More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1915 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3074  glycosyl transferase family 51  48.28 
 
 		 854 aa  727    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.846458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1915  glycosyl transferase family 51  100 
 
 		 815 aa  1694    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.70734 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4764  glycosyl transferase family 51  47.79 
 
 		 850 aa  741    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193555  normal  0.0626376 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0981  hypothetical protein  43.89 
 
 		 786 aa  655    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0176  glycosyltransferase  45.26 
 
 		 762 aa  683    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.368405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3131  glycosyltransferase  46.12 
 
 		 759 aa  695    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47312  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3220  glycosyl transferase family 51  42.99 
 
 		 785 aa  626  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259437  normal  0.206704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5029  glycosyl transferase family 51  44.31 
 
 		 765 aa  620  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1305  glycosyl transferase family 51  43.75 
 
 		 767 aa  612  9.999999999999999e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.551332 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1888  glycosyltransferase  41.25 
 
 		 743 aa  559  1e-158  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0889  glycosyl transferase family protein  38.21 
 
 		 768 aa  530  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0388  glycosyl transferase family 51  38.43 
 
 		 740 aa  505  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6609  glycosyl transferase family 51  39.03 
 
 		 794 aa  500  1e-140  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911258  normal  0.0344936 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1474  glycosyl transferase family 51  35.52 
 
 		 772 aa  488  1e-136  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0249209  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03455  penicillin-binding protein 1A  37.37 
 
 		 773 aa  484  1e-135  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0794  penicillin-binding protein 1A, putative  36.43 
 
 		 786 aa  454  1.0000000000000001e-126  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4875  peptidoglycan glycosyltransferase  36.32 
 
 		 850 aa  439  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0887  peptidoglycan glycosyltransferase  37.65 
 
 		 841 aa  438  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2197  putative penicillin-binding 1 (peptidoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  37.37 
 
 		 838 aa  432  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633683  decreased coverage  0.00350534 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  36.66 
 
 		 783 aa  431  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2061  glycosyl transferase family protein  35.73 
 
 		 810 aa  427  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2013  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.5 
 
 		 834 aa  429  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.155902 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5993  peptidoglycan glycosyltransferase  36.27 
 
 		 858 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4835  peptidoglycan glycosyl transferase  36.31 
 
 		 826 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191037  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1252  glycosyltransferase  36.78 
 
 		 776 aa  423  1e-117  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1120  glycosyl transferase family 51  37.26 
 
 		 907 aa  420  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4259  peptidoglycan glycosyltransferase  36.65 
 
 		 888 aa  421  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4361  peptidoglycan glycosyltransferase  36.74 
 
 		 857 aa  422  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.885871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4006  peptidoglycan glycosyltransferase  36.74 
 
 		 857 aa  422  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237546  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1659  peptidoglycan glycosyltransferase  36.3 
 
 		 862 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0514214  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3899  peptidoglycan glycosyltransferase  36.06 
 
 		 821 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2329  glycosyl transferase family protein  37.39 
 
 		 801 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.212398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4244  peptidoglycan glycosyltransferase  36.76 
 
 		 857 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3229  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  35.98 
 
 		 844 aa  415  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258839  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1363  penicillin-binding protein  35.98 
 
 		 844 aa  415  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1080  penicillin-binding protein  35.98 
 
 		 844 aa  415  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366397  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2055  1A family penicillin-binding protein  35.98 
 
 		 839 aa  416  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635838  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1451  penicillin-binding protein  35.98 
 
 		 928 aa  415  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49387  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2081  glycosyl transferase family protein  36.62 
 
 		 846 aa  414  1e-114  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45351  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2324  1A family penicillin-binding protein  36.12 
 
 		 787 aa  415  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3113  penicillin-binding protein  35.98 
 
 		 839 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.988566  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2346  penicillin-binding protein  35.98 
 
 		 844 aa  415  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3770  peptidoglycan glycosyltransferase  35.5 
 
 		 870 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345724  normal  0.277872 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1674  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.47 
 
 		 846 aa  411  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.339847  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2469  glycosyl transferase family protein  35.75 
 
 		 846 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5259  peptidoglycan glycosyltransferase  33.88 
 
 		 743 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3108  peptidoglycan glycosyltransferase  33.88 
 
 		 743 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3455  peptidoglycan glycosyltransferase  35.66 
 
 		 787 aa  403  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0392  peptidoglycan glycosyltransferase  33.56 
 
 		 742 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.431383 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5014  peptidoglycan glycosyltransferase  33.61 
 
 		 743 aa  399  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0205014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4618  glycosyl transferase family protein  34.96 
 
 		 728 aa  399  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  33.88 
 
 		 774 aa  389  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  33.68 
 
 		 752 aa  383  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  34.8 
 
 		 730 aa  384  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  33.46 
 
 		 760 aa  383  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4058  glycosyl transferase family protein  34.27 
 
 		 678 aa  375  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  34.88 
 
 		 755 aa  375  1e-102  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1773  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  33.96 
 
 		 698 aa  372  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.488731  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  33.58 
 
 		 762 aa  368  1e-100  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  32.41 
 
 		 750 aa  360  6e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  29.74 
 
 		 795 aa  310  6.999999999999999e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0209  penicillin-binding protein 1A  29.18 
 
 		 771 aa  302  2e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  28.72 
 
 		 830 aa  292  2e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  28.03 
 
 		 794 aa  288  2.9999999999999996e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  28.67 
 
 		 827 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  27.94 
 
 		 794 aa  287  5e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4231  penicillin-binding protein 1A  29.15 
 
 		 748 aa  285  2.0000000000000002e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4271  peptidoglycan glycosyltransferase  28.09 
 
 		 843 aa  284  6.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  29.08 
 
 		 791 aa  283  8.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  28.12 
 
 		 777 aa  282  2e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3704  1A family penicillin-binding protein  27.45 
 
 		 839 aa  280  6e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2288  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1936  penicillin-binding protein, 1A family  28.24 
 
 		 790 aa  279  2e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0024  penicillin-binding protein, 1A family  29.7 
 
 		 802 aa  278  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  29.32 
 
 		 791 aa  278  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0241  1A family penicillin-binding protein  27.33 
 
 		 839 aa  278  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4090  1A family penicillin-binding protein  26.55 
 
 		 844 aa  278  4e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  28.76 
 
 		 792 aa  278  4e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3900  1A family penicillin-binding protein  27.33 
 
 		 839 aa  277  7e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247667  normal  0.227457 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0280  penicillin-binding protein 1A  27.45 
 
 		 839 aa  276  8e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2266  1A family penicillin-binding protein  28.63 
 
 		 819 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0189  penicillin-binding protein, 1A family  27.61 
 
 		 799 aa  275  3e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.149953  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3374  penicillin-binding protein 1A  26.91 
 
 		 846 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0334  1A family penicillin-binding protein  27.98 
 
 		 847 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4009  penicillin-binding protein, 1A family  26.3 
 
 		 844 aa  273  7e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4119  1A family penicillin-binding protein  26.3 
 
 		 844 aa  273  7e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.922666  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0671  1A family penicillin-binding protein  29.52 
 
 		 805 aa  273  9e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.152404 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  27.27 
 
 		 797 aa  273  1e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  29.89 
 
 		 766 aa  272  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4208  1A family penicillin-binding protein  26.73 
 
 		 822 aa  271  4e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  28.06 
 
 		 818 aa  270  5e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1797  penicillin-binding protein 1a  29.89 
 
 		 818 aa  270  5.9999999999999995e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4435  penicillin-binding protein, 1A family  28.55 
 
 		 838 aa  270  5.9999999999999995e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.290819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  27.86 
 
 		 779 aa  270  7e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  29.16 
 
 		 793 aa  270  8e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  27.96 
 
 		 794 aa  270  8.999999999999999e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0255  penicillin-binding protein 1A  26.74 
 
 		 865 aa  270  8.999999999999999e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0780  penicillin-binding protein 1A  29.65 
 
 		 804 aa  270  1e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0916  penicillin-binding protein 1A, putative  29.37 
 
 		 819 aa  268  2.9999999999999995e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2976  penicillin-binding 1 transmembrane protein  28.43 
 
 		 801 aa  268  4e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.893289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0207  1A family penicillin-binding protein  26.35 
 
 		 861 aa  268  4e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0421791 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>