More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01595 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1899  penicillin-binding protein 1B  73.8 
 
 		 792 aa  1195    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01595  penicillin-binding protein 1B  100 
 
 		 814 aa  1650    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3095  penicillin-binding protein 1B  77.84 
 
 		 813 aa  1234    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.911918 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1965  peptidoglycan glycosyltransferase  74.36 
 
 		 792 aa  1181    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0679  penicillin-binding protein 1B  42.7 
 
 		 772 aa  553  1e-156  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.963541  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4683  penicillin-binding protein 1B  40.51 
 
 		 773 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000305505 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5415  penicillin-binding protein 1B  41.71 
 
 		 775 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1407  penicillin-binding protein 1B  43.78 
 
 		 748 aa  543  1e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0297434  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4547  penicillin-binding protein 1B  40.51 
 
 		 773 aa  542  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.428177  hitchhiker  0.00000222687 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4681  penicillin-binding protein 1B  40.11 
 
 		 773 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  hitchhiker  0.00000000000605496 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62200  penicillin-binding protein 1B  41.31 
 
 		 774 aa  537  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.379753 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4792  penicillin-binding protein 1B  39.84 
 
 		 774 aa  535  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000464587  hitchhiker  0.000389854 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0751  penicillin-binding protein 1B  40.08 
 
 		 773 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.288465  hitchhiker  0.0000000000686308 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1002  penicillin-binding protein 1B  40.29 
 
 		 772 aa  529  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000067337 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42560  penicillin-binding protein 1B  40.88 
 
 		 780 aa  525  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1154  penicillin-binding protein 1B  41.43 
 
 		 776 aa  520  1e-146  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0977  penicillin-binding protein  39.39 
 
 		 773 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0441683  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0842  peptidoglycan glycosyltransferase  39.26 
 
 		 773 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122469 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2557  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1B  40.89 
 
 		 778 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000207966  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1297  penicillin-binding protein 1B  41.54 
 
 		 780 aa  510  1e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1672  penicillin-binding protein, putative  39.12 
 
 		 759 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0825  Mutator MutT  38.35 
 
 		 777 aa  503  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00304949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1468  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  38.32 
 
 		 827 aa  492  1e-137  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.614381  unclonable  0.0000024056 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1646  penicillin-binding protein 1B  38.72 
 
 		 827 aa  491  1e-137  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.201466  hitchhiker  0.00102238 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0650  penicillin-binding protein 1B  37.91 
 
 		 830 aa  483  1e-135  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2163  penicillin-binding protein 1B  40.08 
 
 		 732 aa  478  1e-133  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3164  penicillin-binding protein 1B  36.58 
 
 		 768 aa  474  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1620  penicillin-binding protein 1B  37.47 
 
 		 881 aa  462  1e-129  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000878907  unclonable  0.000000000879141 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0489  penicillin-binding protein 1B  35.73 
 
 		 781 aa  465  1e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.290067  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3270  penicillin-binding protein 1B  35.12 
 
 		 766 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00472  penicillin-binding protein 1B  35.01 
 
 		 742 aa  457  1e-127  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0623  penicillin-binding protein 1B  36.49 
 
 		 764 aa  456  1e-127  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494369 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0624  penicillin-binding protein 1B  36.33 
 
 		 764 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3406  penicillin-binding protein 1B  36.45 
 
 		 764 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0656  penicillin-binding protein 1B  36.07 
 
 		 779 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0633  penicillin-binding protein 1B  36.45 
 
 		 768 aa  452  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0583  penicillin-binding protein 1B  36.04 
 
 		 774 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2602  penicillin-binding protein transpeptidase  35.85 
 
 		 791 aa  449  1.0000000000000001e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.809187  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3123  penicillin-binding protein 1B  36.31 
 
 		 789 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000774308 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3868  penicillin-binding protein 1B  36.1 
 
 		 774 aa  445  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3742  penicillin-binding protein 1B  36.1 
 
 		 791 aa  446  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3685  penicillin-binding protein 1B  37.3 
 
 		 774 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03443  hypothetical protein  35.41 
 
 		 796 aa  440  9.999999999999999e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002568  multimodular transpeptidase-transglycosylase  36.83 
 
 		 790 aa  442  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0705  penicillin-binding protein 1B  34.99 
 
 		 790 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.559633  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3894  peptidoglycan glycosyltransferase  35.9 
 
 		 787 aa  437  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0131  penicillin-binding protein 1B  37.73 
 
 		 777 aa  437  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2971  peptidoglycan glycosyltransferase  36.38 
 
 		 779 aa  432  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3463  penicillin-binding protein 1b  36.74 
 
 		 826 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.995661  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3334  penicillin-binding protein 1b  36.52 
 
 		 826 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0825  penicillin-binding protein 1B  32.5 
 
 		 754 aa  428  1e-118  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.524532  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4301  penicillin-binding protein  34.96 
 
 		 769 aa  425  1e-117  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3792  penicillin-binding protein 1B  35.22 
 
 		 790 aa  424  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.692226  decreased coverage  0.000000907679 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1000  penicillin-binding protein 1b  36.6 
 
 		 824 aa  426  1e-117  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3110  penicillin-binding protein 1b  36.29 
 
 		 826 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2815  penicillin-binding protein 1b  36.25 
 
 		 827 aa  419  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.692041  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1168  penicillin-binding protein 1b  35.89 
 
 		 826 aa  415  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1036  penicillin-binding protein 1b  35.59 
 
 		 833 aa  415  1e-114  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.970019  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0218  penicillin-binding protein 1b  36.04 
 
 		 840 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0222  penicillin-binding protein 1b  36.04 
 
 		 840 aa  408  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0207  penicillin-binding protein 1b  36.04 
 
 		 840 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0225  penicillin-binding protein 1b  36.04 
 
 		 840 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1239  peptidoglycan glycosyltransferase  36.15 
 
 		 766 aa  404  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.191968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0206  penicillin-binding protein 1b  35.9 
 
 		 840 aa  405  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00148  penicillin-binding protein 1b  36.29 
 
 		 841 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3510  penicillin-binding protein 1b  36.29 
 
 		 844 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.933967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00147  hypothetical protein  36.29 
 
 		 841 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0140  penicillin-binding protein 1b  36.43 
 
 		 840 aa  397  1e-109  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0689  penicillin-binding protein 1b  35.56 
 
 		 841 aa  396  1e-109  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3981  penicillin-binding protein 1b  37.17 
 
 		 836 aa  397  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.289458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0160  penicillin-binding protein 1b  36.29 
 
 		 844 aa  396  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3453  penicillin-binding protein 1B  36.29 
 
 		 844 aa  396  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.9649  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0153  penicillin-binding protein 1b  36.29 
 
 		 844 aa  396  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.267501  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0152  penicillin-binding protein 1b  36.29 
 
 		 844 aa  396  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.94433  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0158  penicillin-binding protein 1b  36.29 
 
 		 844 aa  395  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0596  penicillin-binding protein 1B  35.09 
 
 		 730 aa  395  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0290  1A family penicillin-binding protein  35.05 
 
 		 757 aa  384  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0908  1A family penicillin-binding protein  32.42 
 
 		 766 aa  343  8e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1065  penicillin-binding protein 1A  31.52 
 
 		 890 aa  313  5.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.375339  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5322  1A family penicillin-binding protein  36.66 
 
 		 714 aa  266  8e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  30.58 
 
 		 642 aa  265  2e-69  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4779  1A family penicillin-binding protein  36.12 
 
 		 705 aa  264  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.819685 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4831  1A family penicillin-binding protein  35.88 
 
 		 709 aa  263  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  35.34 
 
 		 707 aa  263  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5424  penicillin-binding protein 1A  35.88 
 
 		 709 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5438  1A family penicillin-binding protein  35.88 
 
 		 709 aa  262  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  33.39 
 
 		 755 aa  261  5.0000000000000005e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  33.27 
 
 		 727 aa  258  3e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  31.35 
 
 		 642 aa  258  4e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  33.21 
 
 		 648 aa  257  5e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  33.51 
 
 		 727 aa  256  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  33.71 
 
 		 626 aa  256  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  34.59 
 
 		 709 aa  255  3e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  34.78 
 
 		 646 aa  254  5.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  32.91 
 
 		 720 aa  254  6e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  35.23 
 
 		 734 aa  252  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  32.62 
 
 		 761 aa  251  3e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  33.76 
 
 		 713 aa  251  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0432  1A family penicillin-binding protein  33.76 
 
 		 713 aa  251  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0339  1A family penicillin-binding protein  33.76 
 
 		 713 aa  251  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>