More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1427 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0615  penicillin-binding protein 1A  97.51 
 
 
643 aa  1288    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  58.28 
 
 
642 aa  771    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  56.54 
 
 
638 aa  750    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1074  penicillin-binding protein 1A  74.22 
 
 
644 aa  998    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0536  penicillin-binding protein 1A  97.51 
 
 
643 aa  1288    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1892  penicillin-binding protein 1A  49.92 
 
 
655 aa  648    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  58.44 
 
 
642 aa  768    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  56.15 
 
 
641 aa  739    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1427  penicillin-binding protein 1A  100 
 
 
643 aa  1321    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1032  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  60.32 
 
 
645 aa  779    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00344643  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  36.43 
 
 
618 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  34.71 
 
 
640 aa  358  9.999999999999999e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  35.17 
 
 
640 aa  353  5e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  35.9 
 
 
643 aa  353  5e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  35.96 
 
 
643 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  33.96 
 
 
646 aa  350  3e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  35.96 
 
 
643 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  34.62 
 
 
806 aa  347  4e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  35.18 
 
 
654 aa  347  4e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  35.41 
 
 
625 aa  346  6e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  35.59 
 
 
751 aa  345  2e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  33.9 
 
 
679 aa  342  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5424  penicillin-binding protein 1A  34.57 
 
 
709 aa  335  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5438  1A family penicillin-binding protein  34.57 
 
 
709 aa  335  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4831  1A family penicillin-binding protein  34.57 
 
 
709 aa  334  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  34.52 
 
 
761 aa  333  8e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  35.9 
 
 
661 aa  332  9e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  35.67 
 
 
648 aa  332  1e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  34.04 
 
 
707 aa  331  3e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0432  1A family penicillin-binding protein  34.22 
 
 
713 aa  329  8e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0339  1A family penicillin-binding protein  34.22 
 
 
713 aa  329  8e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1832  1A family penicillin-binding protein  34.22 
 
 
713 aa  329  8e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.421648  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  34.22 
 
 
713 aa  329  8e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1123  1A family penicillin-binding protein  34.22 
 
 
713 aa  329  8e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438177  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0832  1A family penicillin-binding protein  34.22 
 
 
713 aa  329  8e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313161  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  34.17 
 
 
693 aa  327  6e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4779  1A family penicillin-binding protein  33.87 
 
 
705 aa  326  7e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.819685 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3332  1A family penicillin-binding protein  34.27 
 
 
714 aa  325  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.741858  hitchhiker  0.0086967 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  33.22 
 
 
776 aa  325  2e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  34.57 
 
 
712 aa  324  3e-87  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5322  1A family penicillin-binding protein  33.51 
 
 
714 aa  320  5e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2145  1A family penicillin-binding protein  33.92 
 
 
710 aa  320  5e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3992  bifunctional peptidoglycan glycosyl transferase/transpeptidase  33.11 
 
 
687 aa  320  7e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155009  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  33.81 
 
 
755 aa  319  7.999999999999999e-86  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0597  penicillin-binding protein, 1A family  34.35 
 
 
665 aa  318  2e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  33.01 
 
 
649 aa  318  2e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  35.19 
 
 
727 aa  317  4e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  34.21 
 
 
691 aa  317  4e-85  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  34.03 
 
 
824 aa  314  3.9999999999999997e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  33.82 
 
 
676 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  36.33 
 
 
796 aa  313  7.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  34.03 
 
 
824 aa  313  7.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  32.38 
 
 
765 aa  311  2e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  33.11 
 
 
905 aa  311  2.9999999999999997e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  33.16 
 
 
658 aa  310  5.9999999999999995e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  32.89 
 
 
648 aa  309  8e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  35.28 
 
 
779 aa  309  8e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  32.33 
 
 
795 aa  308  1.0000000000000001e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  32.21 
 
 
727 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  35.06 
 
 
714 aa  308  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0908  1A family penicillin-binding protein  33.28 
 
 
766 aa  306  6e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  33.89 
 
 
708 aa  306  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  35.05 
 
 
776 aa  306  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  33.02 
 
 
761 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  34.98 
 
 
728 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  33.49 
 
 
667 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0916  1A family penicillin-binding protein  32.9 
 
 
656 aa  304  3.0000000000000004e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.129187 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  34.38 
 
 
714 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  30.42 
 
 
704 aa  303  5.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  32.55 
 
 
750 aa  303  6.000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  33.56 
 
 
669 aa  303  8.000000000000001e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  35.41 
 
 
727 aa  303  9e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3835  penicillin-binding protein 1F (PBP-1F)  33.22 
 
 
680 aa  303  9e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288255  hitchhiker  0.000000000138665 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  33.39 
 
 
680 aa  302  1e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  32.98 
 
 
626 aa  302  1e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2885  penicillin-binding protein, 1A family  33.17 
 
 
705 aa  301  2e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.060613  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1337  penicillin-binding protein 2A  33.33 
 
 
680 aa  301  2e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  32.46 
 
 
811 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1547  penicillin-binding protein  33.33 
 
 
667 aa  301  2e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000544476 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  35.41 
 
 
727 aa  301  2e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1046  1A family penicillin-binding protein  36.89 
 
 
810 aa  301  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  34.53 
 
 
833 aa  300  4e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  33.76 
 
 
768 aa  300  5e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  35.6 
 
 
712 aa  300  5e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1336  penicillin-binding protein 2A  33.16 
 
 
680 aa  300  5e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000691863  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  33.71 
 
 
720 aa  300  5e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  32.32 
 
 
710 aa  300  5e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0290  1A family penicillin-binding protein  31.46 
 
 
757 aa  300  5e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  32.74 
 
 
829 aa  300  6e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1578  penicillin-binding protein  32.98 
 
 
680 aa  300  8e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00315585  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  33.62 
 
 
741 aa  299  9e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1363  penicillin-binding protein  33.16 
 
 
673 aa  299  1e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000333103  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1616  penicillin-binding protein  32.81 
 
 
680 aa  299  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1474  penicillin-binding protein  33.16 
 
 
673 aa  299  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0083684  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  33.05 
 
 
718 aa  299  1e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  31.94 
 
 
662 aa  298  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  34.62 
 
 
728 aa  298  2e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  33.76 
 
 
683 aa  298  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  33.64 
 
 
683 aa  297  3e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  33.58 
 
 
683 aa  297  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>