More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2520 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2520  penicillin-binding protein 1A  100 
 
 		 750 aa  1478    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  48.51 
 
 		 796 aa  592  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1046  1A family penicillin-binding protein  47.89 
 
 		 810 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3611  1A family penicillin-binding protein  45.42 
 
 		 814 aa  496  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.246117  hitchhiker  0.00429634 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0677  penicillin-binding protein, 1A family  46.05 
 
 		 815 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187464 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0719  penicillin-binding protein, 1A family  43.65 
 
 		 830 aa  479  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347949  normal  0.695169 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0203  1A family penicillin-binding protein  47.07 
 
 		 658 aa  476  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0706  1A family penicillin-binding protein  43.37 
 
 		 830 aa  478  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.247814 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0767  penicillin-binding protein, 1A family  46.42 
 
 		 763 aa  459  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210188  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1078  1A family penicillin-binding protein  45.24 
 
 		 727 aa  455  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.319269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6858  penicillin-binding protein, 1A family  45.93 
 
 		 626 aa  445  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  42.67 
 
 		 728 aa  438  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  44.06 
 
 		 734 aa  437  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  43.53 
 
 		 714 aa  439  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1701  1A family penicillin-binding protein  45.59 
 
 		 626 aa  437  1e-121  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41226  normal  0.0892672 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  43.92 
 
 		 732 aa  438  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  43.35 
 
 		 739 aa  439  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  43.42 
 
 		 727 aa  433  1e-120  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  43.42 
 
 		 727 aa  434  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  43.13 
 
 		 775 aa  435  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  42.74 
 
 		 734 aa  435  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1453  penicillin-binding protein 1A  44.55 
 
 		 699 aa  432  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.8478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  44.09 
 
 		 714 aa  432  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  43.93 
 
 		 728 aa  431  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  43.06 
 
 		 691 aa  429  1e-118  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  43.15 
 
 		 735 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  43.6 
 
 		 720 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  43.87 
 
 		 757 aa  422  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  42.05 
 
 		 720 aa  419  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  46.9 
 
 		 651 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  42.51 
 
 		 776 aa  415  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  42.51 
 
 		 779 aa  416  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  39.4 
 
 		 768 aa  411  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  42.54 
 
 		 723 aa  412  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  42.73 
 
 		 741 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  41.65 
 
 		 770 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  42.42 
 
 		 712 aa  405  1e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  41.81 
 
 		 763 aa  404  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  42.2 
 
 		 833 aa  405  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  41.81 
 
 		 730 aa  403  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  43.22 
 
 		 732 aa  400  9.999999999999999e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1787  penicillin-binding protein 1A  39.27 
 
 		 757 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.495648  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3056  putative penicillin-binding protein  38.3 
 
 		 759 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0720  penicillin-binding protein, 1A family  41.38 
 
 		 744 aa  392  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0942081  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3329  penicillin-binding protein 1A  41.12 
 
 		 712 aa  386  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2817  1A family penicillin-binding protein  40.73 
 
 		 709 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515125  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1953  penicillin-binding protein 1A  40.07 
 
 		 750 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2073  penicillin-binding protein, 1A family  38.91 
 
 		 758 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3506  penicillin-binding protein 1A  40 
 
 		 769 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  41.98 
 
 		 718 aa  384  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  41.14 
 
 		 750 aa  383  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  38.97 
 
 		 759 aa  382  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  38.74 
 
 		 643 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  42.36 
 
 		 712 aa  382  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1403  penicillin-binding protein 1A  39.72 
 
 		 760 aa  382  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  38.74 
 
 		 643 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  39.41 
 
 		 654 aa  379  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  40.84 
 
 		 618 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1662  penicillin-binding protein, 1A family  39.22 
 
 		 742 aa  375  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.460487 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  39.19 
 
 		 724 aa  373  1e-102  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0916  1A family penicillin-binding protein  42.88 
 
 		 656 aa  376  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.129187 
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  39.02 
 
 		 718 aa  371  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2677  1A family penicillin-binding protein  38.03 
 
 		 724 aa  371  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288371  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  41.72 
 
 		 669 aa  371  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0142  penicillin-binding protein  38.67 
 
 		 729 aa  364  3e-99  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0864  penicillin-binding protein, 1A family  37.83 
 
 		 760 aa  360  4e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.930859 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  38.11 
 
 		 643 aa  360  6e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0887  glycosyl transferase family protein  38.92 
 
 		 831 aa  360  7e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656493  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1115  1A family penicillin-binding protein  40.1 
 
 		 743 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331133  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2548  1A family penicillin-binding protein  38.77 
 
 		 788 aa  357  3.9999999999999996e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.340929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  37.89 
 
 		 776 aa  355  1e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0626  1A family penicillin-binding protein  39.26 
 
 		 733 aa  355  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10684  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  38.8 
 
 		 640 aa  355  2e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0928  1A family penicillin-binding protein  38.64 
 
 		 784 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0889  penicillin-binding protein, 1A family  38.64 
 
 		 765 aa  354  4e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0883  1A family penicillin-binding protein  38.61 
 
 		 714 aa  354  4e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1323  penicillin binding protein  37.81 
 
 		 707 aa  352  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.295305  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0878  1A family penicillin-binding protein  37.07 
 
 		 764 aa  345  2e-93  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337969  hitchhiker  0.000893073 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  37.91 
 
 		 640 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  38.46 
 
 		 626 aa  342  2e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  35.73 
 
 		 811 aa  340  5.9999999999999996e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0118  1A family penicillin-binding protein  38.1 
 
 		 788 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  38.72 
 
 		 625 aa  339  9.999999999999999e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0894  penicillin-binding protein, 1A family  37.8 
 
 		 728 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2033  1A family penicillin-binding protein  37.43 
 
 		 776 aa  337  5e-91  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.431137  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1022  penicillin-binding protein, 1A family  37.66 
 
 		 736 aa  335  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  35.98 
 
 		 824 aa  335  2e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2628  penicillin-binding protein 1A  37.69 
 
 		 735 aa  335  3e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  35.98 
 
 		 824 aa  334  4e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  37.89 
 
 		 755 aa  333  6e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  39.96 
 
 		 712 aa  332  2e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  37.13 
 
 		 727 aa  330  5.0000000000000004e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  37.55 
 
 		 648 aa  325  3e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  37.23 
 
 		 654 aa  322  1.9999999999999998e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  37.14 
 
 		 761 aa  320  6e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  36.32 
 
 		 765 aa  319  2e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  38.61 
 
 		 646 aa  318  2e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4055  peptidoglycan glycosyltransferase  37.77 
 
 		 744 aa  314  2.9999999999999996e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  38.31 
 
 		 680 aa  311  4e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  36.4 
 
 		 641 aa  311  4e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>