More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1108 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1108  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 678 aa  1327    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  50.71 
 
 		 761 aa  555  1e-156  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5899  glycosyl transferase family 51  41.51 
 
 		 726 aa  362  2e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1310  penicillin-binding protein 1A  39.31 
 
 		 704 aa  350  4e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.028236  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3542  penicillin-binding protein, 1A family  34.67 
 
 		 817 aa  348  1e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  37.82 
 
 		 710 aa  345  2e-93  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  33.81 
 
 		 683 aa  340  4e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  37.01 
 
 		 640 aa  340  8e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  34.37 
 
 		 806 aa  339  9e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  37.52 
 
 		 640 aa  339  9.999999999999999e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3392  glycosyl transferase family 51  40.61 
 
 		 662 aa  338  9.999999999999999e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.305722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  37.92 
 
 		 776 aa  336  7.999999999999999e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  37.54 
 
 		 618 aa  330  4e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  34.8 
 
 		 683 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  34.63 
 
 		 683 aa  326  7e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  34.69 
 
 		 683 aa  326  8.000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  34.69 
 
 		 683 aa  326  1e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  37.48 
 
 		 741 aa  326  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  34.63 
 
 		 683 aa  325  2e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  33.85 
 
 		 683 aa  325  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  34.52 
 
 		 683 aa  324  3e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  36.55 
 
 		 905 aa  324  4e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  38.12 
 
 		 732 aa  323  6e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  37.05 
 
 		 739 aa  323  6e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  34.86 
 
 		 683 aa  323  7e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  34.52 
 
 		 683 aa  323  8e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  34.52 
 
 		 683 aa  323  8e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  34.86 
 
 		 683 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  35.52 
 
 		 643 aa  322  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  35.65 
 
 		 643 aa  320  7.999999999999999e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  35.65 
 
 		 643 aa  320  7.999999999999999e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  34.95 
 
 		 625 aa  319  1e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  36.74 
 
 		 735 aa  319  1e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  38.2 
 
 		 761 aa  315  9.999999999999999e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  34.53 
 
 		 681 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  36.9 
 
 		 720 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  36.39 
 
 		 734 aa  313  5.999999999999999e-84  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  37.14 
 
 		 755 aa  312  1e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  39.01 
 
 		 728 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  36.16 
 
 		 734 aa  310  5e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  34.52 
 
 		 654 aa  310  6.999999999999999e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  34.7 
 
 		 649 aa  309  1.0000000000000001e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  34.87 
 
 		 770 aa  307  5.0000000000000004e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  36.44 
 
 		 757 aa  306  6e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  35.05 
 
 		 626 aa  306  9.000000000000001e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  34.15 
 
 		 811 aa  306  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  38.91 
 
 		 714 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  35.19 
 
 		 727 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  35.34 
 
 		 710 aa  303  6.000000000000001e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  35.43 
 
 		 648 aa  303  8.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  33.33 
 
 		 648 aa  302  1e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  38.22 
 
 		 714 aa  302  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  34.62 
 
 		 723 aa  301  2e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  36.39 
 
 		 765 aa  301  3e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  37.48 
 
 		 712 aa  301  4e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  36.09 
 
 		 646 aa  301  4e-80  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  37.7 
 
 		 727 aa  300  5e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  36.81 
 
 		 695 aa  300  7e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  34.27 
 
 		 661 aa  300  8e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  40 
 
 		 775 aa  299  1e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  37.7 
 
 		 727 aa  299  1e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  34.48 
 
 		 824 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  39.47 
 
 		 709 aa  298  2e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  34.48 
 
 		 824 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  37.5 
 
 		 730 aa  297  3e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  37.5 
 
 		 763 aa  297  5e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  37.09 
 
 		 728 aa  295  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  34.63 
 
 		 776 aa  293  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  34.79 
 
 		 779 aa  293  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  33.98 
 
 		 722 aa  289  1e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  37.68 
 
 		 712 aa  286  5.999999999999999e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  33.61 
 
 		 708 aa  286  8e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  34.38 
 
 		 833 aa  285  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.16 
 
 		 764 aa  284  3.0000000000000004e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  34.73 
 
 		 712 aa  284  4.0000000000000003e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1616  penicillin-binding protein  34.65 
 
 		 680 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  34.85 
 
 		 662 aa  283  5.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1578  penicillin-binding protein  34.47 
 
 		 680 aa  283  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1547  penicillin-binding protein  34.29 
 
 		 667 aa  283  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000544476 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  33.11 
 
 		 680 aa  283  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1336  penicillin-binding protein 2A  34.29 
 
 		 680 aa  283  9e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000691863  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1180  1A family penicillin-binding protein  32.83 
 
 		 679 aa  282  1e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000474619  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  34.29 
 
 		 680 aa  282  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4182  glycosyl transferase family 51  36.32 
 
 		 836 aa  282  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  37.75 
 
 		 658 aa  281  2e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1363  penicillin-binding protein  34.29 
 
 		 673 aa  281  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000333103  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1474  penicillin-binding protein  34.29 
 
 		 673 aa  281  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0083684  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  36.72 
 
 		 801 aa  281  4e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  34.65 
 
 		 656 aa  280  4e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  33.56 
 
 		 727 aa  280  5e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  34.24 
 
 		 668 aa  280  6e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  33.33 
 
 		 667 aa  280  6e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  32.65 
 
 		 704 aa  280  8e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  36.16 
 
 		 880 aa  279  1e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  33.93 
 
 		 819 aa  279  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  35.88 
 
 		 723 aa  278  2e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3835  penicillin-binding protein 1F (PBP-1F)  34.29 
 
 		 680 aa  278  3e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288255  hitchhiker  0.000000000138665 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0823  1A family penicillin-binding protein  35.88 
 
 		 705 aa  278  3e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2004  glycosyl transferase family protein  34.33 
 
 		 820 aa  277  6e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  33.23 
 
 		 693 aa  276  7e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>