More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3220 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3074  glycosyl transferase family 51  45.32 
 
 
854 aa  684    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.846458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1305  glycosyl transferase family 51  56.56 
 
 
767 aa  895    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.551332 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0981  hypothetical protein  45.64 
 
 
786 aa  686    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5029  glycosyl transferase family 51  61.97 
 
 
765 aa  964    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0176  glycosyltransferase  46.42 
 
 
762 aa  689    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.368405  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3131  glycosyltransferase  44.26 
 
 
759 aa  671    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47312  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3220  glycosyl transferase family 51  100 
 
 
785 aa  1643    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259437  normal  0.206704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4764  glycosyl transferase family 51  46.47 
 
 
850 aa  689    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193555  normal  0.0626376 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1915  glycosyl transferase family 51  42.99 
 
 
815 aa  626  1e-178  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.70734 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1888  glycosyltransferase  42.61 
 
 
743 aa  615  9.999999999999999e-175  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1474  glycosyl transferase family 51  42.97 
 
 
772 aa  585  1.0000000000000001e-165  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0249209  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0889  glycosyl transferase family protein  42.04 
 
 
768 aa  582  1e-164  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0388  glycosyl transferase family 51  40.43 
 
 
740 aa  546  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03455  penicillin-binding protein 1A  39.43 
 
 
773 aa  545  1e-153  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6609  glycosyl transferase family 51  40.93 
 
 
794 aa  530  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911258  normal  0.0344936 
 
 
-
 
NC_002950  PG0794  penicillin-binding protein 1A, putative  39.95 
 
 
786 aa  522  1e-146  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1252  glycosyltransferase  36.98 
 
 
776 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314687  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1120  glycosyl transferase family 51  37.76 
 
 
907 aa  441  9.999999999999999e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  37.69 
 
 
783 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  37.73 
 
 
762 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  36.72 
 
 
730 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  36.36 
 
 
760 aa  415  1e-114  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  35.56 
 
 
752 aa  412  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  35.06 
 
 
774 aa  406  1.0000000000000001e-112  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  37.29 
 
 
755 aa  404  1e-111  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0887  peptidoglycan glycosyltransferase  35.1 
 
 
841 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4875  peptidoglycan glycosyltransferase  35.11 
 
 
850 aa  399  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  35.49 
 
 
750 aa  396  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2329  glycosyl transferase family protein  35.92 
 
 
801 aa  399  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.212398  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2061  glycosyl transferase family protein  34.95 
 
 
810 aa  398  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4835  peptidoglycan glycosyl transferase  35.79 
 
 
826 aa  395  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191037  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3899  peptidoglycan glycosyltransferase  34.2 
 
 
821 aa  390  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2469  glycosyl transferase family protein  35.22 
 
 
846 aa  384  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1659  peptidoglycan glycosyltransferase  34.12 
 
 
862 aa  385  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0514214  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4244  peptidoglycan glycosyltransferase  34.03 
 
 
857 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164258  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4259  peptidoglycan glycosyltransferase  34.62 
 
 
888 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990931  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4006  peptidoglycan glycosyltransferase  34.78 
 
 
857 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237546  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5993  peptidoglycan glycosyltransferase  34.3 
 
 
858 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3770  peptidoglycan glycosyltransferase  33.89 
 
 
870 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345724  normal  0.277872 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4361  peptidoglycan glycosyltransferase  34.78 
 
 
857 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.885871  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2324  1A family penicillin-binding protein  34.57 
 
 
787 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2197  putative penicillin-binding 1 (peptidoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  34.83 
 
 
838 aa  382  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633683  decreased coverage  0.00350534 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1674  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.66 
 
 
846 aa  376  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.339847  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2081  glycosyl transferase family protein  34.66 
 
 
846 aa  376  1e-103  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45351  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2055  1A family penicillin-binding protein  34.81 
 
 
839 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635838  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3229  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  34.81 
 
 
844 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258839  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1451  penicillin-binding protein  34.81 
 
 
928 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49387  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2346  penicillin-binding protein  34.81 
 
 
844 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3113  penicillin-binding protein  34.81 
 
 
839 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.988566  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1080  penicillin-binding protein  34.81 
 
 
844 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366397  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1363  penicillin-binding protein  34.81 
 
 
844 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2013  Peptidoglycan glycosyltransferase  34.29 
 
 
834 aa  372  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.155902 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3108  peptidoglycan glycosyltransferase  33.43 
 
 
743 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5259  peptidoglycan glycosyltransferase  33.43 
 
 
743 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297119  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5014  peptidoglycan glycosyltransferase  32.61 
 
 
743 aa  368  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0205014  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3455  peptidoglycan glycosyltransferase  34.37 
 
 
787 aa  369  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19889  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0392  peptidoglycan glycosyltransferase  33.29 
 
 
742 aa  364  4e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.431383 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4618  glycosyl transferase family protein  34.31 
 
 
728 aa  360  6e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5146  peptidoglycan glycosyltransferase  33.01 
 
 
732 aa  355  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.725403  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1773  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  33.71 
 
 
698 aa  338  2.9999999999999997e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.488731  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  31.31 
 
 
795 aa  333  6e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  30.58 
 
 
818 aa  321  3.9999999999999996e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  30.06 
 
 
797 aa  320  7e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  29.81 
 
 
791 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0387  1A family penicillin-binding protein  30.26 
 
 
797 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495893  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0366  1A family penicillin-binding protein  30.26 
 
 
797 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.941804  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  29.5 
 
 
830 aa  314  4.999999999999999e-84  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2321  1A family penicillin-binding protein  29.46 
 
 
862 aa  313  5.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.10527  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2720  penicillin-binding protein 1A  30.26 
 
 
797 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3486  penicillin-binding protein 1A  30.13 
 
 
796 aa  313  9e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  30.67 
 
 
802 aa  313  1e-83  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0671  1A family penicillin-binding protein  30.46 
 
 
805 aa  311  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.152404 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0306  1A family penicillin-binding protein  29.87 
 
 
797 aa  312  2e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  29.44 
 
 
777 aa  310  5e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0315  1A family penicillin-binding protein  29.87 
 
 
795 aa  310  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.640379 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1298  1A family penicillin-binding protein  29.37 
 
 
833 aa  308  3e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.144183  normal  0.788784 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  30.05 
 
 
779 aa  307  5.0000000000000004e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0754  penicillin-binding protein, 1A family  29.68 
 
 
796 aa  307  6e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  30.07 
 
 
794 aa  306  6e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3603  penicillin-binding protein, 1A family  29.56 
 
 
799 aa  306  7e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00689676  hitchhiker  0.000000108854 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0290  1A family penicillin-binding protein  29.63 
 
 
797 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308967  normal  0.891054 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  29.51 
 
 
792 aa  306  1.0000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  30.03 
 
 
791 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  30.19 
 
 
797 aa  304  4.0000000000000003e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0354  putative penicillin-binding 1 (peptoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  29.11 
 
 
799 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  28.25 
 
 
748 aa  303  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  29.55 
 
 
827 aa  302  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  29.31 
 
 
794 aa  301  2e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  29.6 
 
 
829 aa  301  3e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  29.11 
 
 
841 aa  301  3e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45310  Penicillin binding protein 1A  27.82 
 
 
819 aa  301  3e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0404  penicillin-binding protein 1A  28.71 
 
 
815 aa  301  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0818527  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  29.18 
 
 
794 aa  300  7e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  27.92 
 
 
817 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  30.37 
 
 
773 aa  298  2e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  29.32 
 
 
796 aa  298  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  27.88 
 
 
823 aa  298  3e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0402  peptidoglycan glycosyltransferase  27.94 
 
 
814 aa  297  6e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.527889  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5084  penicillin-binding protein, 1A family  27.54 
 
 
817 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.846696  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4957  1A family penicillin-binding protein  27.54 
 
 
817 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>