More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4055 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008686  Pden_2033  1A family penicillin-binding protein  57.53 
 
 
776 aa  729    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.431137  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0118  1A family penicillin-binding protein  64.27 
 
 
788 aa  876    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0887  glycosyl transferase family protein  61.58 
 
 
831 aa  880    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656493  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4055  peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 
744 aa  1504    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2628  penicillin-binding protein 1A  59.86 
 
 
735 aa  839    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0142  penicillin-binding protein  66.46 
 
 
729 aa  870    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2548  1A family penicillin-binding protein  62.19 
 
 
788 aa  880    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.340929  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  40.72 
 
 
739 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  39.61 
 
 
735 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  38.02 
 
 
732 aa  421  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  40.18 
 
 
728 aa  422  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  41.63 
 
 
757 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  40.69 
 
 
720 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  38.34 
 
 
734 aa  414  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  40.67 
 
 
714 aa  414  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  40.58 
 
 
734 aa  411  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  39.68 
 
 
741 aa  409  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  39.08 
 
 
775 aa  408  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  40.83 
 
 
727 aa  405  1e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  40.83 
 
 
727 aa  404  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  38.64 
 
 
654 aa  405  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  37.86 
 
 
833 aa  402  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  40.53 
 
 
714 aa  398  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  38.39 
 
 
768 aa  393  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  38.86 
 
 
779 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  39.71 
 
 
728 aa  395  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  38.88 
 
 
776 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0916  1A family penicillin-binding protein  41.28 
 
 
656 aa  390  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.129187 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  40.98 
 
 
651 aa  384  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  37.6 
 
 
720 aa  385  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  37.98 
 
 
770 aa  383  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  37.57 
 
 
750 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  40.12 
 
 
723 aa  381  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  36.38 
 
 
712 aa  373  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  39.55 
 
 
691 aa  374  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  37.42 
 
 
730 aa  370  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  37.42 
 
 
763 aa  370  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  38.47 
 
 
759 aa  372  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3506  penicillin-binding protein 1A  37.99 
 
 
769 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1953  penicillin-binding protein 1A  38.86 
 
 
750 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1403  penicillin-binding protein 1A  39.21 
 
 
760 aa  372  1e-101  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1662  penicillin-binding protein, 1A family  36.8 
 
 
742 aa  367  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.460487 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1787  penicillin-binding protein 1A  38.37 
 
 
757 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.495648  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0767  penicillin-binding protein, 1A family  40.1 
 
 
763 aa  364  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210188  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3056  putative penicillin-binding protein  36.88 
 
 
759 aa  364  3e-99  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0883  1A family penicillin-binding protein  36.55 
 
 
714 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2073  penicillin-binding protein, 1A family  36.99 
 
 
758 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  37.82 
 
 
724 aa  353  8e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2677  1A family penicillin-binding protein  37.24 
 
 
724 aa  353  8e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288371  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  36.61 
 
 
718 aa  352  1e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  39.07 
 
 
669 aa  352  2e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  37.65 
 
 
718 aa  351  4e-95  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0720  penicillin-binding protein, 1A family  36.98 
 
 
744 aa  349  9e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0942081  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0203  1A family penicillin-binding protein  41.36 
 
 
658 aa  347  4e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6858  penicillin-binding protein, 1A family  37.84 
 
 
626 aa  347  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0864  penicillin-binding protein, 1A family  35.93 
 
 
760 aa  342  1e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.930859 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1323  penicillin binding protein  36.85 
 
 
707 aa  342  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.295305  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1115  1A family penicillin-binding protein  37.29 
 
 
743 aa  340  5e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331133  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0878  1A family penicillin-binding protein  35.69 
 
 
764 aa  340  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337969  hitchhiker  0.000893073 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  39.86 
 
 
796 aa  340  8e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1046  1A family penicillin-binding protein  39.38 
 
 
810 aa  339  9.999999999999999e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0889  penicillin-binding protein, 1A family  34.94 
 
 
765 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53881  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0928  1A family penicillin-binding protein  34.94 
 
 
784 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  36.65 
 
 
712 aa  338  2.9999999999999997e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  35.59 
 
 
732 aa  336  1e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  34.66 
 
 
658 aa  328  3e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2520  penicillin-binding protein 1A  39.36 
 
 
750 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2817  1A family penicillin-binding protein  35.47 
 
 
709 aa  327  5e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515125  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0894  penicillin-binding protein, 1A family  37.27 
 
 
728 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0719  penicillin-binding protein, 1A family  38.07 
 
 
830 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347949  normal  0.695169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0706  1A family penicillin-binding protein  37.91 
 
 
830 aa  321  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.247814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  33.97 
 
 
776 aa  320  5e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3611  1A family penicillin-binding protein  37.07 
 
 
814 aa  318  2e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.246117  hitchhiker  0.00429634 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1022  penicillin-binding protein, 1A family  36.67 
 
 
736 aa  317  6e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53642  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0677  penicillin-binding protein, 1A family  37.69 
 
 
815 aa  316  9e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187464 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04231  putative penicillin binding protein  33.67 
 
 
602 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  34.87 
 
 
680 aa  314  3.9999999999999997e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  33.82 
 
 
755 aa  314  3.9999999999999997e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0626  1A family penicillin-binding protein  36.23 
 
 
733 aa  314  4.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10684  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  36.3 
 
 
712 aa  313  5.999999999999999e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  36.43 
 
 
648 aa  313  6.999999999999999e-84  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3329  penicillin-binding protein 1A  33.72 
 
 
712 aa  308  2.0000000000000002e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1453  penicillin-binding protein 1A  35.86 
 
 
699 aa  308  3e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.8478  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1574  penicillin-binding protein 1A  34.58 
 
 
692 aa  306  9.000000000000001e-82  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1701  1A family penicillin-binding protein  38.04 
 
 
626 aa  304  4.0000000000000003e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41226  normal  0.0892672 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  32.35 
 
 
811 aa  301  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  32.56 
 
 
795 aa  298  3e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  34.62 
 
 
765 aa  293  7e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  33.55 
 
 
806 aa  293  8e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  32.55 
 
 
626 aa  291  4e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  33.84 
 
 
751 aa  290  5.0000000000000004e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  33.33 
 
 
648 aa  289  2e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  34.8 
 
 
761 aa  288  2.9999999999999996e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  33.72 
 
 
824 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  33.72 
 
 
824 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  34.96 
 
 
905 aa  283  7.000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  35.58 
 
 
661 aa  280  6e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1078  1A family penicillin-binding protein  33.8 
 
 
727 aa  280  7e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.319269  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  32.14 
 
 
668 aa  278  4e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4792  penicillin-binding protein 1B  34.2 
 
 
774 aa  278  4e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000464587  hitchhiker  0.000389854 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>