More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3742 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_0583  penicillin-binding protein 1B  99.61 
 
 		 774 aa  1590    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002568  multimodular transpeptidase-transglycosylase  45.54 
 
 		 790 aa  676    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3742  penicillin-binding protein 1B  100 
 
 		 791 aa  1630    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0705  penicillin-binding protein 1B  74.97 
 
 		 790 aa  1217    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.559633  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0633  penicillin-binding protein 1B  88.8 
 
 		 768 aa  1425    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3123  penicillin-binding protein 1B  77.54 
 
 		 789 aa  1232    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000774308 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2602  penicillin-binding protein transpeptidase  48.29 
 
 		 791 aa  682    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.809187  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0131  penicillin-binding protein 1B  46.79 
 
 		 777 aa  677    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0656  penicillin-binding protein 1B  88.45 
 
 		 779 aa  1427    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00472  penicillin-binding protein 1B  46.44 
 
 		 742 aa  659    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03443  hypothetical protein  45.66 
 
 		 796 aa  673    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2971  peptidoglycan glycosyltransferase  68.55 
 
 		 779 aa  1105    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3685  penicillin-binding protein 1B  99.35 
 
 		 774 aa  1588    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3164  penicillin-binding protein 1B  77.63 
 
 		 768 aa  1235    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3868  penicillin-binding protein 1B  99.74 
 
 		 774 aa  1592    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0489  penicillin-binding protein 1B  44.77 
 
 		 781 aa  662    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.290067  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3894  peptidoglycan glycosyltransferase  75.8 
 
 		 787 aa  1210    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0624  penicillin-binding protein 1B  89.73 
 
 		 764 aa  1416    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3406  penicillin-binding protein 1B  89.6 
 
 		 764 aa  1411    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3270  penicillin-binding protein 1B  77.28 
 
 		 766 aa  1256    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3792  penicillin-binding protein 1B  76.38 
 
 		 790 aa  1210    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.692226  decreased coverage  0.000000907679 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0623  penicillin-binding protein 1B  89.73 
 
 		 764 aa  1411    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.494369 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4301  penicillin-binding protein  41.93 
 
 		 769 aa  625  1e-177  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1002  penicillin-binding protein 1B  42.76 
 
 		 772 aa  615  1e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000067337 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4792  penicillin-binding protein 1B  42.82 
 
 		 774 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000464587  hitchhiker  0.000389854 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4547  penicillin-binding protein 1B  41.32 
 
 		 773 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.428177  hitchhiker  0.00000222687 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4681  penicillin-binding protein 1B  41.05 
 
 		 773 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  hitchhiker  0.00000000000605496 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62200  penicillin-binding protein 1B  43.15 
 
 		 774 aa  595  1e-169  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.379753 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4683  penicillin-binding protein 1B  41.18 
 
 		 773 aa  595  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000305505 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42560  penicillin-binding protein 1B  42.26 
 
 		 780 aa  594  1e-168  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5415  penicillin-binding protein 1B  43.15 
 
 		 775 aa  592  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0977  penicillin-binding protein  41.9 
 
 		 773 aa  590  1e-167  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0441683  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2815  penicillin-binding protein 1b  44.74 
 
 		 827 aa  590  1e-167  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.692041  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3981  penicillin-binding protein 1b  43.32 
 
 		 836 aa  591  1e-167  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.289458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3110  penicillin-binding protein 1b  44.3 
 
 		 826 aa  590  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0842  peptidoglycan glycosyltransferase  41.9 
 
 		 773 aa  590  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000122469 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1000  penicillin-binding protein 1b  42.42 
 
 		 824 aa  588  1e-166  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3463  penicillin-binding protein 1b  43.5 
 
 		 826 aa  587  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.995661  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3334  penicillin-binding protein 1b  43.5 
 
 		 826 aa  587  1e-166  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1168  penicillin-binding protein 1b  43.87 
 
 		 826 aa  586  1e-166  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0751  penicillin-binding protein 1B  40.13 
 
 		 773 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.288465  hitchhiker  0.0000000000686308 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1036  penicillin-binding protein 1b  44.52 
 
 		 833 aa  582  1e-164  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.970019  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0679  penicillin-binding protein 1B  40.95 
 
 		 772 aa  576  1.0000000000000001e-163  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.963541  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0222  penicillin-binding protein 1b  44.13 
 
 		 840 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0225  penicillin-binding protein 1b  44.13 
 
 		 840 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0689  penicillin-binding protein 1b  43.64 
 
 		 841 aa  578  1.0000000000000001e-163  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0218  penicillin-binding protein 1b  44.13 
 
 		 840 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0207  penicillin-binding protein 1b  44.13 
 
 		 840 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0206  penicillin-binding protein 1b  43.98 
 
 		 840 aa  575  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2557  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1B  41.41 
 
 		 778 aa  569  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000207966  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0596  penicillin-binding protein 1B  42.44 
 
 		 730 aa  567  1e-160  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00148  penicillin-binding protein 1b  43.45 
 
 		 841 aa  565  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3453  penicillin-binding protein 1B  43.45 
 
 		 844 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.9649  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0153  penicillin-binding protein 1b  43.45 
 
 		 844 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.267501  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0158  penicillin-binding protein 1b  43.45 
 
 		 844 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0160  penicillin-binding protein 1b  43.45 
 
 		 844 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00147  hypothetical protein  43.45 
 
 		 841 aa  565  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3510  penicillin-binding protein 1b  43.45 
 
 		 844 aa  565  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.933967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0152  penicillin-binding protein 1b  43.45 
 
 		 844 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.94433  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0140  penicillin-binding protein 1b  43.45 
 
 		 840 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0650  penicillin-binding protein 1B  41.74 
 
 		 830 aa  558  1e-157  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1154  penicillin-binding protein 1B  41.26 
 
 		 776 aa  556  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0825  Mutator MutT  39.55 
 
 		 777 aa  554  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00304949  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1672  penicillin-binding protein, putative  41.26 
 
 		 759 aa  544  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1297  penicillin-binding protein 1B  38.69 
 
 		 780 aa  540  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1407  penicillin-binding protein 1B  42.33 
 
 		 748 aa  536  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0297434  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1620  penicillin-binding protein 1B  39.02 
 
 		 881 aa  534  1e-150  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000878907  unclonable  0.000000000879141 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0825  penicillin-binding protein 1B  39.91 
 
 		 754 aa  534  1e-150  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.524532  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1468  penicillin-binding protein transpeptidase domain-containing protein  38.78 
 
 		 827 aa  529  1e-149  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.614381  unclonable  0.0000024056 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1646  penicillin-binding protein 1B  39.22 
 
 		 827 aa  528  1e-148  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.201466  hitchhiker  0.00102238 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2163  penicillin-binding protein 1B  38.55 
 
 		 732 aa  497  1e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3095  penicillin-binding protein 1B  37.41 
 
 		 813 aa  454  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.911918 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01595  penicillin-binding protein 1B  36.36 
 
 		 814 aa  446  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1239  peptidoglycan glycosyltransferase  35.03 
 
 		 766 aa  442  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.191968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1899  penicillin-binding protein 1B  36.23 
 
 		 792 aa  441  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1965  peptidoglycan glycosyltransferase  37.21 
 
 		 792 aa  435  1e-120  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0290  1A family penicillin-binding protein  35.11 
 
 		 757 aa  414  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0908  1A family penicillin-binding protein  33.19 
 
 		 766 aa  377  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1065  penicillin-binding protein 1A  31.6 
 
 		 890 aa  342  2e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.375339  normal  0.670591 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  34.13 
 
 		 649 aa  298  4e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  34.9 
 
 		 625 aa  295  2e-78  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  33.27 
 
 		 643 aa  292  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  33.27 
 
 		 643 aa  292  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  32.38 
 
 		 806 aa  292  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  34.43 
 
 		 643 aa  290  8e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  34.38 
 
 		 654 aa  287  5e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  34.28 
 
 		 640 aa  286  7e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  33.39 
 
 		 638 aa  283  6.000000000000001e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  33.33 
 
 		 656 aa  282  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  33.46 
 
 		 618 aa  281  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  32.51 
 
 		 642 aa  281  4e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  36.14 
 
 		 734 aa  280  9e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  33.72 
 
 		 640 aa  278  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  35.33 
 
 		 714 aa  279  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  34.59 
 
 		 811 aa  278  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  33.83 
 
 		 648 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  33.67 
 
 		 646 aa  276  1.0000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  35.71 
 
 		 714 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  32.22 
 
 		 642 aa  276  1.0000000000000001e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  34.93 
 
 		 712 aa  275  2.0000000000000002e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>