonable  0.0000291309 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  34.74 
 
 		 830 aa  439  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3215  penicillin-binding protein, 1A family  36.18 
 
 		 778 aa  432  1e-119  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  35.33 
 
 		 777 aa  430  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  35.56 
 
 		 791 aa  424  1e-117  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1708  1A family penicillin-binding protein  34.45 
 
 		 818 aa  423  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2574  1A family penicillin-binding protein  34.08 
 
 		 791 aa  424  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.95541 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1298  1A family penicillin-binding protein  33.86 
 
 		 833 aa  424  1e-117  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.144183  normal  0.788784 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3124  penicillin-binding protein 1A  34.13 
 
 		 807 aa  421  1e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  35.19 
 
 		 804 aa  421  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2266  1A family penicillin-binding protein  33.63 
 
 		 819 aa  417  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  34.62 
 
 		 748 aa  419  9.999999999999999e-116  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0960  1A family penicillin-binding protein  32.94 
 
 		 817 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0340726 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5133  penicillin-binding protein  32.59 
 
 		 814 aa  412  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0554788  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  35.2 
 
 		 766 aa  409  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  33.84 
 
 		 796 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  36.41 
 
 		 794 aa  410  1e-113  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0402  peptidoglycan glycosyltransferase  32.72 
 
 		 814 aa  410  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.527889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0671  1A family penicillin-binding protein  34.16 
 
 		 805 aa  411  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.152404 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0092  1A family penicillin-binding protein  34.16 
 
 		 778 aa  410  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000436892  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0088  penicillin-binding protein, 1A family  34.28 
 
 		 778 aa  410  1e-113  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0128257 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  32.22 
 
 		 823 aa  412  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0916  penicillin-binding protein 1A, putative  32.82 
 
 		 819 aa  409  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  35.98 
 
 		 794 aa  409  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1824  penicillin-binding protein 1A  34.87 
 
 		 843 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0792156  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  31.85 
 
 		 823 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3603  penicillin-binding protein, 1A family  33.89 
 
 		 799 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00689676  hitchhiker  0.000000108854 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2253  1A family penicillin-binding protein  33.78 
 
 		 803 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.816825  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0911  putative penicillin-binding protein 1A  32.69 
 
 		 819 aa  408  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.477143  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  33.93 
 
 		 794 aa  405  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1716  penicillin-binding protein 1A  34.92 
 
 		 831 aa  403  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0706575  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  33.93 
 
 		 779 aa  404  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0354  putative penicillin-binding 1 (peptoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  33.61 
 
 		 799 aa  405  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3374  penicillin-binding protein 1A  32.6 
 
 		 846 aa  405  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  34.18 
 
 		 800 aa  405  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0404  penicillin-binding protein 1A  32.27 
 
 		 815 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0818527  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2091  penicillin-binding protein 1A  34.13 
 
 		 793 aa  401  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0934  1A family penicillin-binding protein  33.83 
 
 		 803 aa  401  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.305447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0727  penicillin-binding protein, 1A family  34.05 
 
 		 804 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0118  multimodular transpeptidase-transglycosylase PBP 1A  33.95 
 
 		 793 aa  400  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0780  penicillin-binding protein 1A  33.15 
 
 		 804 aa  401  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  31.76 
 
 		 817 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4121  1A family penicillin-binding protein  33.99 
 
 		 814 aa  402  9.999999999999999e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.739203  hitchhiker  0.00000203551 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45310  Penicillin binding protein 1A  32.37 
 
 		 819 aa  401  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  34.26 
 
 		 791 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1395  penicillin-binding protein, 1A family  32.63 
 
 		 809 aa  396  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47778  normal  0.639288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4201  putative membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  33.42 
 
 		 835 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603081  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2147  penicillin-binding protein 1A  33.16 
 
 		 831 aa  399  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.173589  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0381  1A family penicillin-binding protein  32.23 
 
 		 817 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4271  peptidoglycan glycosyltransferase  32.97 
 
 		 843 aa  396  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2321  1A family penicillin-binding protein  34.53 
 
 		 862 aa  399  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.10527  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5084  penicillin-binding protein, 1A family  31.25 
 
 		 817 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.846696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0209  penicillin-binding protein 1A  33.76 
 
 		 771 aa  395  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3486  penicillin-binding protein 1A  32.64 
 
 		 796 aa  394  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4957  1A family penicillin-binding protein  31.25 
 
 		 817 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0366  1A family penicillin-binding protein  32.72 
 
 		 797 aa  393  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.941804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3114  peptidoglycan glycosyltransferase  34.53 
 
 		 793 aa  392  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.183749 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2444  penicillin-binding protein 1A  33.84 
 
 		 830 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0290  1A family penicillin-binding protein  33.99 
 
 		 797 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308967  normal  0.891054 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0280  penicillin-binding protein 1A  31.27 
 
 		 839 aa  390  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4669  1A family penicillin-binding protein  34.02 
 
 		 804 aa  390  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1918  penicillin-binding protein, 1A family  33.19 
 
 		 812 aa  390  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.176585  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0246  penicillin-binding protein 1A  33.33 
 
 		 814 aa  392  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.47 
 
 		 817 aa  390  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0024  penicillin-binding protein, 1A family  33.53 
 
 		 802 aa  389  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0255  penicillin-binding protein 1A  32.03 
 
 		 865 aa  390  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5582  1A family penicillin-binding protein  32.83 
 
 		 824 aa  391  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  33.38 
 
 		 792 aa  391  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0387  1A family penicillin-binding protein  31.99 
 
 		 797 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495893  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4090  1A family penicillin-binding protein  31.93 
 
 		 844 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  33.63 
 
 		 797 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2976  penicillin-binding 1 transmembrane protein  33.38 
 
 		 801 aa  386  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.893289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1016  penicillin-binding protein 1A  32.46 
 
 		 778 aa  387  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  32.01 
 
 		 803 aa  386  1e-106  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0833  penicillin-binding protein, 1A family  34.08 
 
 		 807 aa  388  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2720  penicillin-binding protein 1A  31.98 
 
 		 797 aa  389  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4119  1A family penicillin-binding protein  32.05 
 
 		 844 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.922666  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1304  penicillin-binding protein, 1A family  32.76 
 
 		 819 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0651627 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0306  1A family penicillin-binding protein  32.54 
 
 		 797 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1797  penicillin-binding protein 1a  32.34 
 
 		 818 aa  383  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0315  1A family penicillin-binding protein  32.14 
 
 		 795 aa  385  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.640379 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  32.35 
 
 		 797 aa  384  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1961  putative penicillin-binding (peptidoglycan synthetase) transmembrane protein, mrcA  33.75 
 
 		 836 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.935067  normal  0.0226413 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3704  1A family penicillin-binding protein  31.78 
 
 		 839 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2288  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0241  1A family penicillin-binding protein  31.78 
 
 		 839 aa  383  1e-105  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3900  1A family penicillin-binding protein  31.9 
 
 		 839 aa  385  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247667  normal  0.227457 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>