More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3703 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_0580  penicillin-binding protein, 1A family  61.9 
 
 
739 aa  757    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4776  1A family penicillin-binding protein  59.82 
 
 
727 aa  780    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.119918  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0132  penicillin-binding protein 1A  59.82 
 
 
734 aa  776    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.675311  normal  0.447888 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  63.92 
 
 
728 aa  759    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0362  1A family penicillin-binding protein  64.96 
 
 
741 aa  764    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.244077 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7522  penicillin-binding protein, 1A family  59.97 
 
 
714 aa  787    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.276054  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5318  penicillin-binding protein, 1A family  59.79 
 
 
728 aa  785    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3046  1A family penicillin-binding protein  67.22 
 
 
720 aa  962    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.370823  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6778  1A family penicillin-binding protein  65.37 
 
 
714 aa  802    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395595  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0041  penicillin-binding protein 1A  59.03 
 
 
735 aa  779    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4417  penicillin-binding protein, 1A family  55.05 
 
 
779 aa  647    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.896917  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0453  penicillin-binding protein 1A  63.79 
 
 
757 aa  751    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.287636  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0124  penicillin-binding protein 1A  61.82 
 
 
720 aa  764    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.994879  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0227  penicillin-binding protein 1A  62.58 
 
 
732 aa  790    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.369543  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5243  penicillin-binding protein, 1A family  59.1 
 
 
727 aa  780    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.766198  normal  0.919451 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3703  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 
712 aa  1424    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.053736 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3986  1A family penicillin-binding protein  51.81 
 
 
723 aa  650    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7653  putative penicillin-binding protein pbpC/mrcB-like protein  64.48 
 
 
734 aa  798    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.278881 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0131  1A family penicillin-binding protein  48.79 
 
 
770 aa  635    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4097  penicillin-binding protein, 1A family  50.29 
 
 
776 aa  649    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0117  1A family penicillin-binding protein  51.64 
 
 
763 aa  625  1e-178  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0114  1A family penicillin-binding protein  51.8 
 
 
730 aa  626  1e-178  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.572692  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3388  1A family penicillin-binding protein  54.2 
 
 
750 aa  626  1e-178  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  49.76 
 
 
833 aa  599  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0008  1A family penicillin-binding protein  47.99 
 
 
775 aa  561  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000321042 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4205  1A family penicillin-binding protein  46.39 
 
 
654 aa  505  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.317935  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3393  penicillin-binding protein 1A  47.92 
 
 
651 aa  504  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1653  1A family penicillin-binding protein  43.5 
 
 
768 aa  478  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.64242  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1403  penicillin-binding protein 1A  44.71 
 
 
760 aa  468  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1150  penicillin-binding protein 1A  45.47 
 
 
759 aa  464  1e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0720  penicillin-binding protein, 1A family  41.63 
 
 
744 aa  463  1e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0942081  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3056  putative penicillin-binding protein  43.62 
 
 
759 aa  463  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1627  1A family penicillin-binding protein  43.56 
 
 
718 aa  462  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.216077 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0897  1A family penicillin-binding protein  45.82 
 
 
691 aa  460  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.376717 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1787  penicillin-binding protein 1A  43.31 
 
 
757 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.495648  normal  0.0540885 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2868  1A family penicillin-binding protein  46.26 
 
 
669 aa  461  9.999999999999999e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0010427  normal  0.721279 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1115  1A family penicillin-binding protein  43.11 
 
 
743 aa  457  1e-127  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.331133  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2073  penicillin-binding protein, 1A family  43.15 
 
 
758 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3506  penicillin-binding protein 1A  44.03 
 
 
769 aa  455  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.430284 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0883  1A family penicillin-binding protein  44.28 
 
 
714 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0864  penicillin-binding protein, 1A family  40.68 
 
 
760 aa  450  1e-125  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.930859 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1953  penicillin-binding protein 1A  43.53 
 
 
750 aa  452  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.330059 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1662  penicillin-binding protein, 1A family  41.73 
 
 
742 aa  449  1e-125  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.460487 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0583  1A family penicillin-binding protein  40.66 
 
 
724 aa  446  1.0000000000000001e-124  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0889  penicillin-binding protein, 1A family  42.05 
 
 
765 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.53881  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0928  1A family penicillin-binding protein  42.05 
 
 
784 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0583  1A family penicillin-binding protein  40.49 
 
 
718 aa  443  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.161794  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0506  penicillin-binding protein, 1A family  47.13 
 
 
796 aa  442  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396512  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0878  1A family penicillin-binding protein  39.69 
 
 
764 aa  442  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.337969  hitchhiker  0.000893073 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2677  1A family penicillin-binding protein  40.1 
 
 
724 aa  441  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.288371  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0677  penicillin-binding protein, 1A family  43.75 
 
 
815 aa  442  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.187464 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0916  1A family penicillin-binding protein  46.77 
 
 
656 aa  441  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.129187 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1323  penicillin binding protein  43.16 
 
 
707 aa  437  1e-121  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.295305  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1046  1A family penicillin-binding protein  47.42 
 
 
810 aa  432  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0719  penicillin-binding protein, 1A family  43.41 
 
 
830 aa  431  1e-119  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347949  normal  0.695169 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0706  1A family penicillin-binding protein  43.41 
 
 
830 aa  432  1e-119  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.247814 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3921  1A family penicillin-binding protein  42.86 
 
 
712 aa  429  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0187238 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3611  1A family penicillin-binding protein  46.7 
 
 
814 aa  423  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.246117  hitchhiker  0.00429634 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0626  1A family penicillin-binding protein  42.88 
 
 
733 aa  424  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.10684  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2817  1A family penicillin-binding protein  40.03 
 
 
709 aa  425  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515125  normal  0.127975 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0203  1A family penicillin-binding protein  43.37 
 
 
658 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0887  glycosyl transferase family protein  38.16 
 
 
831 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.656493  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2628  penicillin-binding protein 1A  39.01 
 
 
735 aa  416  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2548  1A family penicillin-binding protein  38.16 
 
 
788 aa  415  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.340929  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0767  penicillin-binding protein, 1A family  43.54 
 
 
763 aa  411  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.210188  normal  0.891602 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6858  penicillin-binding protein, 1A family  43.89 
 
 
626 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2976  penicillin-binding protein 1A  40.75 
 
 
732 aa  405  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.0468757 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  39.39 
 
 
648 aa  402  9.999999999999999e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0142  penicillin-binding protein  38.54 
 
 
729 aa  398  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1078  1A family penicillin-binding protein  42.91 
 
 
727 aa  397  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.319269  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0894  penicillin-binding protein, 1A family  42.08 
 
 
728 aa  397  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1022  penicillin-binding protein, 1A family  42.1 
 
 
736 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.53642  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2520  penicillin-binding protein 1A  43.71 
 
 
750 aa  395  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  38.7 
 
 
755 aa  390  1e-107  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  39.66 
 
 
776 aa  391  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3329  penicillin-binding protein 1A  38.14 
 
 
712 aa  391  1e-107  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0118  1A family penicillin-binding protein  35.94 
 
 
788 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  40.21 
 
 
712 aa  384  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  42.17 
 
 
824 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  40.27 
 
 
811 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  42.17 
 
 
824 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1453  penicillin-binding protein 1A  42.58 
 
 
699 aa  378  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.8478  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  38.92 
 
 
626 aa  377  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  41.5 
 
 
751 aa  373  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1701  1A family penicillin-binding protein  42.62 
 
 
626 aa  371  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41226  normal  0.0892672 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2033  1A family penicillin-binding protein  39.52 
 
 
776 aa  370  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.431137  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  40.43 
 
 
618 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  40.04 
 
 
661 aa  365  2e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4055  peptidoglycan glycosyltransferase  36.9 
 
 
744 aa  363  6e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  39.21 
 
 
765 aa  362  1e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  38.83 
 
 
654 aa  355  2e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  40.57 
 
 
761 aa  354  2.9999999999999997e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  38.2 
 
 
648 aa  352  8.999999999999999e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  37.9 
 
 
683 aa  350  5e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  39.78 
 
 
646 aa  348  2e-94  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  39.17 
 
 
625 aa  347  5e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  38.45 
 
 
744 aa  345  1e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3011  FHA modulated glycosyl transferase/transpeptidase  37.97 
 
 
750 aa  346  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  34.2 
 
 
676 aa  345  2e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  37.59 
 
 
680 aa  344  4e-93  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>