More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1065 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_1065  penicillin-binding protein 1A  100 
 
 		 890 aa  1839    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.375339  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0290  1A family penicillin-binding protein  35.33 
 
 		 757 aa  447  1.0000000000000001e-124  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1297  penicillin-binding protein 1B  33.5 
 
 		 780 aa  399  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2557  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1B  33.94 
 
 		 778 aa  401  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000207966  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0908  1A family penicillin-binding protein  33.38 
 
 		 766 aa  399  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1002  penicillin-binding protein 1B  33.16 
 
 		 772 aa  392  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000067337 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4547  penicillin-binding protein 1B  32.99 
 
 		 773 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.428177  hitchhiker  0.00000222687 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4683  penicillin-binding protein 1B  32.98 
 
 		 773 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000305505 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0977  penicillin-binding protein  32.71 
 
 		 773 aa  384  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0441683  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0842  peptidoglycan glycosyltransferase  32.92 
 
 		 773 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122469 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4792  penicillin-binding protein 1B  32.6 
 
 		 774 aa  384  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000464587  hitchhiker  0.000389854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0751  penicillin-binding protein 1B  32.15 
 
 		 773 aa  386  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.288465  hitchhiker  0.0000000000686308 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4681  penicillin-binding protein 1B  32.86 
 
 		 773 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  hitchhiker  0.00000000000605496 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0825  Mutator MutT  33.03 
 
 		 777 aa  370  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00304949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62200  penicillin-binding protein 1B  33.69 
 
 		 774 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.379753 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5415  penicillin-binding protein 1B  33.69 
 
 		 775 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1620  penicillin-binding protein 1B  32.36 
 
 		 881 aa  365  2e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000878907  unclonable  0.000000000879141 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1407  penicillin-binding protein 1B  33.6 
 
 		 748 aa  363  7.0000000000000005e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0297434  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42560  penicillin-binding protein 1B  33.11 
 
 		 780 aa  361  4e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  40.71 
 
 		 739 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1154  penicillin-binding protein 1B  31.36 
 
 		 776 aa  356  1e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0650  penicillin-binding protein 1B  31.59 
 
 		 830 aa  355  2e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0679  penicillin-binding protein 1B  31.45 
 
 		 772 aa  355  2e-96  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.963541  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3164  penicillin-binding protein 1B  31.32 
 
 		 768 aa  354  4e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1646  penicillin-binding protein 1B  30.52 
 
 		 827 aa  353  7e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.201466  hitchhiker  0.00102238 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  37.99 
 
 		 618 aa  353  8.999999999999999e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0489  penicillin-binding protein 1B  31.11 
 
 		 781 aa  352  1e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.290067  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1468  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  30.26 
 
 		 827 aa  349  1e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.614381  unclonable  0.0000024056 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0623  penicillin-binding protein 1B  30.88 
 
 		 764 aa  347  4e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494369 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  36.38 
 
 		 683 aa  347  7e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  33.23 
 
 		 649 aa  347  7e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  36.38 
 
 		 683 aa  345  2e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002568  multimodular transpeptidase-transglycosylase  30.98 
 
 		 790 aa  344  4e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  37.5 
 
 		 761 aa  344  4e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  36.22 
 
 		 683 aa  344  5e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  36.22 
 
 		 683 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0624  penicillin-binding protein 1B  30.75 
 
 		 764 aa  343  5.999999999999999e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3406  penicillin-binding protein 1B  30.75 
 
 		 764 aa  343  5.999999999999999e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  37.24 
 
 		 643 aa  343  8e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  37.24 
 
 		 643 aa  343  8e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  38.1 
 
 		 734 aa  343  9e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2163  penicillin-binding protein 1B  31.89 
 
 		 732 aa  343  9e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  36.17 
 
 		 683 aa  343  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  36.17 
 
 		 683 aa  343  1e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  39.9 
 
 		 732 aa  342  1e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  39.26 
 
 		 734 aa  342  2e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0583  penicillin-binding protein 1B  31.94 
 
 		 774 aa  342  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3742  penicillin-binding protein 1B  31.6 
 
 		 791 aa  341  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  36.22 
 
 		 683 aa  341  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1672  penicillin-binding protein, putative  30.41 
 
 		 759 aa  341  4e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  35.6 
 
 		 683 aa  341  4e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  36.07 
 
 		 683 aa  341  5e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0633  penicillin-binding protein 1B  30.88 
 
 		 768 aa  340  7e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  39.31 
 
 		 735 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3685  penicillin-binding protein 1B  31.5 
 
 		 774 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  36.22 
 
 		 683 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  39.2 
 
 		 720 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3868  penicillin-binding protein 1B  31.68 
 
 		 774 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  36.91 
 
 		 765 aa  338  2.9999999999999997e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0656  penicillin-binding protein 1B  30.38 
 
 		 779 aa  337  5.999999999999999e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  34.59 
 
 		 661 aa  337  7e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  35.29 
 
 		 683 aa  336  1e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  34 
 
 		 648 aa  336  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  35.93 
 
 		 683 aa  335  2e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  36.32 
 
 		 643 aa  335  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2971  peptidoglycan glycosyltransferase  31.68 
 
 		 779 aa  335  3e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  36.71 
 
 		 681 aa  334  5e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2797  penicillin-binding protein, 1A family  37.1 
 
 		 677 aa  333  7.000000000000001e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  34.87 
 
 		 693 aa  332  2e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  36.22 
 
 		 646 aa  331  3e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0092  1A family penicillin-binding protein  34.2 
 
 		 778 aa  331  4e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000436892  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  37.22 
 
 		 757 aa  331  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  32.55 
 
 		 667 aa  330  7e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03443  hypothetical protein  29.58 
 
 		 796 aa  329  1.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  33.33 
 
 		 766 aa  328  3e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  34.08 
 
 		 662 aa  326  1e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  35.13 
 
 		 648 aa  326  1e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4301  penicillin-binding protein  28.84 
 
 		 769 aa  325  3e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3123  penicillin-binding protein 1B  29.53 
 
 		 789 aa  325  3e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000774308 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2602  penicillin-binding protein transpeptidase  30.39 
 
 		 791 aa  324  4e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.809187  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  34.63 
 
 		 751 aa  324  4e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  34.96 
 
 		 727 aa  324  4e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1036  penicillin-binding protein 1b  30.4 
 
 		 833 aa  324  5e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.970019  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  32.4 
 
 		 806 aa  324  5e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3792  penicillin-binding protein 1B  29.59 
 
 		 790 aa  323  8e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.692226  decreased coverage  0.000000907679 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  37.63 
 
 		 727 aa  323  9.000000000000001e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0590  penicillin-binding protein 1A  35.15 
 
 		 762 aa  322  9.999999999999999e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3114  peptidoglycan glycosyltransferase  33.78 
 
 		 793 aa  322  1.9999999999999998e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.183749 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  35.3 
 
 		 656 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2643  penicillin-binding protein, 1A family  35.65 
 
 		 755 aa  321  3e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0163  1A family penicillin-binding protein  33.92 
 
 		 713 aa  322  3e-86  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  33.28 
 
 		 744 aa  320  7e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  37.94 
 
 		 709 aa  320  9e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  32.96 
 
 		 704 aa  319  1e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1239  peptidoglycan glycosyltransferase  29.59 
 
 		 766 aa  318  2e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.191968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0705  penicillin-binding protein 1B  28.54 
 
 		 790 aa  319  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.559633  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3270  penicillin-binding protein 1B  29.17 
 
 		 766 aa  318  3e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3095  penicillin-binding protein 1B  31.92 
 
 		 813 aa  318  4e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.911918 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  35.92 
 
 		 625 aa  318  4e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  34.31 
 
 		 642 aa  317  7e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>