More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0362 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  59.41 
 
 
728 aa  763    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  58.82 
 
 
727 aa  758    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  55.77 
 
 
734 aa  760    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  56.79 
 
 
727 aa  758    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  60.64 
 
 
714 aa  764    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  62.11 
 
 
712 aa  754    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  57.92 
 
 
728 aa  745    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  63.49 
 
 
714 aa  772    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  55.29 
 
 
739 aa  759    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  56.39 
 
 
735 aa  771    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  61.44 
 
 
757 aa  738    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  58.81 
 
 
720 aa  756    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  60.21 
 
 
732 aa  768    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  57.28 
 
 
720 aa  716    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  100 
 
 
741 aa  1481    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  56.66 
 
 
734 aa  791    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  50.53 
 
 
770 aa  632  1e-180  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  52.14 
 
 
730 aa  624  1e-177  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  51.97 
 
 
763 aa  624  1e-177  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  52.09 
 
 
723 aa  619  1e-176  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  52.34 
 
 
779 aa  617  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  52.01 
 
 
776 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  49.76 
 
 
750 aa  605  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  48.77 
 
 
833 aa  598  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  48.01 
 
 
775 aa  576  1.0000000000000001e-163  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  49.74 
 
 
651 aa  524  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  45.9 
 
 
654 aa  505  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  43.97 
 
 
712 aa  487  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2073  penicillin-binding protein, 1A family  44.77 
 
 
758 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1787  penicillin-binding protein 1A  43.26 
 
 
757 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.495648  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1953  penicillin-binding protein 1A  44.99 
 
 
750 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3056  putative penicillin-binding protein  43.3 
 
 
759 aa  478  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3506  penicillin-binding protein 1A  45.59 
 
 
769 aa  479  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1403  penicillin-binding protein 1A  45 
 
 
760 aa  476  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  45.06 
 
 
759 aa  475  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0883  1A family penicillin-binding protein  45.09 
 
 
714 aa  472  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  42.16 
 
 
724 aa  471  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  41.99 
 
 
718 aa  469  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  43.97 
 
 
691 aa  470  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  46.14 
 
 
669 aa  469  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0887  glycosyl transferase family protein  42.04 
 
 
831 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656493  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2548  1A family penicillin-binding protein  42.04 
 
 
788 aa  462  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.340929  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2677  1A family penicillin-binding protein  43.45 
 
 
724 aa  462  9.999999999999999e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288371  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  42.86 
 
 
718 aa  455  1.0000000000000001e-126  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1323  penicillin binding protein  42.64 
 
 
707 aa  452  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.295305  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  47.11 
 
 
796 aa  452  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  41.44 
 
 
768 aa  451  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0118  1A family penicillin-binding protein  41.8 
 
 
788 aa  450  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0916  1A family penicillin-binding protein  45.08 
 
 
656 aa  449  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.129187 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2628  penicillin-binding protein 1A  43.04 
 
 
735 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1046  1A family penicillin-binding protein  46.67 
 
 
810 aa  443  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1662  penicillin-binding protein, 1A family  41.35 
 
 
742 aa  446  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.460487 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0626  1A family penicillin-binding protein  44.82 
 
 
733 aa  442  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10684  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0864  penicillin-binding protein, 1A family  41.32 
 
 
760 aa  442  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.930859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0719  penicillin-binding protein, 1A family  45.17 
 
 
830 aa  439  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347949  normal  0.695169 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0767  penicillin-binding protein, 1A family  43.55 
 
 
763 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210188  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0928  1A family penicillin-binding protein  40.79 
 
 
784 aa  438  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0889  penicillin-binding protein, 1A family  40.79 
 
 
765 aa  437  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53881  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0894  penicillin-binding protein, 1A family  44.15 
 
 
728 aa  437  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0706  1A family penicillin-binding protein  45 
 
 
830 aa  439  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.247814 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0878  1A family penicillin-binding protein  41.86 
 
 
764 aa  436  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337969  hitchhiker  0.000893073 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0677  penicillin-binding protein, 1A family  44.39 
 
 
815 aa  433  1e-120  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187464 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3611  1A family penicillin-binding protein  46.39 
 
 
814 aa  433  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.246117  hitchhiker  0.00429634 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1022  penicillin-binding protein, 1A family  43.99 
 
 
736 aa  436  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53642  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  38.91 
 
 
732 aa  431  1e-119  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0203  1A family penicillin-binding protein  43.78 
 
 
658 aa  427  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0142  penicillin-binding protein  42.08 
 
 
729 aa  425  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0720  penicillin-binding protein, 1A family  41.71 
 
 
744 aa  424  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0942081  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3329  penicillin-binding protein 1A  40.26 
 
 
712 aa  421  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6858  penicillin-binding protein, 1A family  43.53 
 
 
626 aa  422  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  40.78 
 
 
776 aa  417  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  41.01 
 
 
824 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  40.85 
 
 
824 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2817  1A family penicillin-binding protein  38.1 
 
 
709 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515125  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1115  1A family penicillin-binding protein  41.53 
 
 
743 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331133  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  39.89 
 
 
811 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  39.3 
 
 
755 aa  401  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2520  penicillin-binding protein 1A  44.07 
 
 
750 aa  399  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2033  1A family penicillin-binding protein  42.28 
 
 
776 aa  397  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.431137  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  37.34 
 
 
648 aa  393  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  40.53 
 
 
712 aa  393  1e-108  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4055  peptidoglycan glycosyltransferase  38.4 
 
 
744 aa  392  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1078  1A family penicillin-binding protein  43.14 
 
 
727 aa  392  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.319269  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1701  1A family penicillin-binding protein  43.29 
 
 
626 aa  389  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41226  normal  0.0892672 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  37.57 
 
 
626 aa  385  1e-105  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  41.55 
 
 
661 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  39.39 
 
 
761 aa  370  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  38.81 
 
 
765 aa  369  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1453  penicillin-binding protein 1A  41.49 
 
 
699 aa  364  3e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.8478  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  40.03 
 
 
618 aa  361  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  38.01 
 
 
654 aa  355  2e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  37.52 
 
 
648 aa  353  7e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  36.48 
 
 
668 aa  353  8.999999999999999e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  38.53 
 
 
751 aa  352  2e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  36.71 
 
 
643 aa  350  6e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  38.81 
 
 
727 aa  349  1e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  38.32 
 
 
646 aa  348  3e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  37 
 
 
680 aa  347  6e-94  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  37.11 
 
 
658 aa  344  4e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1574  penicillin-binding protein 1A  38.92 
 
 
692 aa  343  7e-93  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>