More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1620 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4683  penicillin-binding protein 1B  44.76 
 
 		 773 aa  639    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000305505 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1672  penicillin-binding protein, putative  44.65 
 
 		 759 aa  653    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4681  penicillin-binding protein 1B  44.63 
 
 		 773 aa  639    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  hitchhiker  0.00000000000605496 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1468  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  66.87 
 
 		 827 aa  1161    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.614381  unclonable  0.0000024056 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1297  penicillin-binding protein 1B  43.79 
 
 		 780 aa  640    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2557  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1B  44.25 
 
 		 778 aa  644    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000207966  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1620  penicillin-binding protein 1B  100 
 
 		 881 aa  1816    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000878907  unclonable  0.000000000879141 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1002  penicillin-binding protein 1B  43.91 
 
 		 772 aa  639    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000067337 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1646  penicillin-binding protein 1B  66.75 
 
 		 827 aa  1157    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.201466  hitchhiker  0.00102238 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0679  penicillin-binding protein 1B  43.77 
 
 		 772 aa  659    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.963541  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4547  penicillin-binding protein 1B  44.76 
 
 		 773 aa  639    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.428177  hitchhiker  0.00000222687 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1407  penicillin-binding protein 1B  44.99 
 
 		 748 aa  642    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0297434  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0751  penicillin-binding protein 1B  44 
 
 		 773 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.288465  hitchhiker  0.0000000000686308 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42560  penicillin-binding protein 1B  44.13 
 
 		 780 aa  632  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4792  penicillin-binding protein 1B  44.22 
 
 		 774 aa  630  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000464587  hitchhiker  0.000389854 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0825  Mutator MutT  43.62 
 
 		 777 aa  631  1e-179  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00304949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5415  penicillin-binding protein 1B  43.45 
 
 		 775 aa  626  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0842  peptidoglycan glycosyltransferase  44.69 
 
 		 773 aa  625  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122469 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0977  penicillin-binding protein  44.41 
 
 		 773 aa  623  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0441683  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62200  penicillin-binding protein 1B  43.98 
 
 		 774 aa  623  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.379753 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1154  penicillin-binding protein 1B  42.41 
 
 		 776 aa  611  1e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2163  penicillin-binding protein 1B  43.83 
 
 		 732 aa  609  1e-173  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0650  penicillin-binding protein 1B  41.47 
 
 		 830 aa  572  1.0000000000000001e-162  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3894  peptidoglycan glycosyltransferase  41.24 
 
 		 787 aa  548  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0705  penicillin-binding protein 1B  40.55 
 
 		 790 aa  543  1e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.559633  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3164  penicillin-binding protein 1B  40.46 
 
 		 768 aa  542  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0633  penicillin-binding protein 1B  39.32 
 
 		 768 aa  538  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3868  penicillin-binding protein 1B  38.66 
 
 		 774 aa  533  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3742  penicillin-binding protein 1B  38.91 
 
 		 791 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0583  penicillin-binding protein 1B  38.8 
 
 		 774 aa  535  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3792  penicillin-binding protein 1B  40.32 
 
 		 790 aa  535  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.692226  decreased coverage  0.000000907679 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3270  penicillin-binding protein 1B  39.7 
 
 		 766 aa  532  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3685  penicillin-binding protein 1B  38.66 
 
 		 774 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0624  penicillin-binding protein 1B  39.04 
 
 		 764 aa  532  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3406  penicillin-binding protein 1B  38.9 
 
 		 764 aa  531  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0623  penicillin-binding protein 1B  38.9 
 
 		 764 aa  531  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494369 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0489  penicillin-binding protein 1B  38.11 
 
 		 781 aa  527  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.290067  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002568  multimodular transpeptidase-transglycosylase  41.03 
 
 		 790 aa  527  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0656  penicillin-binding protein 1B  39.05 
 
 		 779 aa  523  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03443  hypothetical protein  41.39 
 
 		 796 aa  523  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2602  penicillin-binding protein transpeptidase  40.71 
 
 		 791 aa  516  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.809187  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3123  penicillin-binding protein 1B  38.48 
 
 		 789 aa  511  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000774308 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1036  penicillin-binding protein 1b  39.78 
 
 		 833 aa  508  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.970019  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3110  penicillin-binding protein 1b  39.53 
 
 		 826 aa  502  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0131  penicillin-binding protein 1B  39.82 
 
 		 777 aa  505  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00472  penicillin-binding protein 1B  36.22 
 
 		 742 aa  503  1e-141  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1168  penicillin-binding protein 1b  39.53 
 
 		 826 aa  503  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2815  penicillin-binding protein 1b  40.05 
 
 		 827 aa  504  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.692041  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2971  peptidoglycan glycosyltransferase  38.47 
 
 		 779 aa  505  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1239  peptidoglycan glycosyltransferase  38.17 
 
 		 766 aa  499  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.191968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3981  penicillin-binding protein 1b  40.22 
 
 		 836 aa  502  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.289458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3334  penicillin-binding protein 1b  39.51 
 
 		 826 aa  499  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3463  penicillin-binding protein 1b  39.7 
 
 		 826 aa  499  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.995661  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1000  penicillin-binding protein 1b  39.7 
 
 		 824 aa  498  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0222  penicillin-binding protein 1b  38.72 
 
 		 840 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0206  penicillin-binding protein 1b  38.58 
 
 		 840 aa  487  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0225  penicillin-binding protein 1b  38.72 
 
 		 840 aa  489  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0218  penicillin-binding protein 1b  38.72 
 
 		 840 aa  489  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0207  penicillin-binding protein 1b  38.72 
 
 		 840 aa  489  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4301  penicillin-binding protein  36.39 
 
 		 769 aa  483  1e-135  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00148  penicillin-binding protein 1b  38.89 
 
 		 841 aa  479  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0140  penicillin-binding protein 1b  39.32 
 
 		 840 aa  481  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3510  penicillin-binding protein 1b  38.75 
 
 		 844 aa  480  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.933967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00147  hypothetical protein  38.89 
 
 		 841 aa  479  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3453  penicillin-binding protein 1B  39.03 
 
 		 844 aa  478  1e-133  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.9649  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0153  penicillin-binding protein 1b  39.17 
 
 		 844 aa  478  1e-133  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.267501  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0158  penicillin-binding protein 1b  39.17 
 
 		 844 aa  479  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0152  penicillin-binding protein 1b  39.17 
 
 		 844 aa  478  1e-133  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.94433  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0160  penicillin-binding protein 1b  39.17 
 
 		 844 aa  477  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0825  penicillin-binding protein 1B  37.55 
 
 		 754 aa  478  1e-133  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.524532  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0596  penicillin-binding protein 1B  39.79 
 
 		 730 aa  478  1e-133  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0689  penicillin-binding protein 1b  37.23 
 
 		 841 aa  476  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3095  penicillin-binding protein 1B  37.76 
 
 		 813 aa  468  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.911918 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1965  peptidoglycan glycosyltransferase  38.95 
 
 		 792 aa  468  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1899  penicillin-binding protein 1B  38.79 
 
 		 792 aa  466  1e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01595  penicillin-binding protein 1B  37.89 
 
 		 814 aa  462  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0290  1A family penicillin-binding protein  35.51 
 
 		 757 aa  451  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0908  1A family penicillin-binding protein  35.62 
 
 		 766 aa  394  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1065  penicillin-binding protein 1A  32.2 
 
 		 890 aa  369  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.375339  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  38.83 
 
 		 656 aa  325  3e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  36.91 
 
 		 701 aa  324  5e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  37.18 
 
 		 679 aa  323  9.000000000000001e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  37.54 
 
 		 693 aa  322  3e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  36.92 
 
 		 704 aa  321  3.9999999999999996e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  35.55 
 
 		 662 aa  319  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4779  1A family penicillin-binding protein  37.72 
 
 		 705 aa  318  3e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.819685 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4831  1A family penicillin-binding protein  37.81 
 
 		 709 aa  317  6e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5424  penicillin-binding protein 1A  37.81 
 
 		 709 aa  317  6e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5438  1A family penicillin-binding protein  37.81 
 
 		 709 aa  317  6e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  36.55 
 
 		 643 aa  313  6.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  35.68 
 
 		 744 aa  313  7.999999999999999e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  37.06 
 
 		 707 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3992  bifunctional peptidoglycan glycosyl transferase/transpeptidase  36.22 
 
 		 687 aa  311  2.9999999999999997e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155009  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  36.98 
 
 		 654 aa  311  4e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5322  1A family penicillin-binding protein  37.19 
 
 		 714 aa  310  8e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  35.66 
 
 		 751 aa  310  1.0000000000000001e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3332  1A family penicillin-binding protein  37.17 
 
 		 714 aa  308  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741858  hitchhiker  0.0086967 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  36.93 
 
 		 718 aa  307  5.0000000000000004e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  36.29 
 
 		 667 aa  306  9.000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  36.73 
 
 		 640 aa  305  2.0000000000000002e-81  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>