More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002568 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00148  penicillin-binding protein 1b  48.74 
 
 		 841 aa  694    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3453  penicillin-binding protein 1B  48.61 
 
 		 844 aa  691    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.9649  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0225  penicillin-binding protein 1b  49.66 
 
 		 840 aa  715    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0705  penicillin-binding protein 1B  43.99 
 
 		 790 aa  671    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.559633  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3981  penicillin-binding protein 1b  51.49 
 
 		 836 aa  752    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.289458  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0633  penicillin-binding protein 1B  44.23 
 
 		 768 aa  657    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3742  penicillin-binding protein 1B  45.36 
 
 		 791 aa  667    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0160  penicillin-binding protein 1b  48.74 
 
 		 844 aa  693    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0152  penicillin-binding protein 1b  48.61 
 
 		 844 aa  691    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.94433  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2602  penicillin-binding protein transpeptidase  66.27 
 
 		 791 aa  1059    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.809187  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00472  penicillin-binding protein 1B  44.4 
 
 		 742 aa  642    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00147  hypothetical protein  48.74 
 
 		 841 aa  694    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0153  penicillin-binding protein 1b  48.61 
 
 		 844 aa  691    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.267501  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3510  penicillin-binding protein 1b  48.74 
 
 		 844 aa  695    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.933967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002568  multimodular transpeptidase-transglycosylase  100 
 
 		 790 aa  1619    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3894  peptidoglycan glycosyltransferase  44.91 
 
 		 787 aa  675    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3792  penicillin-binding protein 1B  44.95 
 
 		 790 aa  665    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.692226  decreased coverage  0.000000907679 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0689  penicillin-binding protein 1b  49.04 
 
 		 841 aa  704    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2815  penicillin-binding protein 1b  51.9 
 
 		 827 aa  762    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.692041  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0206  penicillin-binding protein 1b  49.52 
 
 		 840 aa  713    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3334  penicillin-binding protein 1b  51.27 
 
 		 826 aa  755    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0158  penicillin-binding protein 1b  48.74 
 
 		 844 aa  693    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0222  penicillin-binding protein 1b  49.52 
 
 		 840 aa  713    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1036  penicillin-binding protein 1b  51.66 
 
 		 833 aa  766    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.970019  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3463  penicillin-binding protein 1b  51.4 
 
 		 826 aa  756    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.995661  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3123  penicillin-binding protein 1B  42.86 
 
 		 789 aa  649    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000774308 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03443  hypothetical protein  89.21 
 
 		 796 aa  1468    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3164  penicillin-binding protein 1B  45.39 
 
 		 768 aa  672    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0131  penicillin-binding protein 1B  74.8 
 
 		 777 aa  1202    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3685  penicillin-binding protein 1B  45.09 
 
 		 774 aa  663    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0825  penicillin-binding protein 1B  44.38 
 
 		 754 aa  653    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.524532  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0583  penicillin-binding protein 1B  45.36 
 
 		 774 aa  665    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1168  penicillin-binding protein 1b  49.81 
 
 		 826 aa  752    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0140  penicillin-binding protein 1b  48.74 
 
 		 840 aa  694    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0624  penicillin-binding protein 1B  44.83 
 
 		 764 aa  649    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3406  penicillin-binding protein 1B  44.56 
 
 		 764 aa  646    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3270  penicillin-binding protein 1B  45.32 
 
 		 766 aa  686    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0207  penicillin-binding protein 1b  49.66 
 
 		 840 aa  715    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1000  penicillin-binding protein 1b  51.33 
 
 		 824 aa  755    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3110  penicillin-binding protein 1b  51.28 
 
 		 826 aa  753    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3868  penicillin-binding protein 1B  45.09 
 
 		 774 aa  662    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0623  penicillin-binding protein 1B  44.64 
 
 		 764 aa  644    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494369 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0218  penicillin-binding protein 1b  49.66 
 
 		 840 aa  715    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0656  penicillin-binding protein 1B  44.68 
 
 		 779 aa  660    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2971  peptidoglycan glycosyltransferase  43.88 
 
 		 779 aa  664    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0596  penicillin-binding protein 1B  45.59 
 
 		 730 aa  612  9.999999999999999e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0489  penicillin-binding protein 1B  42.23 
 
 		 781 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.290067  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1002  penicillin-binding protein 1B  44.19 
 
 		 772 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000067337 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4301  penicillin-binding protein  40.93 
 
 		 769 aa  599  1e-170  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4683  penicillin-binding protein 1B  40.62 
 
 		 773 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000305505 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4681  penicillin-binding protein 1B  40.76 
 
 		 773 aa  594  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  hitchhiker  0.00000000000605496 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0751  penicillin-binding protein 1B  41.25 
 
 		 773 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.288465  hitchhiker  0.0000000000686308 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4547  penicillin-binding protein 1B  40.62 
 
 		 773 aa  592  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.428177  hitchhiker  0.00000222687 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62200  penicillin-binding protein 1B  42.78 
 
 		 774 aa  586  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.379753 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4792  penicillin-binding protein 1B  42.18 
 
 		 774 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000464587  hitchhiker  0.000389854 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1297  penicillin-binding protein 1B  43.22 
 
 		 780 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42560  penicillin-binding protein 1B  43.01 
 
 		 780 aa  584  1.0000000000000001e-165  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5415  penicillin-binding protein 1B  43.53 
 
 		 775 aa  582  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0977  penicillin-binding protein  41.91 
 
 		 773 aa  570  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0441683  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0842  peptidoglycan glycosyltransferase  41.78 
 
 		 773 aa  567  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122469 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0679  penicillin-binding protein 1B  43.72 
 
 		 772 aa  563  1.0000000000000001e-159  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.963541  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0650  penicillin-binding protein 1B  42.56 
 
 		 830 aa  563  1.0000000000000001e-159  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0825  Mutator MutT  41.18 
 
 		 777 aa  551  1e-155  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00304949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1154  penicillin-binding protein 1B  44.08 
 
 		 776 aa  541  9.999999999999999e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1672  penicillin-binding protein, putative  41.89 
 
 		 759 aa  538  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2557  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1B  39.52 
 
 		 778 aa  538  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000207966  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1407  penicillin-binding protein 1B  43.52 
 
 		 748 aa  529  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0297434  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1620  penicillin-binding protein 1B  41.37 
 
 		 881 aa  528  1e-148  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000878907  unclonable  0.000000000879141 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2163  penicillin-binding protein 1B  40.95 
 
 		 732 aa  516  1.0000000000000001e-145  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1468  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  39.36 
 
 		 827 aa  515  1e-144  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.614381  unclonable  0.0000024056 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1646  penicillin-binding protein 1B  39.36 
 
 		 827 aa  515  1e-144  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.201466  hitchhiker  0.00102238 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1239  peptidoglycan glycosyltransferase  38.4 
 
 		 766 aa  472  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.191968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3095  penicillin-binding protein 1B  36.91 
 
 		 813 aa  453  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.911918 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01595  penicillin-binding protein 1B  37 
 
 		 814 aa  439  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1899  penicillin-binding protein 1B  34.76 
 
 		 792 aa  428  1e-118  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1965  peptidoglycan glycosyltransferase  34.6 
 
 		 792 aa  424  1e-117  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0290  1A family penicillin-binding protein  35.36 
 
 		 757 aa  400  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0908  1A family penicillin-binding protein  31.99 
 
 		 766 aa  350  4e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1065  penicillin-binding protein 1A  30.98 
 
 		 890 aa  344  2.9999999999999997e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.375339  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  35.62 
 
 		 618 aa  311  4e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  34.81 
 
 		 751 aa  308  3e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  36.4 
 
 		 770 aa  308  4.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  38.75 
 
 		 739 aa  306  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  35.27 
 
 		 679 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  38.37 
 
 		 734 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  37.89 
 
 		 720 aa  303  7.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  37.43 
 
 		 735 aa  303  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3992  bifunctional peptidoglycan glycosyl transferase/transpeptidase  34.7 
 
 		 687 aa  302  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155009  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  36.38 
 
 		 730 aa  301  3e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  37.14 
 
 		 734 aa  301  4e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  36.21 
 
 		 763 aa  300  5e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  33.63 
 
 		 776 aa  299  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  32.25 
 
 		 806 aa  299  2e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  37.97 
 
 		 732 aa  298  2e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  36.43 
 
 		 625 aa  293  1e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  34.66 
 
 		 643 aa  292  2e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  33.76 
 
 		 640 aa  291  3e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  37.48 
 
 		 651 aa  290  6e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  34.47 
 
 		 640 aa  290  6e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  36.17 
 
 		 691 aa  290  9e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>