More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2329 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_3455  peptidoglycan glycosyltransferase  62.73 
 
 		 787 aa  887    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0887  peptidoglycan glycosyltransferase  65.36 
 
 		 841 aa  885    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3229  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  64.95 
 
 		 844 aa  909    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258839  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2055  1A family penicillin-binding protein  64.51 
 
 		 839 aa  916    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635838  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1080  penicillin-binding protein  64.51 
 
 		 844 aa  916    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366397  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1773  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  62.78 
 
 		 698 aa  862    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.488731  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4875  peptidoglycan glycosyltransferase  68.36 
 
 		 850 aa  1009    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5259  peptidoglycan glycosyltransferase  64.78 
 
 		 743 aa  896    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1451  penicillin-binding protein  64.51 
 
 		 928 aa  915    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49387  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4244  peptidoglycan glycosyltransferase  64.47 
 
 		 857 aa  932    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5146  peptidoglycan glycosyltransferase  64.75 
 
 		 732 aa  870    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.725403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0392  peptidoglycan glycosyltransferase  65.29 
 
 		 742 aa  895    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.431383 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1659  peptidoglycan glycosyltransferase  63.19 
 
 		 862 aa  933    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0514214  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2061  glycosyl transferase family protein  66.54 
 
 		 810 aa  1047    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1674  Peptidoglycan glycosyltransferase  63.56 
 
 		 846 aa  881    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.339847  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2324  1A family penicillin-binding protein  65.18 
 
 		 787 aa  890    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2346  penicillin-binding protein  64.51 
 
 		 844 aa  916    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4259  peptidoglycan glycosyltransferase  64.68 
 
 		 888 aa  907    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3770  peptidoglycan glycosyltransferase  64.33 
 
 		 870 aa  932    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345724  normal  0.277872 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4058  glycosyl transferase family protein  63.24 
 
 		 678 aa  811    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4361  peptidoglycan glycosyltransferase  62.67 
 
 		 857 aa  912    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.885871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3899  peptidoglycan glycosyltransferase  62.89 
 
 		 821 aa  975    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  63.86 
 
 		 675 aa  857    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2329  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 801 aa  1636    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.212398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2197  putative penicillin-binding 1 (peptidoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  64.87 
 
 		 838 aa  983    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633683  decreased coverage  0.00350534 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3113  penicillin-binding protein  64.51 
 
 		 839 aa  916    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.988566  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5014  peptidoglycan glycosyltransferase  64.93 
 
 		 743 aa  895    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0205014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4835  peptidoglycan glycosyl transferase  67.48 
 
 		 826 aa  959    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191037  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2469  glycosyl transferase family protein  68.56 
 
 		 846 aa  906    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2081  glycosyl transferase family protein  61.66 
 
 		 846 aa  883    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45351  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3108  peptidoglycan glycosyltransferase  64.78 
 
 		 743 aa  896    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4006  peptidoglycan glycosyltransferase  62.67 
 
 		 857 aa  912    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237546  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5993  peptidoglycan glycosyltransferase  62.67 
 
 		 858 aa  924    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2065  glycosyl transferase family protein  62.43 
 
 		 686 aa  853    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4618  glycosyl transferase family protein  64.75 
 
 		 728 aa  864    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2013  Peptidoglycan glycosyltransferase  62.03 
 
 		 834 aa  952    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.155902 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1363  penicillin-binding protein  64.51 
 
 		 844 aa  916    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  49.7 
 
 		 783 aa  620  1e-176  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  40.42 
 
 		 762 aa  457  1e-127  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1888  glycosyltransferase  38.84 
 
 		 743 aa  453  1.0000000000000001e-126  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  40.09 
 
 		 750 aa  451  1e-125  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  41.07 
 
 		 755 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  40.03 
 
 		 730 aa  443  1e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  38.83 
 
 		 774 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  40.48 
 
 		 760 aa  439  1e-121  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4764  glycosyl transferase family 51  37.19 
 
 		 850 aa  426  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193555  normal  0.0626376 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3074  glycosyl transferase family 51  35.77 
 
 		 854 aa  424  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.846458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0388  glycosyl transferase family 51  37.25 
 
 		 740 aa  423  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  39.59 
 
 		 752 aa  425  1e-117  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1915  glycosyl transferase family 51  34.44 
 
 		 815 aa  421  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.70734 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1474  glycosyl transferase family 51  35.06 
 
 		 772 aa  404  1e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0249209  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0981  hypothetical protein  35.77 
 
 		 786 aa  405  1e-111  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6609  glycosyl transferase family 51  36.13 
 
 		 794 aa  402  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911258  normal  0.0344936 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3220  glycosyl transferase family 51  35.7 
 
 		 785 aa  401  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259437  normal  0.206704 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0176  glycosyltransferase  34.38 
 
 		 762 aa  400  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.368405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3131  glycosyltransferase  34.64 
 
 		 759 aa  398  1e-109  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47312  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5029  glycosyl transferase family 51  35.79 
 
 		 765 aa  392  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0889  glycosyl transferase family protein  34.13 
 
 		 768 aa  394  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1305  glycosyl transferase family 51  35.26 
 
 		 767 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.551332 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1120  glycosyl transferase family 51  36.01 
 
 		 907 aa  382  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0794  penicillin-binding protein 1A, putative  34.49 
 
 		 786 aa  378  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03455  penicillin-binding protein 1A  34.34 
 
 		 773 aa  366  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1252  glycosyltransferase  34.07 
 
 		 776 aa  355  2e-96  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  33.08 
 
 		 661 aa  313  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1304  penicillin-binding protein, 1A family  33.81 
 
 		 819 aa  312  1e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0651627 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  36.88 
 
 		 646 aa  311  2e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  31.96 
 
 		 800 aa  304  5.000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  31.71 
 
 		 830 aa  298  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  34.26 
 
 		 681 aa  298  4e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1797  penicillin-binding protein 1a  30.56 
 
 		 818 aa  297  5e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  31.81 
 
 		 817 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2266  1A family penicillin-binding protein  31.48 
 
 		 819 aa  296  8e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5084  penicillin-binding protein, 1A family  31.99 
 
 		 817 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.846696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4957  1A family penicillin-binding protein  31.99 
 
 		 817 aa  293  6e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0916  penicillin-binding protein 1A, putative  30.88 
 
 		 819 aa  293  7e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.274618  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1716  penicillin-binding protein 1A  30.29 
 
 		 831 aa  291  4e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0706575  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4831  1A family penicillin-binding protein  34.63 
 
 		 709 aa  291  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  34.03 
 
 		 761 aa  291  4e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5438  1A family penicillin-binding protein  34.63 
 
 		 709 aa  291  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5424  penicillin-binding protein 1A  34.63 
 
 		 709 aa  291  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0911  putative penicillin-binding protein 1A  30.6 
 
 		 819 aa  290  6e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.477143  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  32.94 
 
 		 649 aa  290  6e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1936  penicillin-binding protein, 1A family  32.05 
 
 		 790 aa  290  8e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  30.82 
 
 		 679 aa  290  8e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0381  1A family penicillin-binding protein  31.45 
 
 		 817 aa  290  1e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  31.75 
 
 		 794 aa  288  2e-76  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0402  peptidoglycan glycosyltransferase  31.14 
 
 		 814 aa  289  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.527889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  33.85 
 
 		 707 aa  288  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  30.65 
 
 		 777 aa  288  2e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2444  penicillin-binding protein 1A  31.69 
 
 		 830 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  29.1 
 
 		 823 aa  286  8e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  30.14 
 
 		 795 aa  286  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4669  1A family penicillin-binding protein  30.73 
 
 		 804 aa  286  1.0000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5133  penicillin-binding protein  30.93 
 
 		 814 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0554788  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5322  1A family penicillin-binding protein  34.69 
 
 		 714 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  30.57 
 
 		 793 aa  285  3.0000000000000004e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  30.01 
 
 		 766 aa  284  4.0000000000000003e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  33.23 
 
 		 648 aa  284  4.0000000000000003e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3332  1A family penicillin-binding protein  34.12 
 
 		 714 aa  284  5.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741858  hitchhiker  0.0086967 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  33.59 
 
 		 713 aa  284  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>