More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0207 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03248  fused penicillin-binding protein 1a: murein transglycosylase/murein transpeptidase  47.13 
 
 		 850 aa  807    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.952695  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0317  penicillin-binding protein, 1A family  47.13 
 
 		 850 aa  807    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0334  1A family penicillin-binding protein  77.14 
 
 		 847 aa  1337    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5084  penicillin-binding protein, 1A family  42.07 
 
 		 817 aa  643    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.846696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4067  peptidoglycan synthetase  49.76 
 
 		 851 aa  825    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0466  penicillin-binding protein  50.23 
 
 		 863 aa  806    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00034  penicillin-binding protein 1A  51.76 
 
 		 855 aa  907    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0280  penicillin-binding protein 1A  68.52 
 
 		 839 aa  1220    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0219  peptidoglycan synthetase  49.65 
 
 		 851 aa  811    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4119  1A family penicillin-binding protein  68.33 
 
 		 844 aa  1228    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.922666  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3690  peptidoglycan synthetase  49.47 
 
 		 850 aa  814    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3900  1A family penicillin-binding protein  67.55 
 
 		 839 aa  1222    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247667  normal  0.227457 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3591  peptidoglycan synthetase  47.02 
 
 		 850 aa  805    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.322941  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  45.08 
 
 		 794 aa  705    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  45.08 
 
 		 794 aa  707    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00516  bifunctional murein transglycosylase/transpeptidase  49.16 
 
 		 887 aa  866    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  43.22 
 
 		 823 aa  648    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3862  peptidoglycan synthetase  49.36 
 
 		 850 aa  813    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2091  penicillin-binding protein 1A  47.29 
 
 		 793 aa  739    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3799  peptidoglycan synthetase  49.47 
 
 		 850 aa  815    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0157  penicillin-binding protein, 1A family protein  50.23 
 
 		 851 aa  881    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0246  penicillin-binding protein 1A  44.51 
 
 		 814 aa  676    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4957  1A family penicillin-binding protein  42.19 
 
 		 817 aa  643    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4701  peptidoglycan synthetase  47.13 
 
 		 850 aa  807    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3374  penicillin-binding protein 1A  67.59 
 
 		 846 aa  1197    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4009  penicillin-binding protein, 1A family  68.21 
 
 		 844 aa  1228    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3889  peptidoglycan synthetase  50.41 
 
 		 851 aa  838    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3673  peptidoglycan synthetase  47.13 
 
 		 858 aa  807    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0454505  normal  0.370172 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  42.55 
 
 		 817 aa  653    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  43.05 
 
 		 804 aa  651    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4208  1A family penicillin-binding protein  67.7 
 
 		 822 aa  1187    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3867  peptidoglycan synthetase  47.13 
 
 		 850 aa  807    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.505357  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45310  Penicillin binding protein 1A  42.53 
 
 		 819 aa  663    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3773  peptidoglycan synthetase  47.13 
 
 		 850 aa  806    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2715  penicillin-binding protein 1A  50.29 
 
 		 832 aa  850    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3809  peptidoglycan synthetase  48.39 
 
 		 850 aa  800    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0207  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 		 861 aa  1769    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0421791 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0232  1A family penicillin-binding protein  73.87 
 
 		 849 aa  1306    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.748115  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3765  peptidoglycan synthetase  49.47 
 
 		 850 aa  815    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3972  peptidoglycan synthetase  49.65 
 
 		 851 aa  811    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0317  peptidoglycan synthetase  47.02 
 
 		 850 aa  805    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.47804  normal  0.149248 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002321  multimodular transpeptidase-transglycosylase  52.14 
 
 		 825 aa  882    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000241558  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2692  penicillin-binding protein  45.31 
 
 		 846 aa  717    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000762848  hitchhiker  0.0050562 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4611  peptidoglycan synthetase  48.53 
 
 		 852 aa  809    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.241075  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0253  peptidoglycan synthetase  50.82 
 
 		 852 aa  844    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.570569  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4090  1A family penicillin-binding protein  68.56 
 
 		 844 aa  1231    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0118  multimodular transpeptidase-transglycosylase PBP 1A  47.29 
 
 		 793 aa  738    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0255  penicillin-binding protein 1A  67.83 
 
 		 865 aa  1201    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4271  peptidoglycan glycosyltransferase  78.47 
 
 		 843 aa  1409    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0607  penicillin-binding protein 1A  41.51 
 
 		 839 aa  637    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0360567  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3733  peptidoglycan synthetase  49.65 
 
 		 851 aa  811    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0332  peptidoglycan synthetase  50.06 
 
 		 851 aa  819    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3712  1A family penicillin-binding protein  68.24 
 
 		 839 aa  1213    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.637834  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  44.11 
 
 		 823 aa  649    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0381  1A family penicillin-binding protein  42.41 
 
 		 817 aa  648    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  43.34 
 
 		 817 aa  641    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0723  1A family penicillin-binding protein  48.44 
 
 		 866 aa  837    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4121  1A family penicillin-binding protein  43.88 
 
 		 814 aa  663    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.739203  hitchhiker  0.00000203551 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1108  penicillin-binding protein 1A  45.23 
 
 		 846 aa  694    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3704  1A family penicillin-binding protein  68.29 
 
 		 839 aa  1220    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2288  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0241  1A family penicillin-binding protein  68.41 
 
 		 839 aa  1224    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0369  penicillin-binding protein, 1A family protein  73.18 
 
 		 885 aa  1299    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0358767  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3692  peptidoglycan synthetase  49.47 
 
 		 850 aa  815    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2212  penicillin-binding protein 1A  51.56 
 
 		 835 aa  875    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5133  penicillin-binding protein  41.78 
 
 		 814 aa  632  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0554788  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0404  penicillin-binding protein 1A  42.19 
 
 		 815 aa  630  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0818527  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  42.59 
 
 		 830 aa  629  1e-178  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0402  peptidoglycan glycosyltransferase  41.18 
 
 		 814 aa  628  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.527889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  41.17 
 
 		 803 aa  626  1e-178  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  41.15 
 
 		 800 aa  624  1e-177  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2253  1A family penicillin-binding protein  43.19 
 
 		 803 aa  620  1e-176  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.816825  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1936  penicillin-binding protein, 1A family  39.65 
 
 		 790 aa  605  1.0000000000000001e-171  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0825  1A family penicillin-binding protein  41.5 
 
 		 846 aa  593  1e-168  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.397118  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1790  1A family penicillin-binding protein  40.81 
 
 		 809 aa  567  1e-160  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1861  peptidoglycan glycosyltransferase  40.81 
 
 		 854 aa  566  1e-160  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.894237  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3241  penicillin-binding protein, 1A family  39.2 
 
 		 807 aa  567  1e-160  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1884  penicillin-binding protein 1A  39.49 
 
 		 868 aa  557  1e-157  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2174  penicillin-binding protein 1A  39.41 
 
 		 897 aa  558  1e-157  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.354055 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0395  1A family penicillin-binding protein  36.99 
 
 		 940 aa  544  1e-153  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000119849 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  37.1 
 
 		 777 aa  535  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  38.84 
 
 		 796 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  38.17 
 
 		 792 aa  532  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02356  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  39.07 
 
 		 809 aa  530  1e-149  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.448545  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2296  penicillin-binding protein, 1A family  39.02 
 
 		 833 aa  525  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0366  1A family penicillin-binding protein  38.05 
 
 		 797 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.941804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0387  1A family penicillin-binding protein  38.1 
 
 		 797 aa  523  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495893  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0354  putative penicillin-binding 1 (peptoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  38.94 
 
 		 799 aa  524  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3603  penicillin-binding protein, 1A family  38.81 
 
 		 799 aa  525  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00689676  hitchhiker  0.000000108854 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0290  1A family penicillin-binding protein  37.98 
 
 		 797 aa  524  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308967  normal  0.891054 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2976  penicillin-binding 1 transmembrane protein  38.68 
 
 		 801 aa  519  1e-146  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.893289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0315  1A family penicillin-binding protein  37.98 
 
 		 795 aa  521  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.640379 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0209  penicillin-binding protein 1A  39.08 
 
 		 771 aa  520  1e-146  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3486  penicillin-binding protein 1A  37.61 
 
 		 796 aa  521  1e-146  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2720  penicillin-binding protein 1A  37.73 
 
 		 797 aa  521  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  38.18 
 
 		 791 aa  519  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1961  putative penicillin-binding (peptidoglycan synthetase) transmembrane protein, mrcA  38.24 
 
 		 836 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.935067  normal  0.0226413 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0306  1A family penicillin-binding protein  37.98 
 
 		 797 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  37.9 
 
 		 793 aa  513  1e-144  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5259  penicillin-binding protein 1A  37.85 
 
 		 838 aa  512  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000072806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1268  1A family penicillin-binding protein  38.53 
 
 		 786 aa  511  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00608444  normal  0.905221 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>