More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3455 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3899  peptidoglycan glycosyltransferase  67.09 
 
 
821 aa  995    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2061  glycosyl transferase family protein  59.94 
 
 
810 aa  850    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2013  Peptidoglycan glycosyltransferase  68.63 
 
 
834 aa  951    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.155902 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2055  1A family penicillin-binding protein  70.54 
 
 
839 aa  978    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.635838  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4244  peptidoglycan glycosyltransferase  72.89 
 
 
857 aa  1040    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0164258  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1773  glycosyl transferase family penicillin-binding protein transpeptidase  73.37 
 
 
698 aa  1000    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.488731  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4875  peptidoglycan glycosyltransferase  67.16 
 
 
850 aa  923    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1363  penicillin-binding protein  70.68 
 
 
844 aa  978    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5146  peptidoglycan glycosyltransferase  83.45 
 
 
732 aa  1226    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.725403  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3229  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  70.68 
 
 
844 aa  976    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.258839  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1451  penicillin-binding protein  70.68 
 
 
928 aa  978    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.49387  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5993  peptidoglycan glycosyltransferase  68.3 
 
 
858 aa  1026    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0392  peptidoglycan glycosyltransferase  84.14 
 
 
742 aa  1268    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.431383 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1659  peptidoglycan glycosyltransferase  71.93 
 
 
862 aa  1027    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0514214  normal  0.169753 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2469  glycosyl transferase family protein  65.54 
 
 
846 aa  847    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3113  penicillin-binding protein  70.54 
 
 
839 aa  977    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.988566  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2081  glycosyl transferase family protein  65.01 
 
 
846 aa  876    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.45351  normal  0.431878 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5014  peptidoglycan glycosyltransferase  84.3 
 
 
743 aa  1269    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0205014  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2324  1A family penicillin-binding protein  72.04 
 
 
787 aa  959    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1080  penicillin-binding protein  70.68 
 
 
844 aa  978    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366397  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2346  penicillin-binding protein  70.68 
 
 
844 aa  978    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0887  peptidoglycan glycosyltransferase  59.85 
 
 
841 aa  810    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.24195 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4058  glycosyl transferase family protein  57.1 
 
 
678 aa  751    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2084  peptidoglycan glycosyltransferase  55.77 
 
 
675 aa  759    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2329  glycosyl transferase family protein  62.73 
 
 
801 aa  868    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.212398  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2197  putative penicillin-binding 1 (peptidoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  68.34 
 
 
838 aa  963    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.633683  decreased coverage  0.00350534 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1674  Peptidoglycan glycosyltransferase  64.87 
 
 
846 aa  875    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.339847  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4835  peptidoglycan glycosyl transferase  68.25 
 
 
826 aa  931    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.191037  normal  0.0433282 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2065  glycosyl transferase family protein  56.81 
 
 
686 aa  759    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.56119  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3108  peptidoglycan glycosyltransferase  84.43 
 
 
743 aa  1269    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4006  peptidoglycan glycosyltransferase  68.17 
 
 
857 aa  1013    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237546  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4259  peptidoglycan glycosyltransferase  73.76 
 
 
888 aa  1012    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.990931  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3770  peptidoglycan glycosyltransferase  72.89 
 
 
870 aa  1038    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.345724  normal  0.277872 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4618  glycosyl transferase family protein  84.22 
 
 
728 aa  1194    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3455  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
787 aa  1584    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.19889  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4361  peptidoglycan glycosyltransferase  68.17 
 
 
857 aa  1013    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.885871  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5259  peptidoglycan glycosyltransferase  84.43 
 
 
743 aa  1269    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.297119  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0274  penicillin-binding protein, 1A family  47.83 
 
 
783 aa  585  1.0000000000000001e-165  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4764  glycosyl transferase family 51  39.28 
 
 
850 aa  466  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193555  normal  0.0626376 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  41.56 
 
 
774 aa  451  1e-125  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  41.32 
 
 
750 aa  451  1e-125  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1888  glycosyltransferase  38.04 
 
 
743 aa  451  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0246487 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  40.15 
 
 
730 aa  452  1e-125  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  40.63 
 
 
762 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  40.55 
 
 
755 aa  446  1e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  40.88 
 
 
752 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0301  1A family penicillin-binding protein  39.33 
 
 
760 aa  434  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0794  penicillin-binding protein 1A, putative  36.74 
 
 
786 aa  415  1e-114  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6609  glycosyl transferase family 51  36.9 
 
 
794 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911258  normal  0.0344936 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3074  glycosyl transferase family 51  36.93 
 
 
854 aa  407  1.0000000000000001e-112  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.846458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1915  glycosyl transferase family 51  35.66 
 
 
815 aa  404  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.70734 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0388  glycosyl transferase family 51  35.48 
 
 
740 aa  402  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0176  glycosyltransferase  34.05 
 
 
762 aa  395  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.368405  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0981  hypothetical protein  34.2 
 
 
786 aa  391  1e-107  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.250374 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1474  glycosyl transferase family 51  36.13 
 
 
772 aa  386  1e-106  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0249209  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0889  glycosyl transferase family protein  35.06 
 
 
768 aa  388  1e-106  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1252  glycosyltransferase  34.27 
 
 
776 aa  384  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314687  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3131  glycosyltransferase  33.38 
 
 
759 aa  383  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.47312  normal  0.698693 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1120  glycosyl transferase family 51  35.52 
 
 
907 aa  382  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1305  glycosyl transferase family 51  35.18 
 
 
767 aa  372  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.551332 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3220  glycosyl transferase family 51  34.37 
 
 
785 aa  369  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.259437  normal  0.206704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5029  glycosyl transferase family 51  35.39 
 
 
765 aa  367  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03455  penicillin-binding protein 1A  33.38 
 
 
773 aa  365  1e-99  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  33.24 
 
 
792 aa  310  6.999999999999999e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  34.14 
 
 
791 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  32.31 
 
 
777 aa  307  6e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  32.09 
 
 
794 aa  306  1.0000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0209  penicillin-binding protein 1A  32.66 
 
 
771 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  32.99 
 
 
797 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  32.09 
 
 
779 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0780  penicillin-binding protein 1A  32.86 
 
 
804 aa  304  4.0000000000000003e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  32.62 
 
 
797 aa  303  9e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  33.1 
 
 
766 aa  301  4e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  34.67 
 
 
648 aa  300  5e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0911  putative penicillin-binding protein 1A  31.52 
 
 
819 aa  299  2e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.477143  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  33.74 
 
 
661 aa  297  4e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0727  penicillin-binding protein, 1A family  33.64 
 
 
804 aa  298  4e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1016  penicillin-binding protein 1A  33.19 
 
 
778 aa  297  5e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  35.61 
 
 
679 aa  297  5e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5582  1A family penicillin-binding protein  31.19 
 
 
824 aa  296  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3254  penicillin-binding protein, 1A family  32.67 
 
 
777 aa  296  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0272171  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2907  penicillin-binding protein, 1A family  32.67 
 
 
777 aa  296  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0114663 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2253  1A family penicillin-binding protein  33.56 
 
 
803 aa  295  2e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.816825  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0671  1A family penicillin-binding protein  31.53 
 
 
805 aa  295  3e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.152404 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2976  penicillin-binding 1 transmembrane protein  32.52 
 
 
801 aa  294  4e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.893289  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  33.96 
 
 
824 aa  292  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1936  penicillin-binding protein, 1A family  34.18 
 
 
790 aa  290  5.0000000000000004e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  33.81 
 
 
824 aa  290  9e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3949  penicillin-binding protein, 1A family  32.04 
 
 
805 aa  287  4e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.665129 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1935  1A family penicillin-binding protein  32.1 
 
 
839 aa  287  4e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000247834  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1862  1A family penicillin-binding protein  32.1 
 
 
839 aa  287  7e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.000000145704  hitchhiker  0.0000925337 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  30.35 
 
 
804 aa  287  7e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1139  penicillin-binding protein, 1A family  32.69 
 
 
774 aa  286  8e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0388878  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  35.52 
 
 
681 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5259  penicillin-binding protein 1A  31.63 
 
 
838 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000072806  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0023  1A family penicillin-binding protein  31.52 
 
 
799 aa  285  3.0000000000000004e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432475  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3603  penicillin-binding protein, 1A family  31.79 
 
 
799 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00689676  hitchhiker  0.000000108854 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0354  putative penicillin-binding 1 (peptoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  31.94 
 
 
799 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1321  1A family penicillin-binding protein  31.68 
 
 
837 aa  284  6.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000393559 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0387  1A family penicillin-binding protein  31.48 
 
 
797 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495893  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>